More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_5041 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3920  dihydrolipoamide dehydrogenase  76.37 
 
 
476 aa  731    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1927  dihydrolipoamide dehydrogenase  79.1 
 
 
475 aa  749    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3968  dihydrolipoamide dehydrogenase  75.95 
 
 
476 aa  729    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159256 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1198  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.2 
 
 
479 aa  681    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.217034  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5041  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
477 aa  960    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0099  dihydrolipoamide dehydrogenase  75.42 
 
 
476 aa  717    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3171  dihydrolipoamide dehydrogenase  76.97 
 
 
476 aa  731    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.138028 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0247  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.63 
 
 
478 aa  713    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0691299 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19781  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.77 
 
 
489 aa  629  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0364363 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0864  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.68 
 
 
480 aa  624  1e-178  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.192973  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17171  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.68 
 
 
480 aa  621  1e-177  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0869  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.79 
 
 
480 aa  623  1e-177  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.238333  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1530  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.37 
 
 
480 aa  619  1e-176  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.411134  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13451  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.5 
 
 
481 aa  609  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0908915  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1394  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.66 
 
 
479 aa  598  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14591  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.12 
 
 
479 aa  600  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.024787  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14971  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.08 
 
 
479 aa  600  1e-170  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.223464  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14831  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.87 
 
 
479 aa  597  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.509805  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30113  lipoamide dehydrogenase  58.75 
 
 
543 aa  556  1e-157  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15203  predicted protein  61.44 
 
 
462 aa  540  9.999999999999999e-153  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000969694  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.95 
 
 
463 aa  310  5e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.72 
 
 
458 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.09 
 
 
465 aa  302  8.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1543  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.67 
 
 
470 aa  291  1e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.593732  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1099  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.01 
 
 
478 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.48 
 
 
458 aa  290  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.08 
 
 
467 aa  289  8e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1271  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.21 
 
 
478 aa  289  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.547338 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1192  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.8 
 
 
478 aa  288  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523433  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3710  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.23 
 
 
467 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2045  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.74 
 
 
474 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0329202  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.37 
 
 
476 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.66 
 
 
467 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1532  dihydrolipoamide dehydrogenase  40 
 
 
460 aa  284  3.0000000000000004e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.631051 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.4 
 
 
468 aa  284  3.0000000000000004e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.45 
 
 
467 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.16 
 
 
476 aa  282  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.16 
 
 
476 aa  282  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2048  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.85 
 
 
474 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.47477  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.16 
 
 
476 aa  282  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3510  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.42 
 
 
478 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0716172  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4187  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.63 
 
 
478 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3758  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.63 
 
 
478 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.53 
 
 
476 aa  279  8e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1667  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.21 
 
 
478 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164593  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.95 
 
 
476 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1719  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.74 
 
 
476 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.95 
 
 
476 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1496  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.95 
 
 
476 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.95 
 
 
476 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.81 
 
 
465 aa  277  3e-73  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.98 
 
 
462 aa  276  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.74 
 
 
476 aa  276  5e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6035  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.26 
 
 
466 aa  276  6e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0837  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.97 
 
 
462 aa  276  8e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0629808 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.27 
 
 
466 aa  276  8e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4068  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.76 
 
 
473 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3906  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.76 
 
 
473 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3915  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.76 
 
 
473 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.616169  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.84 
 
 
462 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4293  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.76 
 
 
473 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00988319  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4385  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.76 
 
 
473 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.53 
 
 
476 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29750  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.78 
 
 
477 aa  275  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.913625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4183  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.76 
 
 
473 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000040405 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2813  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.05 
 
 
466 aa  275  1.0000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1616  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.21 
 
 
478 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3772  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.43 
 
 
473 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0027  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.38 
 
 
468 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.98 
 
 
475 aa  274  3e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1432  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.33 
 
 
476 aa  274  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21637  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4235  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.55 
 
 
473 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4004  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.49 
 
 
473 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0962  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.04 
 
 
462 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1642  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.12 
 
 
476 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370947  normal  0.099089 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4273  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.55 
 
 
473 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2011  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.27 
 
 
478 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0961  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.34 
 
 
473 aa  273  6e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4996  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.03 
 
 
462 aa  272  7e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2201  2-oxoglutarate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  36.8 
 
 
478 aa  272  9e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00788973  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2306  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.33 
 
 
473 aa  272  9e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5671  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.97 
 
 
466 aa  272  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.49 
 
 
473 aa  272  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.36 
 
 
463 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.37 
 
 
467 aa  271  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03103  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.01 
 
 
607 aa  271  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.7 
 
 
476 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975022  hitchhiker  0.00623097 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4651  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.36 
 
 
476 aa  270  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183592  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2501  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.27 
 
 
478 aa  270  4e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.97 
 
 
469 aa  269  7e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3687  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.49 
 
 
478 aa  269  8e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43970  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.49 
 
 
478 aa  269  8e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0508378  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.7 
 
 
476 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1510  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.7 
 
 
476 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.647996  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2913  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.2 
 
 
479 aa  268  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00695223  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2012  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.58 
 
 
478 aa  268  1e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.723909  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  34 
 
 
481 aa  268  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.99 
 
 
463 aa  268  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2549  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.7 
 
 
471 aa  268  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3520  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.27 
 
 
602 aa  267  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.501053  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>