More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0903 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0903  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
462 aa  943    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2696  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.48 
 
 
476 aa  388  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.303551  normal  0.202311 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1783  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.52 
 
 
475 aa  385  1e-106  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1824  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.55 
 
 
469 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.372731  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0496  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  42.48 
 
 
455 aa  352  7e-96  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1256  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.76 
 
 
487 aa  322  9.999999999999999e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3630  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  38.25 
 
 
536 aa  322  9.999999999999999e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.353308  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2738  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  38.24 
 
 
488 aa  322  9.999999999999999e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1804  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  37.22 
 
 
528 aa  320  3.9999999999999996e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0256  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  37.84 
 
 
484 aa  319  5e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3488  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.92 
 
 
478 aa  293  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.531012  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5390  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  37.95 
 
 
465 aa  291  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.685666 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0842  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.89 
 
 
457 aa  290  3e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.754028  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10080  mycothione reductase  37.2 
 
 
466 aa  283  7.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0975361  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2195  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.98 
 
 
469 aa  281  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000774241  hitchhiker  0.00141169 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5878  mycothione reductase  36.97 
 
 
460 aa  275  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05900  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.61 
 
 
477 aa  271  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.257436 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2130  mycothione reductase  36.6 
 
 
464 aa  270  5.9999999999999995e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.503615  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1696  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  35.23 
 
 
469 aa  269  7e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142602  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12870  mycothione reductase  36.67 
 
 
459 aa  268  1e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.135712  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4636  mercuric reductase  35.56 
 
 
458 aa  265  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.295825 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1509  mercuric reductase  34.13 
 
 
461 aa  263  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344309  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.4 
 
 
459 aa  263  6e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2298  mycothione reductase  35.62 
 
 
469 aa  262  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.270268 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09170  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  34.53 
 
 
475 aa  259  6e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283418  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2050  mycothione reductase  36.15 
 
 
470 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4997  mercuric reductase  35.26 
 
 
459 aa  254  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2113  mycothione reductase  36.15 
 
 
470 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.207955  normal  0.0141084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2067  mycothione reductase  36.15 
 
 
470 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.159989  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1643  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.84 
 
 
474 aa  253  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000472029 
 
 
-
 
NC_003296  RS02078  mercuric reductase  34.62 
 
 
459 aa  251  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4961  mercuric reductase  33.12 
 
 
460 aa  252  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  34.48 
 
 
460 aa  249  9e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4011  mercuric reductase  34.35 
 
 
459 aa  249  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0854657  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3897  mercuric reductase  34.35 
 
 
459 aa  249  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.423332 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4054  mycothione reductase  35.12 
 
 
470 aa  249  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.703366  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0385  mercuric reductase  33.48 
 
 
459 aa  243  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2206  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.98 
 
 
459 aa  243  6e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.041685  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5056  mercuric reductase  34.05 
 
 
459 aa  243  7e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135768 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.98 
 
 
475 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.84 
 
 
475 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4940  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.03 
 
 
472 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.92 
 
 
456 aa  239  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3872  mercuric reductase  34.46 
 
 
459 aa  239  9e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.429317 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.69 
 
 
473 aa  238  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0283  mercuric reductase  34.26 
 
 
590 aa  237  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0194  mercuric reductase  34.26 
 
 
459 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1652  mercuric reductase  34.26 
 
 
459 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3551  mercuric reductase  34.53 
 
 
458 aa  236  6e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  normal  0.343975 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  34.9 
 
 
548 aa  236  6e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5390  mercuric reductase  34.53 
 
 
458 aa  236  8e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3648  mercuric reductase  34.46 
 
 
459 aa  236  9e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.948829 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4715  mercuric reductase  34.46 
 
 
459 aa  236  9e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2463  mercuric reductase  34.65 
 
 
459 aa  234  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.736078 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0840  mercuric reductase  33.26 
 
 
459 aa  233  5e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.909893 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08580  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  35.12 
 
 
467 aa  232  1e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.745964 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  35.21 
 
 
546 aa  232  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3468  mercuric reductase  31.69 
 
 
457 aa  231  3e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211907  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5924  mercuric reductase  34.06 
 
 
461 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184883  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3669  mercuric reductase  34.19 
 
 
459 aa  231  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1668  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.48 
 
 
459 aa  229  6e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0297676  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  35.07 
 
 
550 aa  229  9e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3154  mercuric reductase  32.4 
 
 
459 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3204  mercuric reductase  32.4 
 
 
459 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3142  mercuric reductase  32.4 
 
 
459 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1296  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.68 
 
 
463 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3059  mercuric reductase  32.55 
 
 
460 aa  226  6e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0658861 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5011  mercuric reductase  33.48 
 
 
459 aa  226  7e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1035  normal  0.205591 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  32.79 
 
 
546 aa  226  8e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  31.92 
 
 
546 aa  226  1e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  31.55 
 
 
546 aa  225  2e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0265  mycothione reductase  34.95 
 
 
468 aa  223  4e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6744  mercuric reductase  31.02 
 
 
453 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.520469  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0992  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.74 
 
 
468 aa  223  7e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2876  mercuric reductase  32.4 
 
 
458 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00432777 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3049  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.64 
 
 
472 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0397378  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.85 
 
 
712 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13800  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  32.99 
 
 
487 aa  221  1.9999999999999999e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.162356  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.75 
 
 
465 aa  220  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  32.51 
 
 
713 aa  220  3.9999999999999997e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4192  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.08 
 
 
481 aa  218  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1439  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.62 
 
 
469 aa  218  1e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0654  mercuric reductase  32.55 
 
 
468 aa  218  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.87809e-24 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1813  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.81 
 
 
477 aa  218  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0853723  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0177  mercuric reductase MerA  32.39 
 
 
469 aa  217  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1504  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.33 
 
 
462 aa  216  5e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.515089  normal  0.0466141 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1118  mercuric reductase  33.76 
 
 
516 aa  216  5e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.583122  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2088  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.64 
 
 
484 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1741  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.05 
 
 
459 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0325  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  30.74 
 
 
457 aa  215  9.999999999999999e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0314  hypothetical protein  30.72 
 
 
464 aa  215  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.96 
 
 
458 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.76 
 
 
465 aa  214  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5831  mercuric reductase  31.45 
 
 
455 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194109  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.47 
 
 
465 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0640  mercuric reductase  31.91 
 
 
468 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0298  hypothetical protein  30.5 
 
 
464 aa  213  4.9999999999999996e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0138  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.06 
 
 
491 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1463  mercuric reductase, putative  31.68 
 
 
486 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0144411  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1033  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  31.12 
 
 
584 aa  213  7e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.394953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>