More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2393 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.29 
 
 
470 aa  638    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2393  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
459 aa  920    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0110453  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.22 
 
 
470 aa  632  1e-180  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.18 
 
 
470 aa  628  1e-179  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.18 
 
 
470 aa  628  1e-179  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.18 
 
 
470 aa  628  1e-179  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.96 
 
 
470 aa  625  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.96 
 
 
470 aa  625  1e-178  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.67 
 
 
470 aa  627  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.96 
 
 
470 aa  625  1e-178  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.74 
 
 
470 aa  622  1e-177  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.74 
 
 
470 aa  624  1e-177  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.74 
 
 
470 aa  624  1e-177  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.74 
 
 
470 aa  624  1e-177  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.8 
 
 
468 aa  602  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.8 
 
 
468 aa  602  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.36 
 
 
468 aa  598  1e-170  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.62 
 
 
470 aa  509  1e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0331  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.21 
 
 
473 aa  475  1e-133  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0634  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.2 
 
 
475 aa  463  1e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000338686  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0740  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.89 
 
 
469 aa  453  1.0000000000000001e-126  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.010396  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0048  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.34 
 
 
472 aa  433  1e-120  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.8 
 
 
492 aa  389  1e-107  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1998  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.44 
 
 
481 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1665  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.04 
 
 
491 aa  375  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.771016  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.4 
 
 
484 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.18 
 
 
484 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.96 
 
 
484 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4388  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.56 
 
 
465 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1805  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.77 
 
 
616 aa  372  1e-101  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6500  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.21 
 
 
465 aa  364  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.264998  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.06 
 
 
480 aa  363  4e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.354559  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.23 
 
 
475 aa  362  9e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0142  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.59 
 
 
475 aa  361  2e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.262371  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0271  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.05 
 
 
593 aa  359  6e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.146735  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.76 
 
 
467 aa  358  9.999999999999999e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.4 
 
 
476 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.4 
 
 
476 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3520  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.67 
 
 
602 aa  355  1e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.501053  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.18 
 
 
476 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.18 
 
 
476 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1496  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.18 
 
 
476 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.18 
 
 
476 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.18 
 
 
476 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.97 
 
 
476 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3504  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.6 
 
 
465 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.305711 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1510  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.76 
 
 
476 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.647996  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.76 
 
 
476 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1719  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.54 
 
 
476 aa  351  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.73 
 
 
463 aa  351  1e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1988  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.05 
 
 
475 aa  350  2e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00115  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.16 
 
 
474 aa  350  3e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3486  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.16 
 
 
474 aa  350  3e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0123  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.98 
 
 
495 aa  350  3e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00461139  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0126  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.98 
 
 
495 aa  350  3e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0120  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.16 
 
 
474 aa  350  3e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0447957  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0985  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.34 
 
 
472 aa  350  3e-95  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.747719 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.54 
 
 
476 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975022  hitchhiker  0.00623097 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0109  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.16 
 
 
474 aa  350  3e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.809196  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0118  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.16 
 
 
474 aa  350  3e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00709642  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3543  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.16 
 
 
474 aa  350  4e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.399649  normal  0.262226 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03103  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.05 
 
 
607 aa  350  4e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4760  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.88 
 
 
462 aa  349  6e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.54 
 
 
476 aa  349  6e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2623  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.83 
 
 
475 aa  349  6e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.798797  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1126  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.29 
 
 
463 aa  349  6e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333956  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0176  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.94 
 
 
475 aa  348  8e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.54 
 
 
476 aa  348  8e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.33 
 
 
476 aa  348  9e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1432  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.54 
 
 
476 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21637  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3566  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.16 
 
 
474 aa  348  1e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0167  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.76 
 
 
474 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0168  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.76 
 
 
474 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.928694  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1035  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.81 
 
 
593 aa  348  2e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.356313  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0433  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.57 
 
 
475 aa  347  2e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000206937 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0837  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.14 
 
 
462 aa  348  2e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0629808 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0167  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.72 
 
 
474 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1246  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.07 
 
 
463 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.873311  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0173  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.72 
 
 
474 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4651  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.54 
 
 
476 aa  347  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183592  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0765  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.07 
 
 
463 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3554  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.6 
 
 
464 aa  347  3e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0662  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.16 
 
 
474 aa  346  4e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.42488  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3752  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.94 
 
 
474 aa  346  4e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.361486  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3352  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.79 
 
 
474 aa  347  4e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000157637  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3429  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.69 
 
 
475 aa  346  4e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0358795  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1219  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.85 
 
 
463 aa  346  5e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0377  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.26 
 
 
476 aa  345  8e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349282 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0321  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.16 
 
 
476 aa  345  1e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0683294 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0421  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.91 
 
 
475 aa  345  1e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000187748  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2829  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.65 
 
 
464 aa  344  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1911  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.61 
 
 
603 aa  345  1e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00687521  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03223  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.67 
 
 
473 aa  344  2e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.416876  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3092  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  41.19 
 
 
589 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0122251  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1719  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  41.19 
 
 
589 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0148218  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2153  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.41 
 
 
590 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0291933  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1137  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.85 
 
 
463 aa  344  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.249929  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2076  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.59 
 
 
588 aa  344  2e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4192  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.45 
 
 
481 aa  344  2e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1500  pyruvate dehydrogenase complex E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  41.19 
 
 
589 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.628337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>