More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4363 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1137  dihydrolipoamide dehydrogenase  90.28 
 
 
463 aa  827    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.249929  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2010  dihydrolipoamide dehydrogenase  76.24 
 
 
466 aa  691    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1033  dihydrolipoamide dehydrogenase  76.24 
 
 
466 aa  691    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.889645  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1408  dihydrolipoamide dehydrogenase  76.46 
 
 
466 aa  692    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4363  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
463 aa  919    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3190  dihydrolipoamide dehydrogenase  76.46 
 
 
466 aa  694    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2301  dihydrolipoamide dehydrogenase  75.59 
 
 
466 aa  686    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.44531  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1319  dihydrolipoamide dehydrogenase  76.24 
 
 
466 aa  691    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3064  dihydrolipoamide dehydrogenase  76.46 
 
 
466 aa  692    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1246  dihydrolipoamide dehydrogenase  93.52 
 
 
463 aa  853    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.873311  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1219  dihydrolipoamide dehydrogenase  93.3 
 
 
463 aa  850    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0765  dihydrolipoamide dehydrogenase  93.52 
 
 
463 aa  853    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2991  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.33 
 
 
464 aa  667    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2299  dihydrolipoamide dehydrogenase  76.24 
 
 
466 aa  691    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.947723  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1126  dihydrolipoamide dehydrogenase  89.85 
 
 
463 aa  825    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333956  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35490  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.11 
 
 
464 aa  667    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730291 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3466  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.9 
 
 
457 aa  630  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.146186  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3745  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.52 
 
 
459 aa  626  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.46243 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1450  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.72 
 
 
459 aa  614  1e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4404  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.72 
 
 
459 aa  614  1e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3965  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.93 
 
 
459 aa  617  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6500  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.65 
 
 
465 aa  546  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.264998  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4388  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.43 
 
 
465 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0527  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.05 
 
 
464 aa  528  1e-149  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3554  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.05 
 
 
464 aa  529  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0459  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.84 
 
 
464 aa  526  1e-148  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2829  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.73 
 
 
464 aa  526  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4760  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.83 
 
 
462 aa  522  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2775  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.8 
 
 
452 aa  493  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.373811  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0779  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.7 
 
 
466 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0709  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.5 
 
 
476 aa  462  1e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.732763 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1873  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.79 
 
 
467 aa  454  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.51 
 
 
470 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.64 
 
 
470 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.01 
 
 
492 aa  372  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.1 
 
 
470 aa  369  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1665  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.4 
 
 
491 aa  371  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.771016  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1805  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.4 
 
 
616 aa  366  1e-100  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.83 
 
 
470 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.61 
 
 
470 aa  368  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.61 
 
 
470 aa  363  4e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.61 
 
 
470 aa  363  4e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.61 
 
 
470 aa  363  4e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.83 
 
 
470 aa  362  6e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.83 
 
 
470 aa  362  6e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.83 
 
 
470 aa  362  6e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.83 
 
 
470 aa  362  6e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.83 
 
 
470 aa  362  6e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.83 
 
 
470 aa  362  6e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.91 
 
 
468 aa  360  2e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0142  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.36 
 
 
475 aa  357  2.9999999999999997e-97  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.262371  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1998  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.85 
 
 
481 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.91 
 
 
468 aa  354  2e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.91 
 
 
468 aa  354  2e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0985  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.47 
 
 
472 aa  349  6e-95  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.747719 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0331  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.65 
 
 
473 aa  347  2e-94  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2393  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 
459 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0110453  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.42 
 
 
467 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1219  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.85 
 
 
479 aa  335  7.999999999999999e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.9 
 
 
467 aa  333  4e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0180  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.44 
 
 
467 aa  333  4e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.9 
 
 
467 aa  333  5e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.78 
 
 
467 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.28 
 
 
480 aa  330  3e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.354559  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.4 
 
 
484 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0634  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.19 
 
 
475 aa  330  5.0000000000000004e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000338686  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.74 
 
 
484 aa  329  6e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.23 
 
 
467 aa  329  6e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.98 
 
 
484 aa  329  7e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.22 
 
 
475 aa  329  8e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4192  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.03 
 
 
481 aa  328  8e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.23 
 
 
466 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2813  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.13 
 
 
466 aa  328  1.0000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.01 
 
 
467 aa  326  7e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.37 
 
 
467 aa  325  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.4 
 
 
471 aa  324  2e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.46 
 
 
467 aa  325  2e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2764  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.03 
 
 
477 aa  323  3e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0183  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.58 
 
 
467 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29750  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.77 
 
 
477 aa  323  4e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.913625  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2542  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.91 
 
 
474 aa  323  4e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.167426  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.85 
 
 
463 aa  323  5e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.75 
 
 
476 aa  322  8e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1719  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.75 
 
 
476 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0027  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.19 
 
 
468 aa  320  3e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4147  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.46 
 
 
469 aa  320  3e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.515477  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0235  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.54 
 
 
466 aa  319  6e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.73 
 
 
476 aa  319  6e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1642  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.53 
 
 
476 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370947  normal  0.099089 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63850  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.24 
 
 
467 aa  318  9e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2446  2-oxoglutarate dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  41.35 
 
 
472 aa  318  1e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.08 
 
 
467 aa  318  1e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.73 
 
 
476 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.73 
 
 
476 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.86 
 
 
476 aa  318  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3964  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.26 
 
 
468 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321391  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.52 
 
 
476 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.04 
 
 
468 aa  316  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.94 
 
 
469 aa  316  6e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0048  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.74 
 
 
472 aa  315  8e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>