More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3554 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4388  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.1 
 
 
465 aa  639    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0527  dihydrolipoamide dehydrogenase  89.01 
 
 
464 aa  834    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3554  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
464 aa  934    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0459  dihydrolipoamide dehydrogenase  88.79 
 
 
464 aa  832    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2829  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.89 
 
 
464 aa  656    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6500  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.24 
 
 
465 aa  632  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.264998  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4760  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.95 
 
 
462 aa  608  1e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2775  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.79 
 
 
452 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.373811  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35490  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.94 
 
 
464 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730291 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2991  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.3 
 
 
464 aa  552  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1246  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.57 
 
 
463 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.873311  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2301  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.87 
 
 
466 aa  548  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.44531  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0765  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.57 
 
 
463 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2010  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.44 
 
 
466 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1408  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.65 
 
 
466 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4363  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.05 
 
 
463 aa  545  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1219  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.35 
 
 
463 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1319  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.44 
 
 
466 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3190  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.65 
 
 
466 aa  548  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1033  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.44 
 
 
466 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.889645  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3064  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.65 
 
 
466 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2299  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.44 
 
 
466 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.947723  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3466  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.27 
 
 
457 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.146186  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1137  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.19 
 
 
463 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.249929  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1126  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.19 
 
 
463 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333956  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3745  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.44 
 
 
459 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.46243 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4404  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.13 
 
 
459 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3965  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.13 
 
 
459 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1450  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.92 
 
 
459 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0779  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.84 
 
 
466 aa  500  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0709  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.32 
 
 
476 aa  500  1e-140  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.732763 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1873  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.02 
 
 
467 aa  495  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.91 
 
 
470 aa  410  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.91 
 
 
470 aa  411  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.91 
 
 
470 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.91 
 
 
470 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.91 
 
 
470 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.91 
 
 
470 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.91 
 
 
470 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.91 
 
 
470 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.91 
 
 
470 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.12 
 
 
470 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.91 
 
 
470 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.91 
 
 
470 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.71 
 
 
470 aa  398  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.36 
 
 
470 aa  398  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.55 
 
 
492 aa  394  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.94 
 
 
468 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1665  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.23 
 
 
491 aa  390  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.771016  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.94 
 
 
468 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.86 
 
 
468 aa  386  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.11 
 
 
475 aa  385  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1805  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.14 
 
 
616 aa  378  1e-103  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0142  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.57 
 
 
475 aa  369  1e-101  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.262371  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0985  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.15 
 
 
472 aa  361  1e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.747719 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2393  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.08 
 
 
459 aa  361  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0110453  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1998  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.28 
 
 
481 aa  359  6e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0331  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.09 
 
 
473 aa  357  1.9999999999999998e-97  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0634  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.25 
 
 
475 aa  353  5e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000338686  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4192  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.86 
 
 
481 aa  346  6e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.79 
 
 
480 aa  345  7e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.354559  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1911  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.03 
 
 
603 aa  341  2e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00687521  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.92 
 
 
484 aa  339  5.9999999999999996e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.5 
 
 
484 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.36 
 
 
468 aa  337  1.9999999999999998e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.22335 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.5 
 
 
484 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0271  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.78 
 
 
593 aa  335  7e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.146735  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7193  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.5 
 
 
619 aa  334  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1981  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.6 
 
 
603 aa  334  2e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.01171  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03103  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.13 
 
 
607 aa  333  3e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3520  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.91 
 
 
602 aa  333  5e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.501053  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0027  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.04 
 
 
468 aa  332  8e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2936  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.81 
 
 
468 aa  332  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.81 
 
 
467 aa  331  2e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  39 
 
 
463 aa  330  3e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0048  dihydrolipoamide dehydrogenase  40 
 
 
472 aa  330  3e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3352  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.7 
 
 
474 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000157637  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1219  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.87 
 
 
479 aa  329  6e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2764  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.29 
 
 
477 aa  329  7e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.94 
 
 
467 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.94 
 
 
467 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29750  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.15 
 
 
477 aa  328  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.913625  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.49 
 
 
466 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2454  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.53 
 
 
579 aa  327  3e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.58 
 
 
467 aa  327  3e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3964  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.84 
 
 
468 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321391  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4147  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.19 
 
 
469 aa  326  5e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.515477  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1241  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.62 
 
 
599 aa  326  6e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.4 
 
 
467 aa  326  7e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.36 
 
 
476 aa  325  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.37 
 
 
467 aa  325  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4996  dihydrolipoamide dehydrogenase  40 
 
 
462 aa  324  2e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.43 
 
 
467 aa  324  2e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.63 
 
 
464 aa  324  2e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26432  dihydrolipoyl dehydrogenase  41.61 
 
 
500 aa  324  2e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2965  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.15 
 
 
680 aa  324  2e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155449  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.15 
 
 
467 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.09 
 
 
480 aa  323  3e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.84 
 
 
468 aa  323  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1276  dihydrolipoamide dehydrogenase  38 
 
 
478 aa  323  5e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0924333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>