More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1621 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  66.29 
 
 		 720 aa  932    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  64.49 
 
 		 722 aa  995    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  74.44 
 
 		 738 aa  1128    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  100 
 
 		 716 aa  1451    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  50.35 
 
 		 704 aa  707    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  56.21 
 
 		 712 aa  747    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  66.48 
 
 		 717 aa  1005    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  65.6 
 
 		 722 aa  1001    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  69.2 
 
 		 717 aa  973    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  71.79 
 
 		 716 aa  1090    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  58.82 
 
 		 713 aa  872    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  66.34 
 
 		 717 aa  1021    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  52.76 
 
 		 705 aa  662    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  55.06 
 
 		 713 aa  766    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  68.42 
 
 		 722 aa  994    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  56.55 
 
 		 746 aa  759    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  35.49 
 
 		 714 aa  396  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  35.4 
 
 		 714 aa  393  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3749  mercuric reductase  40.28 
 
 		 510 aa  359  9.999999999999999e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  43.22 
 
 		 475 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  43.22 
 
 		 475 aa  355  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1982  mercuric reductase  42.22 
 
 		 507 aa  352  2e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1315  mercuric reductase  42.49 
 
 		 505 aa  351  3e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1976  mercuric reductase  42.02 
 
 		 515 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121394  normal  0.267836 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1118  mercuric reductase  39.68 
 
 		 516 aa  342  2e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.583122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.8 
 
 		 473 aa  342  2e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4940  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.83 
 
 		 472 aa  336  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0341  mercuric reductase  41.7 
 
 		 513 aa  335  2e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.262154  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0309  mercuric reductase  42.54 
 
 		 525 aa  335  2e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1598  mercuric reductase  41.06 
 
 		 510 aa  332  2e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0473  mercuric reductase  40.04 
 
 		 507 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000001036 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1463  mercuric reductase, putative  41.42 
 
 		 486 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0144411  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2535  mercuric reductase  39.72 
 
 		 508 aa  323  5e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0457  mercuric reductase  38.77 
 
 		 507 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3049  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.35 
 
 		 472 aa  313  9e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0397378  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1481  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.52 
 
 		 494 aa  312  1e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0315  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40 
 
 		 471 aa  311  2e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1956  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.01 
 
 		 480 aa  307  5.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0304  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.73 
 
 		 474 aa  305  2.0000000000000002e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1239  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.14 
 
 		 495 aa  301  3e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.375161 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1498  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.44 
 
 		 488 aa  299  1e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000511741  hitchhiker  0.0000458564 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0751  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.64 
 
 		 473 aa  294  5e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.74 
 
 		 482 aa  291  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0898  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.08 
 
 		 508 aa  292  2e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00115945 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4228  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.26 
 
 		 482 aa  291  3e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4668  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.04 
 
 		 482 aa  291  3e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2431  mercuric reductase  37.35 
 
 		 509 aa  290  8e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1429  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  35.35 
 
 		 515 aa  288  2.9999999999999996e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.905339  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0352  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.42 
 
 		 475 aa  281  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2088  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.82 
 
 		 484 aa  276  8e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16069  predicted protein  38.01 
 
 		 532 aa  276  9e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258027  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0335  putative mercuric reductase MerA  39.83 
 
 		 470 aa  276  9e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0257756  normal  0.865003 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3132  mercuric reductase  34.7 
 
 		 504 aa  274  3e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6515  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  38.86 
 
 		 520 aa  273  1e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0645  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  38.88 
 
 		 472 aa  266  1e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.79 
 
 		 562 aa  255  2.0000000000000002e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2552  SNARE associated Golgi protein  56.39 
 
 		 231 aa  251  5e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1057  putative mercuric reductase protein  36.05 
 
 		 470 aa  249  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.180423  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0732  mercuric reductase, putative  34.93 
 
 		 489 aa  249  2e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000844078  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  35.65 
 
 		 546 aa  248  3e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0072  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.13 
 
 		 470 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2718  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.62 
 
 		 470 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.403702  normal  0.0190809 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02949  putative mercuric reductase  35.24 
 
 		 503 aa  245  3e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187984  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0664  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.28 
 
 		 489 aa  244  6e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150999  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.37 
 
 		 458 aa  242  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0242  putative mercuric reductase  35.03 
 
 		 467 aa  242  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.51 
 
 		 458 aa  241  4e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2549  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.16 
 
 		 472 aa  241  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0494976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.76 
 
 		 473 aa  241  5e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_638  mercuric reductase-like protein  33.82 
 
 		 499 aa  241  5e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000028153  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  34.7 
 
 		 550 aa  240  5.999999999999999e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0084  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.85 
 
 		 473 aa  238  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  34.93 
 
 		 546 aa  238  4e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1388  mercuric reductase  36.13 
 
 		 557 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000433137  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  34.72 
 
 		 546 aa  234  3e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.7 
 
 		 484 aa  234  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.7 
 
 		 484 aa  233  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6297  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.57 
 
 		 466 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.48 
 
 		 484 aa  232  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.91 
 
 		 472 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1451  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.42 
 
 		 466 aa  230  9e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.9 
 
 		 473 aa  229  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1998  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.15 
 
 		 481 aa  228  3e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1813  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.91 
 
 		 477 aa  227  5.0000000000000005e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0853723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  34.93 
 
 		 767 aa  227  6e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0256  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  33.69 
 
 		 484 aa  227  6e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.74 
 
 		 465 aa  226  1e-57  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0298  hypothetical protein  31.64 
 
 		 464 aa  226  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  34.79 
 
 		 546 aa  225  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  34.84 
 
 		 767 aa  225  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2807  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.19 
 
 		 473 aa  225  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0314  hypothetical protein  31.41 
 
 		 464 aa  224  4e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1326  hypothetical protein  53.52 
 
 		 229 aa  223  7e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0497167  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3205  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.97 
 
 		 473 aa  223  8e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169727  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.9 
 
 		 463 aa  223  9e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2766  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.54 
 
 		 473 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.03 
 
 		 463 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  34.9 
 
 		 745 aa  223  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.01 
 
 		 465 aa  222  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.62 
 
 		 473 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>