More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3006 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA3362  glutathione-disulfide reductase  77.38 
 
 
453 aa  704    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3030  glutathione-disulfide reductase  77.38 
 
 
453 aa  704    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.944241  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0498  glutathione-disulfide reductase  77.38 
 
 
453 aa  704    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6352  NADPH-glutathione reductase  94.03 
 
 
452 aa  851    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2063  glutathione-disulfide reductase  77.38 
 
 
453 aa  704    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0272  glutathione-disulfide reductase  76.72 
 
 
453 aa  694    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0317  glutathione-disulfide reductase  77.38 
 
 
453 aa  704    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3006  glutathione-disulfide reductase  100 
 
 
451 aa  902    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0303  glutathione-disulfide reductase  77.38 
 
 
453 aa  704    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2915  glutathione-disulfide reductase  91.57 
 
 
451 aa  830    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2392  glutathione reductase  100 
 
 
451 aa  902    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3025  glutathione-disulfide reductase  99.11 
 
 
451 aa  893    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3000  glutathione-disulfide reductase  88.91 
 
 
451 aa  806    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.637847  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2222  glutathione-disulfide reductase  77.38 
 
 
453 aa  704    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.363669  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3050  glutathione-disulfide reductase  91.57 
 
 
451 aa  833    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1608  glutathione reductase  55.13 
 
 
452 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128494  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1095  glutathione-disulfide reductase  55.36 
 
 
460 aa  506  9.999999999999999e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.223789  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1223  glutathione reductase  57.05 
 
 
460 aa  484  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1485  NADPH-glutathione reductase  55.83 
 
 
449 aa  479  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4955  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  55.36 
 
 
452 aa  480  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201124  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2244  glutathione reductase  51.75 
 
 
458 aa  474  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2351  glutathione reductase  54.1 
 
 
452 aa  474  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150308  normal  0.0125633 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0682  NADPH-glutathione reductase  53.54 
 
 
459 aa  473  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0286379  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0643  NADPH-glutathione reductase  54.29 
 
 
459 aa  473  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1482  glutathione reductase  54.75 
 
 
461 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.327802  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3485  NADPH-glutathione reductase  56 
 
 
461 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.749861  normal  0.666668 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4254  glutathione reductase  52.01 
 
 
466 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3544  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  54.65 
 
 
455 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5726  glutathione-disulfide reductase  52.57 
 
 
451 aa  466  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1359  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  53.23 
 
 
453 aa  463  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.485419  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1851  glutathione reductase  51.89 
 
 
449 aa  464  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.893411 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3544  glutathione-disulfide reductase  51.32 
 
 
464 aa  456  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.562382  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0122  glutathione-disulfide reductase  52.99 
 
 
474 aa  456  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3112  glutathione reductase  54.81 
 
 
452 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.091737  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2928  glutathione reductase  53.33 
 
 
452 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00793619  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3384  glutathione reductase  52.54 
 
 
461 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0477625 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2078  glutathione reductase  55.29 
 
 
461 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.16044 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2196  glutathione-disulfide reductase  51.76 
 
 
461 aa  448  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25010  glutathione reductase  53.78 
 
 
452 aa  446  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3819  glutathione reductase  53.91 
 
 
451 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218299  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2094  glutathione reductase  50.45 
 
 
464 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1012  glutathione reductase  50 
 
 
464 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.853309  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3535  glutathione reductase  53.91 
 
 
451 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0669246 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0978  glutathione reductase  50 
 
 
464 aa  445  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200707  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2057  glutathione reductase  52.78 
 
 
461 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1950  glutathione reductase  54.36 
 
 
451 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.447652  normal  0.37845 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4666  glutathione-disulfide reductase  51.77 
 
 
466 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4780  glutathione-disulfide reductase  52.77 
 
 
466 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325962  normal  0.417103 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0973  NADPH-glutathione reductase  50.56 
 
 
462 aa  447  1.0000000000000001e-124  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116342  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3188  glutathione reductase  53.47 
 
 
451 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2696  glutathione-disulfide reductase  52.57 
 
 
460 aa  444  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719185  normal  0.0349203 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2363  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  50.33 
 
 
457 aa  444  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.651152  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3263  glutathione reductase  52.8 
 
 
451 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2124  NADPH-glutathione reductase  51.79 
 
 
459 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.575049  normal  0.929555 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2979  glutathione reductase  54 
 
 
452 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0361278  normal  0.327486 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1216  glutathione reductase  49.78 
 
 
448 aa  440  9.999999999999999e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.286586  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38330  glutathione reductase  52.8 
 
 
451 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0328915 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0881  glutathione-disulfide reductase  51.55 
 
 
470 aa  436  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.449296  normal  0.121667 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1461  glutathione reductase  51.56 
 
 
460 aa  434  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0434  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  51.85 
 
 
466 aa  430  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.531083  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0884  glutathione-disulfide reductase  49.89 
 
 
452 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.508454 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0414  glutathione reductase  47.67 
 
 
450 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.263005  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0358  NADPH-glutathione reductase  49.67 
 
 
452 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3289  glutathione reductase  48.25 
 
 
459 aa  421  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1810  NADPH-glutathione reductase  48.33 
 
 
453 aa  424  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.251452  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0404  glutathione reductase  47.67 
 
 
450 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2002  glutathione-disulfide reductase  49.45 
 
 
452 aa  423  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24082  glutathione reductase  48.27 
 
 
519 aa  420  1e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4332  glutathione reductase  47.02 
 
 
451 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2301  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  50.56 
 
 
466 aa  418  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0108496  hitchhiker  0.00487639 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3039  glutathione-disulfide reductase  47.14 
 
 
450 aa  421  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2576  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  50.34 
 
 
461 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.213625 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2257  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  50.56 
 
 
466 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0633588  normal  0.450823 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0842  glutathione reductase  48.55 
 
 
446 aa  416  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.118007 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2085  glutathione reductase  48.88 
 
 
462 aa  415  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3224  glutathione-disulfide reductase  49.66 
 
 
455 aa  414  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.354787  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1875  NADPH-glutathione reductase  52.23 
 
 
454 aa  413  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105853  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4747  glutathione reductase  47.22 
 
 
447 aa  413  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2009  glutathione reductase  49.33 
 
 
461 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1981  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  51.12 
 
 
461 aa  410  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1957  NADPH-glutathione reductase  48.22 
 
 
451 aa  411  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.168279 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0604  glutathione reductase  47.56 
 
 
461 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.633864  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2228  glutathione reductase  49.11 
 
 
461 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.941122  normal  0.773983 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2737  glutathione reductase  46.36 
 
 
483 aa  404  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.482914  normal  0.0373517 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2722  NADPH-glutathione reductase  48.65 
 
 
448 aa  402  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.256149  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1571  glutathione reductase  48.44 
 
 
463 aa  400  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.483199  normal  0.747799 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3669  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  47.45 
 
 
466 aa  389  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369147  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3174  NADPH-glutathione reductase  43.54 
 
 
484 aa  389  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2516  glutathione-disulfide reductase  45.95 
 
 
446 aa  384  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2534  NADPH-glutathione reductase  46.55 
 
 
451 aa  377  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.23107 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0127  glutathione-disulfide reductase  42.32 
 
 
448 aa  352  1e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  39.69 
 
 
457 aa  349  5e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0140  glutathione reductase  38.77 
 
 
456 aa  342  8e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3543  glutathione reductase  39.6 
 
 
451 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3913  glutathione reductase  41.36 
 
 
450 aa  327  3e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01560  glutathione-disulfide reductase, putative  40.51 
 
 
479 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0216  glutathione reductase  40.42 
 
 
450 aa  326  5e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.96555 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3700  glutathione reductase  40.42 
 
 
450 aa  326  5e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3789  glutathione reductase  40.42 
 
 
450 aa  326  5e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.459077 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0215  glutathione-disulfide reductase  40.19 
 
 
450 aa  325  7e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>