More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3965 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2991  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.92 
 
 		 464 aa  686    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4404  dihydrolipoamide dehydrogenase  96.95 
 
 		 459 aa  881    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3466  dihydrolipoamide dehydrogenase  76.32 
 
 		 457 aa  701    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.146186  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2301  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.31 
 
 		 466 aa  635    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.44531  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3745  dihydrolipoamide dehydrogenase  92.16 
 
 		 459 aa  846    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.46243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3965  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 459 aa  921    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1450  dihydrolipoamide dehydrogenase  96.73 
 
 		 459 aa  880    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35490  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.49 
 
 		 464 aa  688    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00730291 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4363  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.93 
 
 		 463 aa  632  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0765  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.15 
 
 		 463 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1219  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.72 
 
 		 463 aa  631  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1246  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.15 
 
 		 463 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.873311  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2010  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.67 
 
 		 466 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1408  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.88 
 
 		 466 aa  626  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1033  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.67 
 
 		 466 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.889645  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2299  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.67 
 
 		 466 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.947723  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1319  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.67 
 
 		 466 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3064  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.88 
 
 		 466 aa  626  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3190  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.88 
 
 		 466 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1126  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.83 
 
 		 463 aa  625  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333956  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1137  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.83 
 
 		 463 aa  626  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.249929  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4760  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.82 
 
 		 462 aa  515  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0527  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.88 
 
 		 464 aa  510  1e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4388  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.73 
 
 		 465 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2829  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.71 
 
 		 464 aa  509  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3554  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.13 
 
 		 464 aa  508  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0459  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.67 
 
 		 464 aa  507  9.999999999999999e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2775  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.21 
 
 		 452 aa  503  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.373811  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6500  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.64 
 
 		 465 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.264998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0779  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.23 
 
 		 466 aa  490  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1873  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.14 
 
 		 467 aa  479  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0709  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.73 
 
 		 476 aa  454  1.0000000000000001e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.732763 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.03 
 
 		 492 aa  379  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.1 
 
 		 470 aa  369  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.24 
 
 		 470 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.24 
 
 		 470 aa  366  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.24 
 
 		 470 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.24 
 
 		 470 aa  366  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.24 
 
 		 470 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.24 
 
 		 470 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.03 
 
 		 470 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.24 
 
 		 470 aa  365  1e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.24 
 
 		 470 aa  365  1e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.24 
 
 		 470 aa  365  1e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.06 
 
 		 470 aa  365  1e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1665  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.65 
 
 		 491 aa  365  1e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.771016  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.33 
 
 		 470 aa  364  2e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1805  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.71 
 
 		 616 aa  360  3e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.12 
 
 		 470 aa  359  6e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.13 
 
 		 468 aa  358  8e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0985  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.68 
 
 		 472 aa  358  9.999999999999999e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.747719 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0142  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.64 
 
 		 475 aa  354  2e-96  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.262371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.04 
 
 		 468 aa  349  5e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.04 
 
 		 468 aa  349  5e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0634  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.59 
 
 		 475 aa  343  2.9999999999999997e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000338686  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2764  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.93 
 
 		 477 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.53 
 
 		 475 aa  336  5.999999999999999e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.34 
 
 		 467 aa  333  4e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.34 
 
 		 467 aa  333  5e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.34 
 
 		 480 aa  332  8e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.354559  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.77 
 
 		 467 aa  332  8e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.22 
 
 		 463 aa  331  1e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0331  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.04 
 
 		 473 aa  332  1e-89  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.8 
 
 		 463 aa  330  3e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0718  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.23 
 
 		 470 aa  330  4e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21952e-17 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2542  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.17 
 
 		 474 aa  329  6e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.167426  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.59 
 
 		 466 aa  326  5e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.16 
 
 		 484 aa  326  5e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4147  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.74 
 
 		 469 aa  325  9e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.515477  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.74 
 
 		 484 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3352  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.34 
 
 		 474 aa  324  2e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000157637  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.76 
 
 		 467 aa  323  5e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1998  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.61 
 
 		 481 aa  322  8e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2393  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.29 
 
 		 459 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0110453  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2446  2-oxoglutarate dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  42.49 
 
 		 472 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.52 
 
 		 484 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.76 
 
 		 469 aa  321  1.9999999999999998e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.06 
 
 		 468 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2168  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.98 
 
 		 466 aa  320  3e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.22 
 
 		 468 aa  320  3.9999999999999996e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.22335 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.74 
 
 		 463 aa  319  5e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.51 
 
 		 466 aa  318  1e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349518  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.66 
 
 		 467 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.36 
 
 		 467 aa  318  1e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.84 
 
 		 471 aa  318  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.92 
 
 		 467 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.06 
 
 		 476 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.06 
 
 		 476 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.09 
 
 		 468 aa  315  1.9999999999999998e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1219  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.81 
 
 		 479 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3964  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.08 
 
 		 468 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4192  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.3 
 
 		 481 aa  314  1.9999999999999998e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1264  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.6 
 
 		 472 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.71337  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0180  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.37 
 
 		 467 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0740  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.13 
 
 		 469 aa  313  2.9999999999999996e-84  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.010396  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.59 
 
 		 467 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0048  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.49 
 
 		 472 aa  313  4.999999999999999e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.95 
 
 		 467 aa  311  1e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.84 
 
 		 476 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.32 
 
 		 476 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>