More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_19781 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_19781  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
489 aa  988    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0364363 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0864  dihydrolipoamide dehydrogenase  79.79 
 
 
480 aa  808    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.192973  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1530  dihydrolipoamide dehydrogenase  87.45 
 
 
480 aa  867    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.411134  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0869  dihydrolipoamide dehydrogenase  87.89 
 
 
480 aa  870    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.238333  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1394  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.43 
 
 
479 aa  759    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1198  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.91 
 
 
479 aa  717    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.217034  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14831  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.85 
 
 
479 aa  761    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.509805  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13451  dihydrolipoamide dehydrogenase  82.33 
 
 
481 aa  837    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0908915  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17171  dihydrolipoamide dehydrogenase  79.58 
 
 
480 aa  807    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14591  dihydrolipoamide dehydrogenase  74.69 
 
 
479 aa  768    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.024787  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14971  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.01 
 
 
479 aa  757    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.223464  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5041  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.77 
 
 
477 aa  614  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1927  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.98 
 
 
475 aa  605  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3920  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.18 
 
 
476 aa  598  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3968  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.39 
 
 
476 aa  599  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159256 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0247  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.05 
 
 
478 aa  580  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0691299 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0099  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.17 
 
 
476 aa  581  1e-164  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3171  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.43 
 
 
476 aa  577  1.0000000000000001e-163  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.138028 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30113  lipoamide dehydrogenase  53.01 
 
 
543 aa  503  1e-141  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15203  predicted protein  53.54 
 
 
462 aa  486  1e-136  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000969694  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.97 
 
 
463 aa  282  1e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1543  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.05 
 
 
470 aa  281  2e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.593732  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1045  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.34 
 
 
469 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.94 
 
 
465 aa  274  3e-72  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.55 
 
 
458 aa  272  9e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.58 
 
 
475 aa  269  8e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.76 
 
 
585 aa  266  5e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.48 
 
 
465 aa  266  5e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.42 
 
 
466 aa  266  7e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.53 
 
 
467 aa  264  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.76 
 
 
458 aa  264  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.33 
 
 
473 aa  264  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.32 
 
 
467 aa  263  4e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.91 
 
 
465 aa  263  4.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.11 
 
 
467 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.98 
 
 
470 aa  262  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.98 
 
 
470 aa  262  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.98 
 
 
470 aa  261  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.98 
 
 
470 aa  262  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3520  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.46 
 
 
602 aa  262  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.501053  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.98 
 
 
470 aa  261  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0271  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.29 
 
 
593 aa  261  1e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.146735  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.98 
 
 
470 aa  261  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.42 
 
 
492 aa  261  2e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.98 
 
 
470 aa  260  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.98 
 
 
470 aa  260  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.77 
 
 
465 aa  261  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.98 
 
 
470 aa  260  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.18 
 
 
463 aa  260  4e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.15 
 
 
476 aa  259  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4651  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.01 
 
 
476 aa  259  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183592  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.87 
 
 
465 aa  259  7e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.33 
 
 
470 aa  259  8e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.56 
 
 
459 aa  259  9e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.15 
 
 
476 aa  259  9e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.15 
 
 
476 aa  259  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.97 
 
 
472 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.03 
 
 
465 aa  258  1e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.01 
 
 
476 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63850  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.85 
 
 
467 aa  259  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.15 
 
 
476 aa  259  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.04 
 
 
562 aa  258  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.94 
 
 
476 aa  258  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2755  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.23 
 
 
466 aa  257  3e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0982206  hitchhiker  0.000532855 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1878  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.31 
 
 
466 aa  257  4e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.932595  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.33 
 
 
470 aa  256  5e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1104  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.5 
 
 
466 aa  256  6e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550844  normal  0.0253682 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.91 
 
 
462 aa  256  7e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.76 
 
 
468 aa  256  7e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.55 
 
 
470 aa  256  9e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.48 
 
 
470 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.94 
 
 
476 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.94 
 
 
476 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.94 
 
 
476 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1720  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.4 
 
 
465 aa  255  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.160596  normal  0.364813 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1496  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.94 
 
 
476 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1432  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.59 
 
 
476 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21637  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0142  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.17 
 
 
475 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.262371  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2913  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.23 
 
 
479 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00695223  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2168  dihydrolipoamide dehydrogenase  37 
 
 
466 aa  254  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.4 
 
 
463 aa  254  3e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.64 
 
 
462 aa  254  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0962  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.64 
 
 
462 aa  254  3e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1096  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.12 
 
 
464 aa  254  3e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  37 
 
 
463 aa  254  3e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5901  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.52 
 
 
478 aa  254  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.71 
 
 
467 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2549  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.17 
 
 
471 aa  253  5.000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1614  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.91 
 
 
464 aa  253  6e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0956162 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2506  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.31 
 
 
470 aa  253  7e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.38 
 
 
476 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975022  hitchhiker  0.00623097 
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.6 
 
 
467 aa  252  9.000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.15 
 
 
476 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.56 
 
 
459 aa  252  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.341599  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2968  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.91 
 
 
468 aa  252  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462781  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.12 
 
 
470 aa  252  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.48 
 
 
468 aa  252  1e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2936  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.86 
 
 
468 aa  252  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0027  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.97 
 
 
468 aa  252  1e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.36 
 
 
484 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>