More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0802 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0802  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  100 
 
 
449 aa  903    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0703  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.34 
 
 
454 aa  420  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2807  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.21 
 
 
473 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2766  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.42 
 
 
473 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.92 
 
 
562 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.32 
 
 
472 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.2 
 
 
585 aa  274  2.0000000000000002e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.03 
 
 
473 aa  273  6e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0718  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.29 
 
 
470 aa  272  7e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21952e-17 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4074  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.96 
 
 
461 aa  271  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000295431  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1813  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.29 
 
 
477 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0853723  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5901  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.96 
 
 
478 aa  269  8e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3205  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.91 
 
 
473 aa  269  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169727  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0522  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.38 
 
 
480 aa  268  2e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6519  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.75 
 
 
478 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1978  hypothetical protein  36.06 
 
 
462 aa  266  8e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1626  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.77 
 
 
487 aa  265  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.139185  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.4 
 
 
479 aa  264  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0279881  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2790  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.18 
 
 
479 aa  264  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3018  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.18 
 
 
479 aa  263  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.340958 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0839  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.86 
 
 
451 aa  263  3e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1451  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.19 
 
 
466 aa  263  6e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2913  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.26 
 
 
479 aa  262  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00695223  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0271  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.3 
 
 
593 aa  261  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.146735  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1689  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.01 
 
 
462 aa  260  3e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.08159 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5671  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.75 
 
 
466 aa  259  9e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2764  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.42 
 
 
477 aa  258  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.98 
 
 
467 aa  257  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.57 
 
 
477 aa  256  4e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0027  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.5 
 
 
468 aa  256  4e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.7 
 
 
484 aa  256  6e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1797  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.29 
 
 
474 aa  256  7e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29750  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.05 
 
 
477 aa  256  8e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.913625  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1508  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.53 
 
 
480 aa  255  1.0000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.468663 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.72 
 
 
465 aa  255  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.76 
 
 
463 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl042  dihydrolipate dehydrogenase  34.42 
 
 
602 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.23 
 
 
473 aa  254  3e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.737232  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.64 
 
 
469 aa  253  3e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.65 
 
 
465 aa  253  5.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0234  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.7 
 
 
551 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.03 
 
 
484 aa  252  9.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.82 
 
 
470 aa  252  1e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2542  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.06 
 
 
474 aa  251  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.167426  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.9 
 
 
468 aa  251  2e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2133  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.97 
 
 
467 aa  251  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.191316  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.59 
 
 
484 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.17 
 
 
471 aa  251  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63850  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.65 
 
 
467 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2776  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.96 
 
 
459 aa  250  3e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0539747 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2511  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.81 
 
 
459 aa  250  3e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.136342 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2782  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.03 
 
 
459 aa  250  3e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2779  dihydrolipoamide dehydrogenase E3 component of 3 enzyme complexes  32.89 
 
 
463 aa  250  4e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.285583  normal  0.562583 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1104  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.87 
 
 
466 aa  250  4e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550844  normal  0.0253682 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0228  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.17 
 
 
629 aa  249  6e-65  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.34 
 
 
581 aa  249  7e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2506  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.07 
 
 
470 aa  248  1e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.18 
 
 
459 aa  248  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2755  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.98 
 
 
466 aa  248  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0982206  hitchhiker  0.000532855 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3360  dihydrolipoyl dehydrogenanse  35.08 
 
 
466 aa  248  2e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0306833 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6035  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.89 
 
 
466 aa  247  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3309  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.55 
 
 
462 aa  247  3e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.900179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2822  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.59 
 
 
459 aa  247  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0920611  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1270  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.93 
 
 
459 aa  247  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211526  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2813  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.34 
 
 
466 aa  247  3e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2936  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.09 
 
 
468 aa  246  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.48 
 
 
458 aa  247  4e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1608  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.75 
 
 
481 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392675  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1264  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.22 
 
 
472 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.71337  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1033  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  34.89 
 
 
584 aa  246  4.9999999999999997e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.394953  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05840  dihydrolipoyl dehydrogenase, putative  37.93 
 
 
511 aa  246  6e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.465888  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1801  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.11 
 
 
482 aa  246  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  decreased coverage  0.000698264 
 
 
-
 
NC_002978  WD0325  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  32.89 
 
 
457 aa  246  6.999999999999999e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1532  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.6 
 
 
460 aa  246  8e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.631051 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2585  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.96 
 
 
459 aa  246  8e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295349  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2773  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.96 
 
 
459 aa  246  8e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.6 
 
 
465 aa  245  9e-64  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2501  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.47 
 
 
478 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1611  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.81 
 
 
483 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3894  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.85 
 
 
471 aa  245  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.287099 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3710  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.48 
 
 
467 aa  245  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1296  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.32 
 
 
463 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2536  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.37 
 
 
459 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.69 
 
 
476 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0962  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.09 
 
 
462 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1081  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.62 
 
 
481 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378558  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0230  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.38 
 
 
454 aa  244  1.9999999999999999e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.247688  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.69 
 
 
476 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.14 
 
 
480 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1096  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.85 
 
 
464 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.41 
 
 
465 aa  245  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.38 
 
 
467 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.69 
 
 
476 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.38 
 
 
467 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1459  lipoamide dehydrogenase  34.2 
 
 
474 aa  244  3e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1035  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.03 
 
 
593 aa  244  3e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.356313  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2589  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.76 
 
 
600 aa  244  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.835737  decreased coverage  0.000383256 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1805  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.23 
 
 
616 aa  244  3e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.38 
 
 
467 aa  244  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1524  lipoamide dehydrogenase  33.98 
 
 
474 aa  243  3.9999999999999997e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>