More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_638 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0732  mercuric reductase, putative  83.03 
 
 		 489 aa  862    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000844078  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_638  mercuric reductase-like protein  100 
 
 		 499 aa  1027    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000028153  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0664  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  85.28 
 
 		 489 aa  877    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150999  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3049  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.73 
 
 		 472 aa  300  4e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0397378  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.75 
 
 		 473 aa  292  9e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4940  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.29 
 
 		 472 aa  291  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0751  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.4 
 
 		 473 aa  288  1e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1481  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.43 
 
 		 494 aa  277  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.6 
 
 		 475 aa  276  7e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.6 
 
 		 475 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1239  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.29 
 
 		 495 aa  270  5e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.375161 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0341  mercuric reductase  33.96 
 
 		 513 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.262154  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  35.48 
 
 		 714 aa  260  4e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2535  mercuric reductase  33.26 
 
 		 508 aa  260  4e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.38 
 
 		 712 aa  259  7e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  35.7 
 
 		 714 aa  259  9e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3749  mercuric reductase  34.23 
 
 		 510 aa  258  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1982  mercuric reductase  33.33 
 
 		 507 aa  256  5e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4668  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.22 
 
 		 482 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0304  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.71 
 
 		 474 aa  254  3e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0309  mercuric reductase  32.24 
 
 		 525 aa  253  7e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.48 
 
 		 482 aa  249  6e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0352  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.47 
 
 		 475 aa  249  6e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0473  mercuric reductase  32.71 
 
 		 507 aa  249  8e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000001036 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  33.55 
 
 		 717 aa  249  8e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1956  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.29 
 
 		 480 aa  249  1e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1598  mercuric reductase  33.54 
 
 		 510 aa  248  1e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  33.99 
 
 		 720 aa  249  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.06 
 
 		 713 aa  248  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1118  mercuric reductase  33.62 
 
 		 516 aa  246  8e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.583122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4228  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.22 
 
 		 482 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.24 
 
 		 717 aa  244  3e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.91 
 
 		 722 aa  243  3.9999999999999997e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  34.37 
 
 		 713 aa  243  3.9999999999999997e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.62 
 
 		 722 aa  243  7e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  33.82 
 
 		 716 aa  241  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1498  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.18 
 
 		 488 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000511741  hitchhiker  0.0000458564 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2088  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.22 
 
 		 484 aa  240  4e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1315  mercuric reductase  32.23 
 
 		 505 aa  240  5e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.74 
 
 		 717 aa  239  8e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  33.19 
 
 		 738 aa  238  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1148  mercuric reductase  33.18 
 
 		 457 aa  238  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  32.48 
 
 		 704 aa  237  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0457  mercuric reductase  32.08 
 
 		 507 aa  236  7e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  32.53 
 
 		 716 aa  235  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.33 
 
 		 746 aa  235  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0335  putative mercuric reductase MerA  32.63 
 
 		 470 aa  233  7.000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0257756  normal  0.865003 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  33.7 
 
 		 546 aa  230  5e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0315  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.09 
 
 		 471 aa  230  5e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1976  mercuric reductase  31.09 
 
 		 515 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121394  normal  0.267836 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1429  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  33.91 
 
 		 515 aa  225  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.905339  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1463  mercuric reductase, putative  31.97 
 
 		 486 aa  225  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0144411  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  32.18 
 
 		 722 aa  223  8e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0084  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.7 
 
 		 473 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0645  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  32.21 
 
 		 472 aa  214  2.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3385  putative mercuric reductase protein  31.74 
 
 		 477 aa  213  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.329574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2431  mercuric reductase  32.1 
 
 		 509 aa  212  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6515  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  32.51 
 
 		 520 aa  212  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1388  mercuric reductase  32.55 
 
 		 557 aa  212  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000433137  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2549  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.28 
 
 		 472 aa  209  7e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0494976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.11 
 
 		 585 aa  208  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1057  putative mercuric reductase protein  30.8 
 
 		 470 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.180423  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  31.19 
 
 		 546 aa  207  3e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0504  mercuric reductase  31.29 
 
 		 449 aa  207  4e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  33.65 
 
 		 546 aa  207  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3132  mercuric reductase  29.65 
 
 		 504 aa  207  4e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  31.19 
 
 		 546 aa  207  5e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2718  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.59 
 
 		 470 aa  206  7e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.403702  normal  0.0190809 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  34.04 
 
 		 767 aa  206  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1504  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.92 
 
 		 462 aa  206  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.515089  normal  0.0466141 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  34.35 
 
 		 745 aa  206  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  32.39 
 
 		 548 aa  205  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  32.7 
 
 		 550 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0072  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.68 
 
 		 470 aa  203  6e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0839  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.84 
 
 		 451 aa  202  9.999999999999999e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2649  mercuric reductase  33.8 
 
 		 478 aa  202  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.53 
 
 		 705 aa  202  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2822  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.33 
 
 		 459 aa  200  6e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0920611  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2512  mercuric reductase MerA  34.63 
 
 		 479 aa  200  6e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0898  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.3 
 
 		 508 aa  199  7e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00115945 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2393  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.04 
 
 		 459 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0110453  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1765  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.46 
 
 		 448 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.187504  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0703  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.11 
 
 		 454 aa  197  3e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  33.8 
 
 		 767 aa  197  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0640  mercuric reductase  28.95 
 
 		 468 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.73 
 
 		 459 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.88 
 
 		 473 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2782  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.1 
 
 		 459 aa  195  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16069  predicted protein  28.57 
 
 		 532 aa  193  5e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258027  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1504  mercuric reductase  31.43 
 
 		 453 aa  193  5e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.25653 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1612  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.96 
 
 		 489 aa  193  5e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.722122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0840  mercuric reductase  27.56 
 
 		 469 aa  193  6e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1079  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  29.34 
 
 		 473 aa  193  7e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4636  mercuric reductase  28.02 
 
 		 458 aa  193  7e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295825 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2585  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.49 
 
 		 459 aa  192  9e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295349  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0654  mercuric reductase  27.85 
 
 		 468 aa  192  9e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.87809e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2773  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.49 
 
 		 459 aa  192  9e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2536  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.1 
 
 		 459 aa  192  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2511  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.33 
 
 		 459 aa  192  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.136342 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.33 
 
 		 468 aa  192  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>