More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0634 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0634  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
475 aa  965    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000338686  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.53 
 
 
470 aa  520  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.04 
 
 
470 aa  520  1e-146  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.3 
 
 
468 aa  506  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.3 
 
 
468 aa  506  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.45 
 
 
468 aa  504  1e-141  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.73 
 
 
470 aa  504  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.73 
 
 
470 aa  504  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.52 
 
 
470 aa  503  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.73 
 
 
470 aa  504  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.73 
 
 
470 aa  504  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.73 
 
 
470 aa  504  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.52 
 
 
470 aa  503  1e-141  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.52 
 
 
470 aa  503  1e-141  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.73 
 
 
470 aa  504  1e-141  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.88 
 
 
470 aa  499  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.94 
 
 
470 aa  501  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0331  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.96 
 
 
473 aa  476  1e-133  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2393  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.2 
 
 
459 aa  463  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0110453  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0740  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.05 
 
 
469 aa  459  9.999999999999999e-129  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.010396  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.32 
 
 
470 aa  457  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0048  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.31 
 
 
472 aa  451  1e-125  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.5 
 
 
475 aa  360  2e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0271  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.34 
 
 
593 aa  350  3e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.146735  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35490  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.5 
 
 
464 aa  350  4e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730291 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1998  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.77 
 
 
481 aa  345  7e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2991  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.96 
 
 
464 aa  345  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.7 
 
 
484 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.7 
 
 
484 aa  342  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.06 
 
 
484 aa  342  1e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1035  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.94 
 
 
593 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.356313  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4760  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.77 
 
 
462 aa  338  1.9999999999999998e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3554  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.91 
 
 
464 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0527  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.13 
 
 
464 aa  337  3.9999999999999995e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1219  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.61 
 
 
463 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0765  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.82 
 
 
463 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1246  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.82 
 
 
463 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.873311  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1137  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.03 
 
 
463 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.249929  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1126  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.03 
 
 
463 aa  333  3e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333956  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6500  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.53 
 
 
465 aa  333  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.264998  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0459  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.91 
 
 
464 aa  333  6e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4388  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.69 
 
 
465 aa  332  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.22 
 
 
492 aa  330  4e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4363  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.19 
 
 
463 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1805  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.8 
 
 
616 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6299  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.69 
 
 
625 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0179219 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4404  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.17 
 
 
459 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2076  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.76 
 
 
588 aa  327  3e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3745  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.91 
 
 
459 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.46243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3965  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.59 
 
 
459 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.62 
 
 
467 aa  326  5e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1450  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 
459 aa  325  9e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.68 
 
 
463 aa  323  3e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2829  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.53 
 
 
464 aa  323  4e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1241  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.69 
 
 
599 aa  323  4e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03103  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.71 
 
 
607 aa  322  8e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1524  lipoamide dehydrogenase  38.76 
 
 
474 aa  322  9.000000000000001e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1459  lipoamide dehydrogenase  38.54 
 
 
474 aa  322  9.999999999999999e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2965  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.73 
 
 
680 aa  322  9.999999999999999e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155449  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.88 
 
 
468 aa  320  3e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.22335 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7193  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.83 
 
 
619 aa  317  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1665  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.86 
 
 
491 aa  317  3e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.771016  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1612  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.49 
 
 
474 aa  316  6e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0551  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.87 
 
 
464 aa  315  8e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1981  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.22 
 
 
603 aa  314  1.9999999999999998e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.01171  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1911  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.22 
 
 
603 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00687521  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0571  dihydrolipoyl dehydrogenase, E3 component of pyruvate dehydrogenases complex  39.28 
 
 
474 aa  313  3.9999999999999997e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3504  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.57 
 
 
465 aa  312  7.999999999999999e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.305711 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0709  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.59 
 
 
476 aa  312  7.999999999999999e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.732763 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00115  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.89 
 
 
474 aa  311  2e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3486  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.89 
 
 
474 aa  311  2e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0120  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.89 
 
 
474 aa  311  2e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0447957  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1135  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.03 
 
 
589 aa  311  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.373004  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3543  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.89 
 
 
474 aa  311  2e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.399649  normal  0.262226 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0109  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.89 
 
 
474 aa  311  2e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.809196  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0118  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.89 
 
 
474 aa  311  2e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00709642  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0126  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.24 
 
 
495 aa  310  4e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0123  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.24 
 
 
495 aa  310  4e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00461139  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1033  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.27 
 
 
466 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.889645  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2010  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.27 
 
 
466 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1319  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.27 
 
 
466 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2299  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.27 
 
 
466 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.947723  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3520  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.97 
 
 
602 aa  310  5e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.501053  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3064  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.07 
 
 
466 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1408  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.07 
 
 
466 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0962  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.66 
 
 
462 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2775  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.08 
 
 
452 aa  309  8e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.373811  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.66 
 
 
462 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1719  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  37.61 
 
 
589 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0148218  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1500  pyruvate dehydrogenase complex E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  37.61 
 
 
589 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.628337  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2228  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  37.61 
 
 
589 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.467573  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0985  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.56 
 
 
472 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.747719 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3092  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  37.61 
 
 
589 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0122251  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0142  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.06 
 
 
475 aa  308  2.0000000000000002e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.262371  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2743  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  37.61 
 
 
589 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3466  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.78 
 
 
457 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.146186  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2665  pyruvate dehydrogenase complex E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  37.61 
 
 
589 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2610  pyruvate dehydrogenase complex E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  37.61 
 
 
589 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.74 
 
 
462 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.08 
 
 
480 aa  307  3e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.354559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>