More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1198 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3968  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.99 
 
 		 476 aa  662    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159256 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14831  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.92 
 
 		 479 aa  652    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.509805  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0864  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.83 
 
 		 480 aa  698    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.192973  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3920  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.78 
 
 		 476 aa  662    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1927  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.2 
 
 		 475 aa  675    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0099  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.67 
 
 		 476 aa  651    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1530  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.43 
 
 		 480 aa  718    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.411134  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0869  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.12 
 
 		 480 aa  724    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.238333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1394  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.13 
 
 		 479 aa  656    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1198  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 479 aa  966    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.217034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5041  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.2 
 
 		 477 aa  665    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14591  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.26 
 
 		 479 aa  656    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.024787  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0247  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.53 
 
 		 478 aa  662    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0691299 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17171  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.83 
 
 		 480 aa  696    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13451  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.37 
 
 		 481 aa  678    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0908915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14971  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.34 
 
 		 479 aa  656    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.223464  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3171  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.4 
 
 		 476 aa  640    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.138028 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19781  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.85 
 
 		 489 aa  715    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0364363 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30113  lipoamide dehydrogenase  55.51 
 
 		 543 aa  530  1e-149  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15203  predicted protein  56.46 
 
 		 462 aa  509  1e-143  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000969694  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.15 
 
 		 463 aa  307  3e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.9 
 
 		 475 aa  304  2.0000000000000002e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.36 
 
 		 465 aa  301  1e-80  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.83 
 
 		 458 aa  300  5e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.1 
 
 		 465 aa  295  1e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1543  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.1 
 
 		 470 aa  291  2e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.593732  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.82 
 
 		 468 aa  290  3e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.17 
 
 		 467 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.16 
 
 		 473 aa  289  7e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.15 
 
 		 473 aa  288  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.74 
 
 		 467 aa  287  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.12 
 
 		 466 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.53 
 
 		 467 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3758  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.14 
 
 		 478 aa  286  8e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1878  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.48 
 
 		 466 aa  286  8e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.932595  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.1 
 
 		 465 aa  285  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1508  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.97 
 
 		 480 aa  285  1.0000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.468663 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2201  2-oxoglutarate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  37.87 
 
 		 478 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00788973  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2011  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.87 
 
 		 478 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2766  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.24 
 
 		 473 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.36 
 
 		 470 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3510  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.71 
 
 		 478 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0716172  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4187  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.71 
 
 		 478 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.76 
 
 		 470 aa  282  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.19 
 
 		 468 aa  282  1e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.69 
 
 		 468 aa  281  1e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1667  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.5 
 
 		 478 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3205  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.03 
 
 		 473 aa  280  5e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169727  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.56 
 
 		 470 aa  280  6e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.18 
 
 		 465 aa  280  6e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2807  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.45 
 
 		 473 aa  279  7e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2813  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.43 
 
 		 466 aa  279  8e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2755  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.24 
 
 		 466 aa  278  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0982206  hitchhiker  0.000532855 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2913  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.67 
 
 		 479 aa  278  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00695223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.48 
 
 		 472 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2168  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.21 
 
 		 466 aa  279  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3360  dihydrolipoyl dehydrogenanse  37.11 
 
 		 466 aa  278  1e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0306833 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1616  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.24 
 
 		 478 aa  278  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3772  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0271  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.02 
 
 		 593 aa  278  2e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.146735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6035  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.76 
 
 		 466 aa  277  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2501  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.86 
 
 		 478 aa  276  6e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.73 
 
 		 467 aa  276  6e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.7 
 
 		 465 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0027  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.36 
 
 		 468 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.76 
 
 		 470 aa  274  3e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1104  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.29 
 
 		 466 aa  274  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550844  normal  0.0253682 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.61 
 
 		 469 aa  274  3e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3687  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.79 
 
 		 478 aa  274  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.76 
 
 		 470 aa  274  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43970  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.79 
 
 		 478 aa  274  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0508378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.76 
 
 		 470 aa  274  3e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.12 
 
 		 462 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.76 
 
 		 470 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.76 
 
 		 470 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0962  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.12 
 
 		 462 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.76 
 
 		 470 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2549  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.63 
 
 		 471 aa  273  5.000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.65 
 
 		 466 aa  273  7e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.26 
 
 		 462 aa  273  7e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.02 
 
 		 479 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0279881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63850  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.84 
 
 		 467 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.32 
 
 		 462 aa  272  9e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.55 
 
 		 470 aa  272  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.55 
 
 		 470 aa  272  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.8 
 
 		 476 aa  271  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.55 
 
 		 470 aa  272  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1099  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.65 
 
 		 478 aa  272  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.02 
 
 		 467 aa  271  2e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5274  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.99 
 
 		 466 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.75 
 
 		 465 aa  271  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.5 
 
 		 465 aa  271  2e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.62 
 
 		 463 aa  271  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5366  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.99 
 
 		 466 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.997164 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1192  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.44 
 
 		 478 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.29 
 
 		 467 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.93 
 
 		 476 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1813  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.85 
 
 		 477 aa  270  4e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0853723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.23 
 
 		 471 aa  270  4e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5671  dihydrolipoamide dehydrogenase  36 
 
 		 466 aa  270  5e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.55 
 
 		 470 aa  270  5e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>