More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0709 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0709  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
476 aa  951    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.732763 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1873  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.79 
 
 
467 aa  520  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3554  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.32 
 
 
464 aa  501  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0527  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.26 
 
 
464 aa  495  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0779  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.19 
 
 
466 aa  493  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0459  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.05 
 
 
464 aa  493  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2301  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.04 
 
 
466 aa  484  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.44531  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3190  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.26 
 
 
466 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2010  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.47 
 
 
466 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1408  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.26 
 
 
466 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4363  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.5 
 
 
463 aa  479  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2299  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.47 
 
 
466 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.947723  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1033  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.47 
 
 
466 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.889645  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3064  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.26 
 
 
466 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4388  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.81 
 
 
465 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35490  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.4 
 
 
464 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730291 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1319  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.47 
 
 
466 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2829  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.18 
 
 
464 aa  475  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1246  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.29 
 
 
463 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.873311  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4760  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.87 
 
 
462 aa  475  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2991  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.19 
 
 
464 aa  475  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0765  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.29 
 
 
463 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1219  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.29 
 
 
463 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6500  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.18 
 
 
465 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.264998  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3745  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.04 
 
 
459 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.46243 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3466  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.72 
 
 
457 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.146186  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1126  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.33 
 
 
463 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333956  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1137  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.91 
 
 
463 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.249929  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3965  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.73 
 
 
459 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2775  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.33 
 
 
452 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.373811  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4404  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.19 
 
 
459 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1450  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.98 
 
 
459 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.24 
 
 
470 aa  382  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1805  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.89 
 
 
616 aa  378  1e-103  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.27 
 
 
470 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.81 
 
 
470 aa  374  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.77 
 
 
470 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.38 
 
 
470 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.38 
 
 
470 aa  369  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.38 
 
 
470 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.38 
 
 
470 aa  369  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.38 
 
 
470 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.64 
 
 
492 aa  372  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.38 
 
 
470 aa  369  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.16 
 
 
470 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1998  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.32 
 
 
481 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.04 
 
 
470 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.04 
 
 
470 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.04 
 
 
470 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.37 
 
 
468 aa  358  9.999999999999999e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1665  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.31 
 
 
491 aa  357  1.9999999999999998e-97  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.771016  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.93 
 
 
475 aa  355  7.999999999999999e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.16 
 
 
468 aa  353  2.9999999999999997e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.16 
 
 
468 aa  353  2.9999999999999997e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.55 
 
 
484 aa  352  8.999999999999999e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.95 
 
 
484 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.95 
 
 
484 aa  349  5e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0142  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.12 
 
 
475 aa  344  2e-93  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.262371  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0985  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.94 
 
 
472 aa  343  4e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.747719 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1219  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.04 
 
 
479 aa  342  8e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.89 
 
 
480 aa  340  2.9999999999999998e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.354559  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1003  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.93 
 
 
594 aa  338  9.999999999999999e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.851611  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3352  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.04 
 
 
474 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000157637  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4805  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.58 
 
 
477 aa  333  3e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03103  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.79 
 
 
607 aa  334  3e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.4 
 
 
594 aa  334  3e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.308322 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3775  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.31 
 
 
476 aa  333  5e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000442431  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03223  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.93 
 
 
473 aa  330  3e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.416876  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2393  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.14 
 
 
459 aa  329  8e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0110453  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0634  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.49 
 
 
475 aa  328  1.0000000000000001e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000338686  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.1 
 
 
467 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3520  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.25 
 
 
602 aa  327  3e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.501053  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29750  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.08 
 
 
477 aa  326  6e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.913625  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.76 
 
 
467 aa  325  8.000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3543  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.98 
 
 
474 aa  325  1e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.399649  normal  0.262226 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2454  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.89 
 
 
579 aa  325  1e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00115  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.98 
 
 
474 aa  325  2e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3486  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.98 
 
 
474 aa  325  2e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.77 
 
 
466 aa  324  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0109  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.98 
 
 
474 aa  325  2e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.809196  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0120  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.98 
 
 
474 aa  325  2e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0447957  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0123  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.8 
 
 
495 aa  325  2e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00461139  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0118  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.98 
 
 
474 aa  325  2e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00709642  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0126  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.8 
 
 
495 aa  325  2e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0176  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.55 
 
 
475 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.68 
 
 
467 aa  323  4e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1616  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.7 
 
 
478 aa  323  4e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3772  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0168  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.55 
 
 
474 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.928694  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0167  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.55 
 
 
474 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0173  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.55 
 
 
474 aa  323  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1911  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.83 
 
 
603 aa  323  5e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00687521  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0167  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.55 
 
 
474 aa  323  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.68 
 
 
467 aa  323  6e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.53 
 
 
476 aa  322  7e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.53 
 
 
476 aa  322  7e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1554  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.3 
 
 
589 aa  322  7e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2076  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.33 
 
 
588 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3911  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.25 
 
 
475 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000450783  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3510  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.08 
 
 
478 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0716172  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.06 
 
 
463 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>