More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_35490 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4404  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.49 
 
 		 459 aa  675    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2010  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.67 
 
 		 466 aa  666    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1246  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.55 
 
 		 463 aa  672    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.873311  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3965  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.49 
 
 		 459 aa  671    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1408  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.46 
 
 		 466 aa  665    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3466  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.73 
 
 		 457 aa  684    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.146186  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4363  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.11 
 
 		 463 aa  667    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3064  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.46 
 
 		 466 aa  665    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3745  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.28 
 
 		 459 aa  675    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.46243 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2301  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.89 
 
 		 466 aa  672    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.44531  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2991  dihydrolipoamide dehydrogenase  97.63 
 
 		 464 aa  901    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1319  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.67 
 
 		 466 aa  666    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0765  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.55 
 
 		 463 aa  672    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2299  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.67 
 
 		 466 aa  666    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.947723  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1450  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.28 
 
 		 459 aa  672    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1033  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.67 
 
 		 466 aa  666    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.889645  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1219  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.11 
 
 		 463 aa  669    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1126  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.46 
 
 		 463 aa  660    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333956  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3190  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.46 
 
 		 466 aa  667    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35490  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 464 aa  920    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00730291 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1137  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.46 
 
 		 463 aa  661    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.249929  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2829  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.56 
 
 		 464 aa  550  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0527  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.9 
 
 		 464 aa  547  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3554  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.94 
 
 		 464 aa  541  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0459  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.68 
 
 		 464 aa  544  1e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6500  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.46 
 
 		 465 aa  528  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.264998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4388  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.46 
 
 		 465 aa  528  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4760  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.35 
 
 		 462 aa  514  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0779  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.85 
 
 		 466 aa  495  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2775  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.18 
 
 		 452 aa  489  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.373811  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1873  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.11 
 
 		 467 aa  486  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0709  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.4 
 
 		 476 aa  464  1e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.732763 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.04 
 
 		 470 aa  395  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.72 
 
 		 492 aa  394  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.61 
 
 		 470 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1665  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.4 
 
 		 491 aa  387  1e-106  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.771016  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.09 
 
 		 470 aa  385  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.44 
 
 		 470 aa  382  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.66 
 
 		 470 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.47 
 
 		 470 aa  379  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.66 
 
 		 470 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.66 
 
 		 470 aa  380  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.66 
 
 		 470 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.66 
 
 		 470 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.66 
 
 		 470 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.66 
 
 		 470 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.66 
 
 		 470 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.66 
 
 		 470 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.03 
 
 		 468 aa  376  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.03 
 
 		 468 aa  375  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.03 
 
 		 468 aa  375  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1805  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.11 
 
 		 616 aa  369  1e-101  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0142  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.97 
 
 		 475 aa  362  7.0000000000000005e-99  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.262371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0985  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.59 
 
 		 472 aa  357  2.9999999999999997e-97  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.747719 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0634  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.5 
 
 		 475 aa  350  4e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000338686  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.24 
 
 		 484 aa  345  8e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.59 
 
 		 484 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.59 
 
 		 484 aa  343  4e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.12 
 
 		 475 aa  342  1e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.82 
 
 		 463 aa  341  2e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1998  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.23 
 
 		 481 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2393  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.98 
 
 		 459 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0110453  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1219  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.38 
 
 		 479 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.8 
 
 		 480 aa  337  1.9999999999999998e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.354559  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.44 
 
 		 467 aa  335  1e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4192  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.47 
 
 		 481 aa  333  4e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.72 
 
 		 468 aa  332  7.000000000000001e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.22335 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0331  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.53 
 
 		 473 aa  332  8e-90  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.56 
 
 		 467 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.22 
 
 		 467 aa  332  1e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.22 
 
 		 467 aa  332  1e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2764  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.82 
 
 		 477 aa  330  3e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0180  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.13 
 
 		 467 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4147  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.25 
 
 		 469 aa  330  3e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.515477  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3520  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.56 
 
 		 602 aa  329  5.0000000000000004e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.501053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.7 
 
 		 468 aa  330  5.0000000000000004e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.95 
 
 		 467 aa  329  6e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.07 
 
 		 466 aa  329  8e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3352  dihydrolipoamide dehydrogenase  40 
 
 		 474 aa  329  8e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000157637  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2201  2-oxoglutarate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  40.88 
 
 		 478 aa  328  9e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00788973  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2011  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.67 
 
 		 478 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2965  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.32 
 
 		 680 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155449  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.13 
 
 		 469 aa  325  9e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03103  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.58 
 
 		 607 aa  325  1e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.85 
 
 		 467 aa  325  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3687  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.88 
 
 		 478 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.57 
 
 		 468 aa  324  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.7 
 
 		 467 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43970  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.88 
 
 		 478 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0508378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29750  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.09 
 
 		 477 aa  324  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.913625  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26432  dihydrolipoyl dehydrogenase  41.49 
 
 		 500 aa  323  4e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2798  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.14 
 
 		 479 aa  323  5e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5793  normal  0.535486 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  40 
 
 		 476 aa  322  6e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  40 
 
 		 476 aa  322  6e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1981  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.27 
 
 		 603 aa  323  6e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.01171  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2936  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.67 
 
 		 468 aa  322  7e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1911  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.27 
 
 		 603 aa  322  7e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00687521  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3964  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.36 
 
 		 468 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.78 
 
 		 476 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.65 
 
 		 467 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>