More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0703 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0703  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
454 aa  905    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0802  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  48.34 
 
 
449 aa  420  1e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.47 
 
 
562 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1451  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.38 
 
 
466 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0027  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.78 
 
 
468 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  36 
 
 
465 aa  299  8e-80  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl042  dihydrolipate dehydrogenase  36.44 
 
 
602 aa  298  1e-79  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3360  dihydrolipoyl dehydrogenanse  38.04 
 
 
466 aa  296  6e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0306833 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.65 
 
 
468 aa  295  8e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1215  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.26 
 
 
567 aa  295  8e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.34 
 
 
467 aa  293  5e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2936  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.34 
 
 
468 aa  293  5e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.56 
 
 
467 aa  292  9e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.8 
 
 
471 aa  291  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2542  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.99 
 
 
474 aa  291  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.167426  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4074  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.59 
 
 
461 aa  290  4e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000295431  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2011  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.5 
 
 
478 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4116  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.1 
 
 
468 aa  288  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.608117  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.79 
 
 
585 aa  287  2e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1532  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.04 
 
 
460 aa  286  4e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.631051 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2201  2-oxoglutarate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  36.72 
 
 
478 aa  286  5e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00788973  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.47 
 
 
474 aa  286  5e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.45 
 
 
468 aa  286  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2776  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.86 
 
 
459 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0539747 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3964  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.13 
 
 
468 aa  285  8e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321391  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.38 
 
 
473 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.71 
 
 
463 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1978  hypothetical protein  36.6 
 
 
462 aa  283  4.0000000000000003e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0881  acetoin dehydrogenase, thymine PPi dependent, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  38.36 
 
 
585 aa  282  9e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3205  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.53 
 
 
473 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169727  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2766  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.4 
 
 
473 aa  282  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3687  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.85 
 
 
478 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43970  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.85 
 
 
478 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0508378  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.27 
 
 
472 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2807  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.74 
 
 
473 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.09 
 
 
468 aa  281  2e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.22335 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2782  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.16 
 
 
459 aa  280  3e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.31 
 
 
470 aa  280  4e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0839  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.4 
 
 
451 aa  280  5e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.83 
 
 
465 aa  280  6e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.12 
 
 
469 aa  279  8e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.07 
 
 
459 aa  278  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1459  lipoamide dehydrogenase  36.13 
 
 
474 aa  278  1e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1524  lipoamide dehydrogenase  36.34 
 
 
474 aa  278  1e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2511  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.95 
 
 
459 aa  278  1e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.136342 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2536  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.51 
 
 
459 aa  277  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1033  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  37.25 
 
 
584 aa  278  2e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.394953  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2822  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.51 
 
 
459 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0920611  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.97 
 
 
480 aa  278  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.354559  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0718  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.62 
 
 
470 aa  277  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21952e-17 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5671  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.48 
 
 
466 aa  276  4e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2048  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.62 
 
 
474 aa  277  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.47477  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1642  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.24 
 
 
476 aa  276  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370947  normal  0.099089 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2585  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.29 
 
 
459 aa  276  5e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295349  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2773  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.29 
 
 
459 aa  276  5e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.46 
 
 
476 aa  276  6e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.67 
 
 
476 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1805  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.67 
 
 
616 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0271  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.26 
 
 
593 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.146735  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.67 
 
 
476 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1510  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.67 
 
 
476 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.647996  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05840  dihydrolipoyl dehydrogenase, putative  39.08 
 
 
511 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.465888  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2764  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.65 
 
 
477 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2506  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.23 
 
 
470 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2225  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.07 
 
 
465 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325958  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.67 
 
 
476 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.86 
 
 
463 aa  274  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2607  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.34 
 
 
474 aa  275  2.0000000000000002e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00261038 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.24 
 
 
476 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4192  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.71 
 
 
481 aa  274  3e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.03 
 
 
476 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.24 
 
 
476 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.64 
 
 
470 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0228  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.8 
 
 
629 aa  273  6e-72  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2501  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.56 
 
 
478 aa  273  6e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.46 
 
 
476 aa  273  6e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975022  hitchhiker  0.00623097 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3018  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.38 
 
 
479 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.340958 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2575  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.33 
 
 
459 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0023205  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1432  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.24 
 
 
476 aa  272  9e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21637  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1611  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.77 
 
 
483 aa  271  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.24 
 
 
476 aa  272  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2790  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.38 
 
 
479 aa  271  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.14 
 
 
458 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1801  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.87 
 
 
482 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  decreased coverage  0.000698264 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1719  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.61 
 
 
476 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0837  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.29 
 
 
462 aa  271  2e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0629808 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1219  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.34 
 
 
479 aa  271  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4216  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.62 
 
 
598 aa  271  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.31 
 
 
467 aa  271  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.96 
 
 
467 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4996  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.39 
 
 
462 aa  270  2.9999999999999997e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5901  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.97 
 
 
478 aa  270  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.03 
 
 
476 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.03 
 
 
476 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1496  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.03 
 
 
476 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.03 
 
 
476 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.7 
 
 
473 aa  270  4e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1813  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.97 
 
 
477 aa  270  5e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0853723  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1296  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.98 
 
 
463 aa  270  5e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3400  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.48 
 
 
470 aa  270  5e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.131603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>