More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_30113 on replicon NC_011688
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011688  PHATRDRAFT_30113  lipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 543 aa  1109    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15203  predicted protein  61.67 
 
 		 462 aa  585  1e-166  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000969694  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3920  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.33 
 
 		 476 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3968  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.12 
 
 		 476 aa  552  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159256 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1927  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.04 
 
 		 475 aa  537  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5041  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.75 
 
 		 477 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1198  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.51 
 
 		 479 aa  530  1e-149  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.217034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3171  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.53 
 
 		 476 aa  530  1e-149  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.138028 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0247  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.04 
 
 		 478 aa  525  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0691299 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0099  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.81 
 
 		 476 aa  522  1e-147  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14971  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.43 
 
 		 479 aa  518  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.223464  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1394  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.43 
 
 		 479 aa  517  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14831  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.01 
 
 		 479 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.509805  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14591  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.39 
 
 		 479 aa  514  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.024787  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17171  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.82 
 
 		 480 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0864  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.82 
 
 		 480 aa  511  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.192973  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1530  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.85 
 
 		 480 aa  505  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.411134  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0869  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.43 
 
 		 480 aa  502  1e-141  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.238333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19781  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.01 
 
 		 489 aa  502  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0364363 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13451  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.28 
 
 		 481 aa  497  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0908915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2045  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.38 
 
 		 474 aa  268  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0329202  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1296  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.07 
 
 		 463 aa  266  5.999999999999999e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2501  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.04 
 
 		 478 aa  265  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2048  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.55 
 
 		 474 aa  264  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.47477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.26 
 
 		 470 aa  261  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.26 
 
 		 470 aa  261  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.26 
 
 		 470 aa  261  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.26 
 
 		 470 aa  261  3e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.26 
 
 		 470 aa  261  3e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.26 
 
 		 470 aa  261  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.26 
 
 		 470 aa  259  6e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.26 
 
 		 470 aa  259  6e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.26 
 
 		 470 aa  259  6e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1616  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.23 
 
 		 478 aa  259  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3772  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1192  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.45 
 
 		 478 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.43 
 
 		 467 aa  258  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1099  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.25 
 
 		 478 aa  257  4e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.26 
 
 		 470 aa  256  6e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3687  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.47 
 
 		 478 aa  256  6e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43970  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.47 
 
 		 478 aa  256  6e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0508378  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1271  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.32 
 
 		 478 aa  256  7e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.547338 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.24 
 
 		 470 aa  256  7e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.28 
 
 		 467 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.37 
 
 		 458 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.58 
 
 		 468 aa  256  1.0000000000000001e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.83 
 
 		 467 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.07 
 
 		 467 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4187  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.82 
 
 		 478 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.48 
 
 		 463 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3758  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.82 
 
 		 478 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3510  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.61 
 
 		 478 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0716172  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1543  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.32 
 
 		 470 aa  253  7e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.593732  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29750  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.43 
 
 		 477 aa  252  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.913625  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.03 
 
 		 462 aa  252  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.67 
 
 		 476 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.69 
 
 		 469 aa  251  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1667  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.4 
 
 		 478 aa  252  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.74 
 
 		 462 aa  250  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.17 
 
 		 459 aa  250  6e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.55 
 
 		 466 aa  250  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.62 
 
 		 467 aa  249  8e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0962  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.53 
 
 		 462 aa  249  9e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2168  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.76 
 
 		 466 aa  248  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.46 
 
 		 476 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0837  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.61 
 
 		 462 aa  248  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0629808 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.46 
 
 		 476 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.12 
 
 		 467 aa  247  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.74 
 
 		 581 aa  246  6e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.5 
 
 		 475 aa  246  6e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5671  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.09 
 
 		 466 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4651  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.85 
 
 		 476 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183592  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.46 
 
 		 476 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1719  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.67 
 
 		 476 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2542  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.19 
 
 		 474 aa  246  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.167426  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.26 
 
 		 476 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.26 
 
 		 476 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.26 
 
 		 476 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.4 
 
 		 467 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2506  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.1 
 
 		 470 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.05 
 
 		 476 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.65 
 
 		 470 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.96 
 
 		 467 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.85 
 
 		 476 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1496  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.26 
 
 		 476 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  33.54 
 
 		 468 aa  244  3e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.64 
 
 		 476 aa  244  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.11 
 
 		 465 aa  244  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2886  dihydrolipoyl dehydrogenase  37.71 
 
 		 464 aa  244  3.9999999999999997e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0945112  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3309  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.08 
 
 		 462 aa  243  5e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.900179  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0180  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.36 
 
 		 467 aa  243  6e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.47 
 
 		 468 aa  243  7e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.43 
 
 		 465 aa  242  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0183  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.36 
 
 		 467 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1432  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.64 
 
 		 476 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21637  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26432  dihydrolipoyl dehydrogenase  35.6 
 
 		 500 aa  242  1e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1642  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.64 
 
 		 476 aa  242  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370947  normal  0.099089 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.37 
 
 		 458 aa  242  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.23 
 
 		 476 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975022  hitchhiker  0.00623097 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2011  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.99 
 
 		 478 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.81 
 
 		 463 aa  241  2.9999999999999997e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>