More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1215 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1215  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
567 aa  1126    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0881  acetoin dehydrogenase, thymine PPi dependent, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  59.25 
 
 
585 aa  681    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1033  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  60.62 
 
 
584 aa  702    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.394953  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3769  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.03 
 
 
562 aa  526  1e-148  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0026  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.03 
 
 
563 aa  526  1e-148  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000184744  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.7 
 
 
463 aa  340  4e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0234  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.65 
 
 
551 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.94 
 
 
450 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.74 
 
 
458 aa  336  5.999999999999999e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.66 
 
 
581 aa  334  2e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.31 
 
 
471 aa  334  3e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.75 
 
 
459 aa  333  6e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.15 
 
 
469 aa  332  8e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.82 
 
 
463 aa  332  1e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1264  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.61 
 
 
472 aa  330  4e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.71337  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.59 
 
 
465 aa  329  7e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 
458 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.48 
 
 
459 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2511  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.13 
 
 
459 aa  327  3e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.136342 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2782  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.13 
 
 
459 aa  327  3e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1978  hypothetical protein  41.3 
 
 
462 aa  327  5e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2801  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.66 
 
 
459 aa  324  2e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.16 
 
 
470 aa  323  4e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2575  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.53 
 
 
459 aa  323  4e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0023205  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2585  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.26 
 
 
459 aa  323  8e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295349  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2773  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.26 
 
 
459 aa  323  8e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2822  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.44 
 
 
459 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0920611  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2764  dihydrolipoamide dehydrogenase  40 
 
 
477 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2776  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.7 
 
 
459 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0539747 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2536  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.05 
 
 
459 aa  320  3e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.89 
 
 
471 aa  321  3e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1296  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.3 
 
 
463 aa  319  9e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3309  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.22 
 
 
462 aa  318  2e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.900179  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.85 
 
 
467 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29750  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.53 
 
 
477 aa  317  5e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.913625  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.69 
 
 
467 aa  316  8e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0180  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.63 
 
 
467 aa  316  8e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl042  dihydrolipate dehydrogenase  36.69 
 
 
602 aa  315  9.999999999999999e-85  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2506  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.31 
 
 
470 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.54 
 
 
480 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0703  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.26 
 
 
454 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.95 
 
 
585 aa  313  3.9999999999999997e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.91 
 
 
467 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.72 
 
 
474 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.9 
 
 
484 aa  312  9e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.2 
 
 
467 aa  312  1e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0768  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.3 
 
 
457 aa  312  1e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0533222  normal  0.0930183 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.11 
 
 
484 aa  312  1e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1543  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.53 
 
 
470 aa  311  2e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.593732  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.99 
 
 
465 aa  311  2e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.47 
 
 
465 aa  311  2e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.69 
 
 
562 aa  311  2e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.51 
 
 
471 aa  311  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0884852  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.09 
 
 
468 aa  311  2.9999999999999997e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.22335 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3360  dihydrolipoyl dehydrogenanse  42.58 
 
 
466 aa  311  2.9999999999999997e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0306833 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1532  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.2 
 
 
460 aa  311  2.9999999999999997e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.631051 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  40.44 
 
 
468 aa  310  5e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2446  2-oxoglutarate dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  39.11 
 
 
472 aa  310  5.9999999999999995e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.57 
 
 
468 aa  310  5.9999999999999995e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11020  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.22 
 
 
465 aa  309  6.999999999999999e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.874516 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.11 
 
 
484 aa  309  8e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0027  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.52 
 
 
468 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.25 
 
 
473 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.67 
 
 
462 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.49 
 
 
475 aa  308  2.0000000000000002e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0183  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.56 
 
 
467 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.52 
 
 
467 aa  307  3e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.52 
 
 
467 aa  307  3e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2807  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.08 
 
 
473 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.97 
 
 
467 aa  307  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0347  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.97 
 
 
470 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0509  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.21 
 
 
463 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.317708  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.75 
 
 
473 aa  306  6e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.737232  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.01 
 
 
465 aa  306  6e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1998  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.47 
 
 
481 aa  306  7e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2168  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.42 
 
 
466 aa  306  8.000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0962  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.81 
 
 
462 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2501  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.75 
 
 
478 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2201  2-oxoglutarate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  39.16 
 
 
478 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00788973  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2011  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.2 
 
 
478 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.86 
 
 
462 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.59 
 
 
462 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.34 
 
 
473 aa  303  7.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.3 
 
 
463 aa  303  7.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2225  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.87 
 
 
465 aa  303  8.000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325958  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26432  dihydrolipoyl dehydrogenase  41.13 
 
 
500 aa  302  9e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.4 
 
 
467 aa  302  1e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0644  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.94 
 
 
466 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2936  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.17 
 
 
468 aa  301  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4216  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.87 
 
 
598 aa  302  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3710  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.91 
 
 
467 aa  302  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0631  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.94 
 
 
466 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0991753  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.09 
 
 
466 aa  301  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1451  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.01 
 
 
466 aa  301  2e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.76 
 
 
467 aa  301  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6148  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.39 
 
 
461 aa  301  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268459  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.84 
 
 
481 aa  301  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1608  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.46 
 
 
481 aa  301  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392675  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.51 
 
 
468 aa  300  4e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.96 
 
 
465 aa  300  4e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>