More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0779 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0779  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 466 aa  914    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1873  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.9 
 
 		 467 aa  610  1e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2301  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.9 
 
 		 466 aa  513  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.44531  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3190  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.9 
 
 		 466 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35490  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.85 
 
 		 464 aa  511  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00730291 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2991  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.06 
 
 		 464 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2010  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.11 
 
 		 466 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1408  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.9 
 
 		 466 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2299  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.11 
 
 		 466 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.947723  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1319  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.11 
 
 		 466 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3064  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.9 
 
 		 466 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1033  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.11 
 
 		 466 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.889645  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3554  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.84 
 
 		 464 aa  504  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0527  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.19 
 
 		 464 aa  501  1e-141  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1246  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.22 
 
 		 463 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.873311  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0765  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.22 
 
 		 463 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0459  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.97 
 
 		 464 aa  498  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0709  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.19 
 
 		 476 aa  499  1e-140  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.732763 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1219  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.22 
 
 		 463 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3466  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.88 
 
 		 457 aa  495  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.146186  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2829  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.2 
 
 		 464 aa  497  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4760  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.58 
 
 		 462 aa  494  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4404  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.76 
 
 		 459 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3965  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.23 
 
 		 459 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4363  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.7 
 
 		 463 aa  491  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1450  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.97 
 
 		 459 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2775  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.46 
 
 		 452 aa  487  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.373811  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3745  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.11 
 
 		 459 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.46243 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1137  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.27 
 
 		 463 aa  487  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.249929  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4388  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.48 
 
 		 465 aa  484  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6500  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.75 
 
 		 465 aa  482  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.264998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1126  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.62 
 
 		 463 aa  481  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333956  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.68 
 
 		 492 aa  368  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.92 
 
 		 470 aa  367  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.82 
 
 		 470 aa  362  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.25 
 
 		 470 aa  362  1e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.25 
 
 		 470 aa  361  1e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.25 
 
 		 470 aa  362  1e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.25 
 
 		 470 aa  361  1e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.25 
 
 		 470 aa  362  1e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.25 
 
 		 470 aa  361  1e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.25 
 
 		 470 aa  361  2e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.25 
 
 		 470 aa  361  2e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.25 
 
 		 470 aa  361  2e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.4 
 
 		 470 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.28 
 
 		 470 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.28 
 
 		 470 aa  356  5.999999999999999e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.92 
 
 		 468 aa  351  2e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1665  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.12 
 
 		 491 aa  348  1e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.771016  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.5 
 
 		 468 aa  348  2e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.5 
 
 		 468 aa  348  2e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0142  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.91 
 
 		 475 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.262371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1805  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.44 
 
 		 616 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.45 
 
 		 463 aa  330  3e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.05 
 
 		 475 aa  329  6e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0985  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.37 
 
 		 472 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.747719 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4187  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.51 
 
 		 478 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3510  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.51 
 
 		 478 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0716172  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.25 
 
 		 480 aa  325  7e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.354559  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1667  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.3 
 
 		 478 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3758  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.3 
 
 		 478 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.75 
 
 		 467 aa  324  2e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2965  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.32 
 
 		 680 aa  323  3e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155449  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29750  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.46 
 
 		 477 aa  323  4e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.913625  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2011  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.86 
 
 		 478 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.33 
 
 		 467 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2201  2-oxoglutarate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  43.28 
 
 		 478 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00788973  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.33 
 
 		 467 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1616  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.3 
 
 		 478 aa  319  5e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3772  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2133  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.7 
 
 		 467 aa  318  2e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.191316  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.35 
 
 		 467 aa  317  4e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.99 
 
 		 467 aa  316  6e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1219  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.98 
 
 		 479 aa  315  7e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2764  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.84 
 
 		 477 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0718  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.43 
 
 		 470 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21952e-17 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3687  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.41 
 
 		 478 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43970  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.41 
 
 		 478 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0508378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4147  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.71 
 
 		 469 aa  313  3.9999999999999997e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.515477  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0180  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.78 
 
 		 467 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.15 
 
 		 469 aa  312  9e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4192  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.67 
 
 		 481 aa  311  1e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.49 
 
 		 471 aa  311  1e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.578679  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.56 
 
 		 466 aa  311  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.49 
 
 		 467 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2501  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.11 
 
 		 478 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.92 
 
 		 480 aa  310  4e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7193  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.11 
 
 		 619 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.63 
 
 		 476 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.63 
 
 		 476 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.95 
 
 		 468 aa  308  1.0000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1241  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.4 
 
 		 599 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.42 
 
 		 476 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3352  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.61 
 
 		 474 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000157637  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.54 
 
 		 484 aa  307  3e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2168  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.89 
 
 		 466 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0048  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.81 
 
 		 472 aa  306  5.0000000000000004e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.47 
 
 		 467 aa  306  6e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.11 
 
 		 484 aa  306  6e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.42 
 
 		 476 aa  306  7e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.42 
 
 		 476 aa  306  7e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>