More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0985 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0985  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
472 aa  920    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.747719 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0142  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.01 
 
 
475 aa  628  1e-179  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.262371  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.8 
 
 
492 aa  626  1e-178  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1665  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.05 
 
 
491 aa  605  9.999999999999999e-173  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.771016  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1805  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.12 
 
 
616 aa  564  1.0000000000000001e-159  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4147  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.72 
 
 
469 aa  479  1e-134  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.515477  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.98 
 
 
470 aa  423  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.35 
 
 
470 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.96 
 
 
470 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.21 
 
 
484 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  47 
 
 
484 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2829  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.85 
 
 
464 aa  393  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.21 
 
 
484 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.97 
 
 
475 aa  390  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.49 
 
 
470 aa  387  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.13 
 
 
470 aa  386  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.55 
 
 
468 aa  382  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.07 
 
 
470 aa  382  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1998  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.97 
 
 
481 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.07 
 
 
470 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.07 
 
 
470 aa  383  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.07 
 
 
470 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.07 
 
 
470 aa  382  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.07 
 
 
470 aa  383  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.07 
 
 
470 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.07 
 
 
470 aa  383  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35490  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.79 
 
 
464 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730291 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.07 
 
 
470 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6500  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.01 
 
 
465 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.264998  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2991  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.71 
 
 
464 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1246  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.68 
 
 
463 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.873311  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0765  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.68 
 
 
463 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4388  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.58 
 
 
465 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1126  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.53 
 
 
463 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333956  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0527  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.35 
 
 
464 aa  375  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.49 
 
 
468 aa  373  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1219  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.47 
 
 
463 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4363  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.68 
 
 
463 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1137  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.32 
 
 
463 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.249929  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.49 
 
 
468 aa  373  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0459  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.14 
 
 
464 aa  372  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3554  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.94 
 
 
464 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2393  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.05 
 
 
459 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0110453  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4760  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.11 
 
 
462 aa  369  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.84 
 
 
467 aa  365  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0271  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.44 
 
 
593 aa  365  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.146735  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3965  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.68 
 
 
459 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3745  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.42 
 
 
459 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.46243 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4404  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.73 
 
 
459 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.26 
 
 
463 aa  364  2e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3466  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.59 
 
 
457 aa  361  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.146186  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1450  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.52 
 
 
459 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03103  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.89 
 
 
607 aa  355  1e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2775  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.57 
 
 
452 aa  354  2e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.373811  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2301  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.51 
 
 
466 aa  353  4e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.44531  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2965  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.52 
 
 
680 aa  353  5e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155449  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3190  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.88 
 
 
466 aa  352  7e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1035  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.78 
 
 
593 aa  352  7e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.356313  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1033  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.88 
 
 
466 aa  351  1e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.889645  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2010  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.88 
 
 
466 aa  351  1e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2299  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.88 
 
 
466 aa  351  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.947723  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1319  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.88 
 
 
466 aa  351  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1408  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.88 
 
 
466 aa  351  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3064  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.88 
 
 
466 aa  351  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2454  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.35 
 
 
579 aa  351  2e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0709  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.47 
 
 
476 aa  348  1e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.732763 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.58 
 
 
594 aa  347  3e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.308322 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0331  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.1 
 
 
473 aa  345  1e-93  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1459  lipoamide dehydrogenase  42.05 
 
 
474 aa  344  2e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1524  lipoamide dehydrogenase  42.27 
 
 
474 aa  344  2e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3489  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.79 
 
 
474 aa  343  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.71639  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3360  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.79 
 
 
474 aa  343  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1031  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.79 
 
 
475 aa  343  4e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0676  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.45 
 
 
474 aa  343  5.999999999999999e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1241  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.36 
 
 
599 aa  341  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3566  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.23 
 
 
474 aa  340  2e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7193  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.14 
 
 
619 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0662  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.7 
 
 
474 aa  340  2.9999999999999998e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.42488  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.92 
 
 
463 aa  340  4e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0126  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.92 
 
 
495 aa  339  5e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0123  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.92 
 
 
495 aa  339  5e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00461139  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3752  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.79 
 
 
474 aa  340  5e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.361486  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00115  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.92 
 
 
474 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3486  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.92 
 
 
474 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0120  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.92 
 
 
474 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0447957  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0118  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.92 
 
 
474 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00709642  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0168  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.05 
 
 
474 aa  339  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.928694  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6299  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.92 
 
 
625 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0179219 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0176  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.05 
 
 
475 aa  339  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0109  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.92 
 
 
474 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.809196  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0167  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.05 
 
 
474 aa  339  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3543  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.92 
 
 
474 aa  338  9e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.399649  normal  0.262226 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0173  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.05 
 
 
474 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0167  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.05 
 
 
474 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.38 
 
 
463 aa  337  1.9999999999999998e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0636  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.36 
 
 
474 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.67 
 
 
467 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1219  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.8 
 
 
479 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4009  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.45 
 
 
474 aa  336  3.9999999999999995e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413471  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1911  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.69 
 
 
603 aa  336  3.9999999999999995e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00687521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>