More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1873 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1873  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 467 aa  931    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0779  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.67 
 
 		 466 aa  616  1e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0709  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.81 
 
 		 476 aa  526  1e-148  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.732763 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35490  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.23 
 
 		 464 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00730291 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2991  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.93 
 
 		 464 aa  508  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2829  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.24 
 
 		 464 aa  508  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3554  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.27 
 
 		 464 aa  502  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2301  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.38 
 
 		 466 aa  495  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.44531  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2775  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.96 
 
 		 452 aa  496  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.373811  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1319  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.11 
 
 		 466 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4388  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.02 
 
 		 465 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0527  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.67 
 
 		 464 aa  494  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3190  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.9 
 
 		 466 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2010  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.11 
 
 		 466 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1408  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.9 
 
 		 466 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2299  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.11 
 
 		 466 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.947723  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6500  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.45 
 
 		 465 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.264998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1033  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.11 
 
 		 466 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.889645  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3064  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.9 
 
 		 466 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4760  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.79 
 
 		 462 aa  491  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0459  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.45 
 
 		 464 aa  491  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3965  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.26 
 
 		 459 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1246  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.65 
 
 		 463 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.873311  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3745  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.62 
 
 		 459 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.46243 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0765  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.65 
 
 		 463 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4404  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.2 
 
 		 459 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1219  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.22 
 
 		 463 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1450  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.2 
 
 		 459 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1137  dihydrolipoamide dehydrogenase  55 
 
 		 463 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.249929  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1126  dihydrolipoamide dehydrogenase  55 
 
 		 463 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333956  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4363  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.53 
 
 		 463 aa  476  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3466  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.72 
 
 		 457 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.146186  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.82 
 
 		 470 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.14 
 
 		 470 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.79 
 
 		 470 aa  379  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.14 
 
 		 470 aa  376  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.36 
 
 		 470 aa  378  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.36 
 
 		 470 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.14 
 
 		 470 aa  376  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.36 
 
 		 470 aa  378  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.61 
 
 		 470 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.36 
 
 		 470 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.36 
 
 		 470 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.36 
 
 		 470 aa  378  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.14 
 
 		 470 aa  376  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.03 
 
 		 492 aa  369  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.16 
 
 		 470 aa  365  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1665  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.89 
 
 		 491 aa  359  5e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.771016  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.27 
 
 		 468 aa  352  5.9999999999999994e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1805  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.11 
 
 		 616 aa  352  1e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.06 
 
 		 468 aa  350  3e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.06 
 
 		 468 aa  350  3e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0142  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.35 
 
 		 475 aa  344  2e-93  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.262371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.79 
 
 		 475 aa  332  7.000000000000001e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2393  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.17 
 
 		 459 aa  332  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0110453  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.47 
 
 		 469 aa  330  3e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0985  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.96 
 
 		 472 aa  324  2e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.747719 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3352  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.22 
 
 		 474 aa  324  2e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000157637  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.97 
 
 		 463 aa  322  9.999999999999999e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0634  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.66 
 
 		 475 aa  321  9.999999999999999e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000338686  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.86 
 
 		 480 aa  319  6e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.354559  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.55 
 
 		 468 aa  319  7e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.22335 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0718  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.55 
 
 		 470 aa  318  1e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21952e-17 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.95 
 
 		 467 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0048  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.43 
 
 		 472 aa  317  2e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3520  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.61 
 
 		 602 aa  317  2e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.501053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2965  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.45 
 
 		 680 aa  317  4e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155449  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0180  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.74 
 
 		 467 aa  315  8e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.51 
 
 		 471 aa  315  9e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.67 
 
 		 467 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.31 
 
 		 467 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1219  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.51 
 
 		 479 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03103  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.83 
 
 		 607 aa  315  1.9999999999999998e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.43 
 
 		 467 aa  311  1e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4147  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.16 
 
 		 469 aa  311  2e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.515477  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1524  lipoamide dehydrogenase  39.52 
 
 		 474 aa  310  2.9999999999999997e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4192  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.71 
 
 		 481 aa  310  2.9999999999999997e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1003  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.91 
 
 		 594 aa  310  4e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.851611  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7193  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.92 
 
 		 619 aa  310  5e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.85 
 
 		 468 aa  310  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  40 
 
 		 467 aa  310  5e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1241  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.79 
 
 		 599 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29750  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.46 
 
 		 477 aa  309  8e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.913625  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2454  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.6 
 
 		 579 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2011  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.08 
 
 		 478 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.81 
 
 		 480 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0331  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.57 
 
 		 473 aa  308  1.0000000000000001e-82  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1998  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.76 
 
 		 481 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1459  lipoamide dehydrogenase  39.09 
 
 		 474 aa  308  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.03 
 
 		 467 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1296  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.42 
 
 		 463 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2201  2-oxoglutarate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  40.3 
 
 		 478 aa  307  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00788973  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0271  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.65 
 
 		 593 aa  307  3e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.146735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1031  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.01 
 
 		 475 aa  306  4.0000000000000004e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3360  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.01 
 
 		 474 aa  306  4.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3489  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.01 
 
 		 474 aa  306  4.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.71639  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.47 
 
 		 468 aa  306  5.0000000000000004e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3911  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.04 
 
 		 475 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000450783  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03223  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.83 
 
 		 473 aa  306  6e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.416876  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.72 
 
 		 463 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>