More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1408 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA2010  dihydrolipoamide dehydrogenase  99.79 
 
 		 466 aa  923    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3064  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 466 aa  924    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1408  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 466 aa  924    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1319  dihydrolipoamide dehydrogenase  99.79 
 
 		 466 aa  923    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4363  dihydrolipoamide dehydrogenase  76.46 
 
 		 463 aa  692    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2299  dihydrolipoamide dehydrogenase  99.79 
 
 		 466 aa  923    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.947723  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2301  dihydrolipoamide dehydrogenase  94.85 
 
 		 466 aa  873    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.44531  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1219  dihydrolipoamide dehydrogenase  75.59 
 
 		 463 aa  688    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3190  dihydrolipoamide dehydrogenase  99.79 
 
 		 466 aa  922    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1033  dihydrolipoamide dehydrogenase  99.79 
 
 		 466 aa  923    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.889645  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0765  dihydrolipoamide dehydrogenase  75.81 
 
 		 463 aa  690    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1137  dihydrolipoamide dehydrogenase  74.51 
 
 		 463 aa  672    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.249929  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1126  dihydrolipoamide dehydrogenase  74.3 
 
 		 463 aa  669    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333956  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2991  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.67 
 
 		 464 aa  664    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35490  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.46 
 
 		 464 aa  665    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00730291 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1246  dihydrolipoamide dehydrogenase  75.81 
 
 		 463 aa  690    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.873311  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3745  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.45 
 
 		 459 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.46243 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3466  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.75 
 
 		 457 aa  611  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.146186  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3965  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.88 
 
 		 459 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4404  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.45 
 
 		 459 aa  604  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1450  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.45 
 
 		 459 aa  604  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4388  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.31 
 
 		 465 aa  561  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0527  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.23 
 
 		 464 aa  554  1e-156  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6500  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.53 
 
 		 465 aa  553  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.264998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2829  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.99 
 
 		 464 aa  550  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0459  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.01 
 
 		 464 aa  551  1e-155  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3554  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.65 
 
 		 464 aa  530  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4760  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.48 
 
 		 462 aa  513  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2775  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.15 
 
 		 452 aa  505  9.999999999999999e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.373811  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0779  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.9 
 
 		 466 aa  491  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1873  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.76 
 
 		 467 aa  466  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0709  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.26 
 
 		 476 aa  464  1e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.732763 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.37 
 
 		 470 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.02 
 
 		 470 aa  381  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.9 
 
 		 470 aa  379  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.59 
 
 		 470 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.16 
 
 		 470 aa  378  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.28 
 
 		 470 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.28 
 
 		 470 aa  373  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.16 
 
 		 470 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.16 
 
 		 470 aa  373  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.28 
 
 		 470 aa  373  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.16 
 
 		 470 aa  373  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.16 
 
 		 470 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.16 
 
 		 470 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.16 
 
 		 470 aa  373  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.92 
 
 		 492 aa  360  4e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.78 
 
 		 468 aa  356  5.999999999999999e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1665  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.86 
 
 		 491 aa  355  1e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.771016  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1998  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.73 
 
 		 481 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.56 
 
 		 468 aa  349  7e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.56 
 
 		 468 aa  349  7e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1805  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.13 
 
 		 616 aa  342  9e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2393  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.2 
 
 		 459 aa  335  1e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0110453  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.95 
 
 		 484 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.52 
 
 		 484 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.49 
 
 		 484 aa  333  4e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1219  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.3 
 
 		 479 aa  332  1e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0142  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.22 
 
 		 475 aa  331  2e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.262371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.15 
 
 		 468 aa  327  2.0000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.22335 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0331  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.18 
 
 		 473 aa  327  2.0000000000000001e-88  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0985  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.88 
 
 		 472 aa  325  1e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.747719 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.14 
 
 		 475 aa  324  2e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.77 
 
 		 463 aa  323  3e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.75 
 
 		 480 aa  322  7e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.354559  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29750  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.43 
 
 		 477 aa  320  3e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.913625  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.23 
 
 		 466 aa  320  5e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2813  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.51 
 
 		 466 aa  319  7.999999999999999e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1524  lipoamide dehydrogenase  39.05 
 
 		 474 aa  318  2e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2764  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.8 
 
 		 477 aa  318  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.92 
 
 		 467 aa  317  3e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1459  lipoamide dehydrogenase  38.61 
 
 		 474 aa  316  6e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.63 
 
 		 467 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.63 
 
 		 467 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0740  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.63 
 
 		 469 aa  314  2.9999999999999996e-84  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.010396  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2446  2-oxoglutarate dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  41.83 
 
 		 472 aa  312  7.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.59 
 
 		 467 aa  311  1e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.85 
 
 		 467 aa  311  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.13 
 
 		 464 aa  310  2.9999999999999997e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6299  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.28 
 
 		 625 aa  310  4e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0179219 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0048  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.93 
 
 		 472 aa  310  4e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2168  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.8 
 
 		 466 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0634  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.07 
 
 		 475 aa  309  5.9999999999999995e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000338686  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4192  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.63 
 
 		 481 aa  308  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2965  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.82 
 
 		 680 aa  307  3e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155449  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3352  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.98 
 
 		 474 aa  307  3e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000157637  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0271  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.36 
 
 		 593 aa  306  4.0000000000000004e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.146735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1241  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.94 
 
 		 599 aa  306  7e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2201  2-oxoglutarate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  39.07 
 
 		 478 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00788973  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0104  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.68 
 
 		 483 aa  305  9.000000000000001e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2501  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.74 
 
 		 478 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7193  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.06 
 
 		 619 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2076  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.78 
 
 		 588 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2011  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.3 
 
 		 478 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3911  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.31 
 
 		 475 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000450783  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1132  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.92 
 
 		 464 aa  304  3.0000000000000004e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0180  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.72 
 
 		 467 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.64 
 
 		 467 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0113  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.68 
 
 		 483 aa  303  4.0000000000000003e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1667  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.16 
 
 		 478 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164593  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>