More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0304 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0304  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  100 
 
 
474 aa  959    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0335  putative mercuric reductase MerA  56.63 
 
 
470 aa  505  9.999999999999999e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0257756  normal  0.865003 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0352  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  54.95 
 
 
475 aa  499  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0645  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  57.63 
 
 
472 aa  495  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0072  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  55.27 
 
 
470 aa  482  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0315  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  52.75 
 
 
471 aa  481  1e-135  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  50.78 
 
 
714 aa  481  1e-134  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  49.89 
 
 
714 aa  476  1e-133  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1057  putative mercuric reductase protein  53.19 
 
 
470 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.180423  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2718  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  52.98 
 
 
470 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.403702  normal  0.0190809 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3385  putative mercuric reductase protein  49.37 
 
 
477 aa  439  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.329574  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0084  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  48.31 
 
 
473 aa  404  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  43.08 
 
 
475 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  43.08 
 
 
475 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  44.39 
 
 
473 aa  363  5.0000000000000005e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4940  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  44.52 
 
 
472 aa  362  8e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1498  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  42.48 
 
 
488 aa  357  3.9999999999999996e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000511741  hitchhiker  0.0000458564 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2549  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  45.6 
 
 
472 aa  356  5.999999999999999e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0494976  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  44.81 
 
 
482 aa  355  7.999999999999999e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0751  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  44.69 
 
 
473 aa  354  2e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1956  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  43.55 
 
 
480 aa  348  2e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1463  mercuric reductase, putative  41.72 
 
 
486 aa  344  2e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0144411  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1481  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.25 
 
 
494 aa  335  1e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1118  mercuric reductase  40.04 
 
 
516 aa  333  3e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.583122  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0341  mercuric reductase  43.52 
 
 
513 aa  331  1e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.262154  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0898  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  44.58 
 
 
508 aa  331  2e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00115945 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  42.42 
 
 
720 aa  328  1.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.91 
 
 
713 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  41.01 
 
 
704 aa  326  5e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0473  mercuric reductase  40.38 
 
 
507 aa  326  7e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000001036 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  40.09 
 
 
716 aa  325  1e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  40.3 
 
 
716 aa  317  4e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  39.65 
 
 
738 aa  315  9e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1982  mercuric reductase  39.45 
 
 
507 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  38.58 
 
 
717 aa  314  1.9999999999999998e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1315  mercuric reductase  41.53 
 
 
505 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0457  mercuric reductase  39.96 
 
 
507 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.14 
 
 
712 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.18 
 
 
717 aa  309  5.9999999999999995e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.23 
 
 
717 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  38.17 
 
 
713 aa  309  6.999999999999999e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.36 
 
 
722 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1239  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.28 
 
 
495 aa  306  6e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.375161 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2535  mercuric reductase  40.08 
 
 
508 aa  306  7e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3749  mercuric reductase  39.51 
 
 
510 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3049  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.51 
 
 
472 aa  305  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0397378  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0309  mercuric reductase  40.6 
 
 
525 aa  301  1e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.09 
 
 
722 aa  301  2e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1976  mercuric reductase  38.19 
 
 
515 aa  300  4e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121394  normal  0.267836 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  40 
 
 
722 aa  296  6e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.52 
 
 
746 aa  293  3e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  42.67 
 
 
705 aa  293  5e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4668  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.77 
 
 
482 aa  293  5e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1598  mercuric reductase  38.58 
 
 
510 aa  288  1e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2088  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.6 
 
 
484 aa  288  2e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6515  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  41.77 
 
 
520 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4228  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.96 
 
 
482 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1429  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  36.88 
 
 
515 aa  272  1e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.905339  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2431  mercuric reductase  36.53 
 
 
509 aa  271  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3132  mercuric reductase  36 
 
 
504 aa  270  5.9999999999999995e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16069  predicted protein  34.2 
 
 
532 aa  268  1e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258027  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0664  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.29 
 
 
489 aa  265  1e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150999  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0732  mercuric reductase, putative  32.35 
 
 
489 aa  264  2e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000844078  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  37.1 
 
 
548 aa  263  4e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_638  mercuric reductase-like protein  31.71 
 
 
499 aa  263  6.999999999999999e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000028153  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  33.85 
 
 
546 aa  261  2e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  34.69 
 
 
546 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  33.63 
 
 
546 aa  258  1e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1388  mercuric reductase  38.48 
 
 
557 aa  258  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000433137  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  35.33 
 
 
550 aa  252  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  35.56 
 
 
745 aa  250  5e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  34.28 
 
 
475 aa  247  3e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4997  mercuric reductase  35.31 
 
 
459 aa  246  4.9999999999999997e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  34.89 
 
 
767 aa  243  5e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1148  mercuric reductase  37.72 
 
 
457 aa  242  1e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  34.01 
 
 
767 aa  239  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4636  mercuric reductase  33.33 
 
 
458 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.295825 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.97 
 
 
470 aa  236  7e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2206  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.02 
 
 
459 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.041685  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.73 
 
 
456 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_002950  PG0802  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  32.59 
 
 
449 aa  233  4.0000000000000004e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0194  mercuric reductase  33.55 
 
 
459 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0283  mercuric reductase  33.55 
 
 
590 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3669  mercuric reductase  35.75 
 
 
459 aa  230  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1652  mercuric reductase  33.33 
 
 
459 aa  230  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.56 
 
 
462 aa  229  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1270  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.48 
 
 
460 aa  228  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.751643  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2009  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  34.37 
 
 
471 aa  227  3e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02078  mercuric reductase  33.41 
 
 
459 aa  226  7e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0840  mercuric reductase  32.75 
 
 
459 aa  226  8e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.909893 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  33.33 
 
 
546 aa  225  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6744  mercuric reductase  32.74 
 
 
453 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.520469  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.75 
 
 
470 aa  225  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1213  mercuric reductase  32.59 
 
 
464 aa  225  2e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0385  mercuric reductase  33.33 
 
 
459 aa  224  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4961  mercuric reductase  29.98 
 
 
460 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.72 
 
 
585 aa  223  4.9999999999999996e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.34 
 
 
562 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5924  mercuric reductase  33.41 
 
 
461 aa  223  8e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184883  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0314  hypothetical protein  30.77 
 
 
464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>