More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2549 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2549  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  100 
 
 
472 aa  917    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0494976  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0315  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  46.37 
 
 
471 aa  367  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0352  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  44.99 
 
 
475 aa  367  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0645  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  45.68 
 
 
472 aa  364  2e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0304  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  45.89 
 
 
474 aa  362  9e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0072  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  47.76 
 
 
470 aa  354  2e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1057  putative mercuric reductase protein  46.7 
 
 
470 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.180423  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0335  putative mercuric reductase MerA  45.01 
 
 
470 aa  349  5e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0257756  normal  0.865003 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2718  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  46.27 
 
 
470 aa  349  7e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.403702  normal  0.0190809 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3385  putative mercuric reductase protein  46.77 
 
 
477 aa  345  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.329574  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  39.95 
 
 
714 aa  343  2.9999999999999997e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  38.91 
 
 
714 aa  336  5e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0084  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  45.37 
 
 
473 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.31 
 
 
473 aa  327  4.0000000000000003e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  44.42 
 
 
482 aa  322  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1498  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  43.53 
 
 
488 aa  320  3e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000511741  hitchhiker  0.0000458564 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.01 
 
 
475 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.79 
 
 
475 aa  316  7e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0751  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  43.05 
 
 
473 aa  307  3e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4940  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.11 
 
 
472 aa  306  6e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1956  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  42 
 
 
480 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1463  mercuric reductase, putative  41.51 
 
 
486 aa  300  5e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0144411  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  38.19 
 
 
713 aa  295  1e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.79 
 
 
712 aa  294  3e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  41.25 
 
 
722 aa  286  5.999999999999999e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  38.75 
 
 
704 aa  286  5.999999999999999e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  39.87 
 
 
720 aa  281  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1481  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.31 
 
 
494 aa  281  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1976  mercuric reductase  39.66 
 
 
515 aa  280  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121394  normal  0.267836 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2535  mercuric reductase  39.45 
 
 
508 aa  278  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  38.39 
 
 
716 aa  278  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0473  mercuric reductase  39.45 
 
 
507 aa  277  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000001036 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  37.96 
 
 
738 aa  276  5e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.66 
 
 
722 aa  276  6e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.07 
 
 
717 aa  276  8e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.54 
 
 
717 aa  273  6e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3049  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.39 
 
 
472 aa  272  9e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0397378  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0898  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.79 
 
 
508 aa  271  2e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00115945 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.01 
 
 
722 aa  270  5e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0309  mercuric reductase  39.5 
 
 
525 aa  268  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2088  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.24 
 
 
484 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4668  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.22 
 
 
482 aa  266  8e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1598  mercuric reductase  37.99 
 
 
510 aa  262  8e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  36.54 
 
 
717 aa  262  8.999999999999999e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1315  mercuric reductase  40.79 
 
 
505 aa  261  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1239  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.63 
 
 
495 aa  260  4e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.375161 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2431  mercuric reductase  39.83 
 
 
509 aa  259  7e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1982  mercuric reductase  36.48 
 
 
507 aa  258  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6744  mercuric reductase  36.83 
 
 
453 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.520469  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3749  mercuric reductase  36.86 
 
 
510 aa  258  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.12 
 
 
713 aa  258  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0457  mercuric reductase  38.63 
 
 
507 aa  257  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6515  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  40.36 
 
 
520 aa  256  5e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1118  mercuric reductase  37.53 
 
 
516 aa  256  6e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.583122  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5924  mercuric reductase  38.98 
 
 
461 aa  255  9e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184883  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5831  mercuric reductase  37.44 
 
 
455 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194109  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3669  mercuric reductase  40.09 
 
 
459 aa  254  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.65 
 
 
746 aa  254  3e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  37.77 
 
 
716 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3551  mercuric reductase  38.08 
 
 
458 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  normal  0.343975 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0341  mercuric reductase  38.83 
 
 
513 aa  253  6e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.262154  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1429  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  36.63 
 
 
515 aa  252  1e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.905339  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.67 
 
 
456 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4228  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.91 
 
 
482 aa  250  3e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3468  mercuric reductase  40.27 
 
 
457 aa  249  7e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211907  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4636  mercuric reductase  37.44 
 
 
458 aa  249  8e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.295825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3059  mercuric reductase  39.78 
 
 
460 aa  248  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0658861 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5390  mercuric reductase  37.86 
 
 
458 aa  249  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3872  mercuric reductase  38.22 
 
 
459 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.429317 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1652  mercuric reductase  37.42 
 
 
459 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0194  mercuric reductase  37.42 
 
 
459 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3204  mercuric reductase  37.95 
 
 
459 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3142  mercuric reductase  37.95 
 
 
459 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3154  mercuric reductase  37.95 
 
 
459 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0283  mercuric reductase  37.42 
 
 
590 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3648  mercuric reductase  38 
 
 
459 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.948829 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4715  mercuric reductase  38 
 
 
459 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4011  mercuric reductase  38.6 
 
 
459 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0854657  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3897  mercuric reductase  38.6 
 
 
459 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.423332 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4997  mercuric reductase  37.89 
 
 
459 aa  245  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1270  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.84 
 
 
460 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.751643  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.53 
 
 
705 aa  245  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0840  mercuric reductase  36.64 
 
 
459 aa  243  3.9999999999999997e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.909893 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2206  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.59 
 
 
459 aa  242  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.041685  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5056  mercuric reductase  37.78 
 
 
459 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135768 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2463  mercuric reductase  37.22 
 
 
459 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.736078 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.75 
 
 
470 aa  239  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.75 
 
 
470 aa  239  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.75 
 
 
470 aa  239  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.75 
 
 
470 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.75 
 
 
470 aa  238  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.75 
 
 
470 aa  238  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.75 
 
 
470 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.75 
 
 
470 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.75 
 
 
470 aa  238  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1668  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  43.01 
 
 
459 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0297676  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5011  mercuric reductase  37.09 
 
 
459 aa  236  8e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1035  normal  0.205591 
 
 
-
 
NC_003296  RS02078  mercuric reductase  37.36 
 
 
459 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0385  mercuric reductase  36.78 
 
 
459 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3460  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.55 
 
 
458 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>