More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2535 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3749  mercuric reductase  62.42 
 
 
510 aa  648    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2535  mercuric reductase  100 
 
 
508 aa  1045    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0457  mercuric reductase  63.66 
 
 
507 aa  620  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0473  mercuric reductase  62.22 
 
 
507 aa  620  1e-176  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000001036 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1982  mercuric reductase  59.88 
 
 
507 aa  599  1e-170  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1315  mercuric reductase  59.39 
 
 
505 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1598  mercuric reductase  51.57 
 
 
510 aa  521  1e-146  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0309  mercuric reductase  56.15 
 
 
525 aa  521  1e-146  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0341  mercuric reductase  55.13 
 
 
513 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.262154  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1118  mercuric reductase  52.61 
 
 
516 aa  516  1.0000000000000001e-145  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.583122  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1976  mercuric reductase  52.24 
 
 
515 aa  500  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121394  normal  0.267836 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2431  mercuric reductase  51.09 
 
 
509 aa  493  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1429  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  49.19 
 
 
515 aa  478  1e-134  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.905339  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3132  mercuric reductase  45.8 
 
 
504 aa  422  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16069  predicted protein  42.66 
 
 
532 aa  419  1e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258027  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6515  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  49.11 
 
 
520 aa  408  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  45.17 
 
 
475 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  45.17 
 
 
475 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4940  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  44.42 
 
 
472 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  42.26 
 
 
473 aa  361  1e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3049  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.62 
 
 
472 aa  356  5e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0397378  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  41.72 
 
 
720 aa  356  5.999999999999999e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0751  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  43.29 
 
 
473 aa  355  8.999999999999999e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  39.42 
 
 
713 aa  343  2.9999999999999997e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  40.8 
 
 
704 aa  343  4e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.07 
 
 
713 aa  341  2e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.55 
 
 
712 aa  338  9.999999999999999e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  38.11 
 
 
738 aa  334  2e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.08 
 
 
717 aa  333  6e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  42.28 
 
 
746 aa  330  5.0000000000000004e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  39.72 
 
 
716 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.65 
 
 
717 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1498  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.25 
 
 
488 aa  325  9e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000511741  hitchhiker  0.0000458564 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.51 
 
 
722 aa  323  4e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.8 
 
 
722 aa  322  7e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  37.4 
 
 
716 aa  322  9.999999999999999e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.65 
 
 
482 aa  318  1e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  41.52 
 
 
722 aa  313  4.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0304  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.87 
 
 
474 aa  311  2e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1956  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.48 
 
 
480 aa  311  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  37.2 
 
 
717 aa  309  6.999999999999999e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  38.44 
 
 
714 aa  308  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  38 
 
 
714 aa  308  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1239  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.95 
 
 
495 aa  308  2.0000000000000002e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.375161 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1481  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.76 
 
 
494 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0352  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.83 
 
 
475 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1463  mercuric reductase, putative  36.46 
 
 
486 aa  298  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0144411  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0645  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  41.23 
 
 
472 aa  298  2e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0315  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.32 
 
 
471 aa  295  1e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0335  putative mercuric reductase MerA  41.01 
 
 
470 aa  295  2e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0257756  normal  0.865003 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4668  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.29 
 
 
482 aa  292  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1057  putative mercuric reductase protein  41.79 
 
 
470 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.180423  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40 
 
 
705 aa  290  3e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0898  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.68 
 
 
508 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00115945 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2718  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.14 
 
 
470 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.403702  normal  0.0190809 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0072  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.04 
 
 
470 aa  282  9e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2088  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.43 
 
 
484 aa  278  1e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3385  putative mercuric reductase protein  40.49 
 
 
477 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.329574  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0084  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.21 
 
 
473 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  35.6 
 
 
546 aa  274  3e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0732  mercuric reductase, putative  34.24 
 
 
489 aa  272  1e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000844078  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_638  mercuric reductase-like protein  33.26 
 
 
499 aa  271  2e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000028153  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  36.64 
 
 
550 aa  268  1e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2549  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.62 
 
 
472 aa  267  4e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0494976  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  35.75 
 
 
546 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4228  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.77 
 
 
482 aa  263  4e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  33.06 
 
 
546 aa  259  7e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  33.06 
 
 
546 aa  258  1e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0664  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.16 
 
 
489 aa  256  5e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150999  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  35.59 
 
 
475 aa  254  3e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  34.86 
 
 
548 aa  250  4e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.6 
 
 
459 aa  249  6e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19949  predicted protein  39.36 
 
 
393 aa  245  9.999999999999999e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3142  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.93 
 
 
486 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6297  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.03 
 
 
466 aa  239  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3460  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.07 
 
 
458 aa  237  4e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0840  mercuric reductase  32.17 
 
 
469 aa  237  4e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3551  mercuric reductase  32.74 
 
 
458 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  normal  0.343975 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5390  mercuric reductase  32.74 
 
 
458 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4961  mercuric reductase  31.06 
 
 
460 aa  234  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0723  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.48 
 
 
476 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4715  mercuric reductase  32.37 
 
 
459 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3648  mercuric reductase  32.37 
 
 
459 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.948829 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3872  mercuric reductase  32.14 
 
 
459 aa  233  6e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.429317 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0690  mercuric reductase  33.4 
 
 
481 aa  233  7.000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192452  normal  0.6373 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2393  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.97 
 
 
459 aa  231  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0110453  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  34.77 
 
 
767 aa  231  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.55 
 
 
456 aa  230  4e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0242  putative mercuric reductase  33.33 
 
 
467 aa  230  5e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1388  mercuric reductase  33.84 
 
 
557 aa  230  6e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000433137  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0385  mercuric reductase  31.25 
 
 
459 aa  229  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2463  mercuric reductase  32.37 
 
 
459 aa  229  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.736078 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1148  mercuric reductase  34.29 
 
 
457 aa  229  1e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02949  putative mercuric reductase  33.7 
 
 
503 aa  229  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187984  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  34.56 
 
 
745 aa  228  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1612  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.47 
 
 
489 aa  226  6e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.722122  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3897  mercuric reductase  30.4 
 
 
459 aa  225  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.423332 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2443  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.24 
 
 
469 aa  225  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4011  mercuric reductase  30.4 
 
 
459 aa  225  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0854657  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3142  mercuric reductase  31.8 
 
 
459 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>