More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_2009 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_2009  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  100 
 
 		 471 aa  925    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0690  mercuric reductase  46.45 
 
 		 481 aa  354  2e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192452  normal  0.6373 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  39.05 
 
 		 546 aa  345  1e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  42.68 
 
 		 546 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  39.31 
 
 		 546 aa  336  3.9999999999999995e-91  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  39.31 
 
 		 546 aa  336  5e-91  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  44.42 
 
 		 548 aa  333  6e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2649  mercuric reductase  44.56 
 
 		 478 aa  324  2e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0242  putative mercuric reductase  43.92 
 
 		 467 aa  323  5e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1778  mercuric reductase  40.25 
 
 		 480 aa  317  2e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.3364  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02949  putative mercuric reductase  42.65 
 
 		 503 aa  314  1.9999999999999998e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187984  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  42.33 
 
 		 767 aa  310  5e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1148  mercuric reductase  42.64 
 
 		 457 aa  306  5.0000000000000004e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  41.45 
 
 		 550 aa  306  7e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  41.68 
 
 		 767 aa  300  5e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  40.82 
 
 		 745 aa  297  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4511  mercuric reductase  38.7 
 
 		 482 aa  296  4e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955631 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1213  putative mercuric reductase  42.22 
 
 		 561 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2338  putative mercuric reductase  42.64 
 
 		 561 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0165  putative mercuric reductase  42.22 
 
 		 561 aa  295  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2512  mercuric reductase MerA  40.43 
 
 		 479 aa  295  2e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6495  putative mercuric reductase  42.43 
 
 		 561 aa  293  7e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0104  putative mercuric reductase  42.43 
 
 		 561 aa  293  7e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.57639  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6183  putative mercuric reductase  42.43 
 
 		 561 aa  293  7e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00236829  unclonable  0.0000000913433 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15460  putative mercuric reductase  42.43 
 
 		 561 aa  293  7e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000698922  unclonable  2.1869799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6174  putative mercuric reductase  42.43 
 
 		 561 aa  292  8e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00111286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5372  mercuric reductase  41.53 
 
 		 477 aa  290  3e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1298  putative mercuric reductase  43.16 
 
 		 562 aa  288  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.881891 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0090  putative mercuric reductase  43.32 
 
 		 560 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4345  putative mercuric reductase  42.16 
 
 		 561 aa  287  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2481  putative mercuric reductase  41.03 
 
 		 547 aa  288  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0761993  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0640  mercuric reductase  40.87 
 
 		 468 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2107  putative mercuric reductase  40.81 
 
 		 547 aa  286  5e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1787  putative mercuric reductase  42.06 
 
 		 561 aa  285  9e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152452  normal  0.329261 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0654  mercuric reductase  40.87 
 
 		 468 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.87809e-24 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01408  putative mercuric reductase  39.06 
 
 		 479 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2228  putative mercuric reductase  41.63 
 
 		 561 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0483  putative mercuric reductase  41.24 
 
 		 562 aa  285  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  39.57 
 
 		 475 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4010  putative mercuric reductase  40.99 
 
 		 468 aa  281  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0045  putative mercuric reductase  41.24 
 
 		 564 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00619698  normal  0.422186 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0168  putative mercuric reductase  36.69 
 
 		 550 aa  281  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4311  putative mercuric reductase  36.76 
 
 		 551 aa  280  4e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4946  mercuric reductase  38.95 
 
 		 476 aa  280  4e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104965  decreased coverage  0.00400898 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2133  putative mercuric reductase  41.03 
 
 		 564 aa  280  6e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2758  putative mercuric reductase  41.37 
 
 		 468 aa  278  1e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0840  mercuric reductase  38.79 
 
 		 469 aa  277  3e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1209  mercuric reductase  40.79 
 
 		 565 aa  277  3e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.375903  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06150  mercuric reductase  40.51 
 
 		 474 aa  276  8e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02044  putative mercuric reductase  36.97 
 
 		 479 aa  274  2.0000000000000002e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.985853  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25620  mercuric reductase  40.3 
 
 		 474 aa  275  2.0000000000000002e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0177  mercuric reductase MerA  37.01 
 
 		 469 aa  271  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3488  putative mercuric reductase  37.58 
 
 		 552 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.852286  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3213  mercuric reductase  38.79 
 
 		 467 aa  270  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163863  normal  0.231896 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4465  mercuric reductase  39.83 
 
 		 476 aa  269  5.9999999999999995e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4296  mercuric reductase  39.83 
 
 		 476 aa  269  5.9999999999999995e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4196  mercuric reductase  39.83 
 
 		 476 aa  269  5.9999999999999995e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1340  putative mercuric reductase  39.82 
 
 		 562 aa  269  7e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.657387  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3424  mercuric reductase  37.34 
 
 		 468 aa  268  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1241  mercuric reductase  35.71 
 
 		 448 aa  267  2.9999999999999995e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.446801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1341  putative mercuric reductase  40.84 
 
 		 541 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.183471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1504  mercuric reductase  35.37 
 
 		 453 aa  266  7e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.25653 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0504  mercuric reductase  34.21 
 
 		 449 aa  266  8e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2329  mercuric reductase  39.35 
 
 		 476 aa  265  1e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1158  mercuric reductase  38.88 
 
 		 484 aa  260  3e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0843858  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3663  mercuric reductase  40.35 
 
 		 458 aa  260  4e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1388  mercuric reductase  38.22 
 
 		 557 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000433137  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1213  mercuric reductase  33.64 
 
 		 464 aa  243  7e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.18 
 
 		 475 aa  238  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.55 
 
 		 473 aa  237  4e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0352  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.54 
 
 		 475 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2847  mercuric reductase  33.19 
 
 		 484 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0473  mercuric reductase  34.27 
 
 		 507 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000001036 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1504  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.06 
 
 		 462 aa  232  1e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.515089  normal  0.0466141 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.73 
 
 		 484 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.51 
 
 		 484 aa  230  4e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.55 
 
 		 463 aa  230  5e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0751  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.81 
 
 		 473 aa  230  5e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4940  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.26 
 
 		 472 aa  230  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.38 
 
 		 712 aa  229  6e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0433  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.39 
 
 		 475 aa  228  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000206937 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1998  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.77 
 
 		 481 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.29 
 
 		 484 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0304  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.37 
 
 		 474 aa  227  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05840  dihydrolipoyl dehydrogenase, putative  34.49 
 
 		 511 aa  227  5.0000000000000005e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.465888  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.47 
 
 		 475 aa  226  6e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2454  dihydrolipoamide dehydrogenase  36 
 
 		 579 aa  226  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3049  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.2 
 
 		 472 aa  225  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0397378  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2994  mercuric reductase  32.44 
 
 		 485 aa  224  2e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.26 
 
 		 475 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.76 
 
 		 467 aa  224  3e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.6 
 
 		 465 aa  224  3e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.96 
 
 		 458 aa  223  4e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1118  mercuric reductase  32.54 
 
 		 516 aa  223  4e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.583122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.72 
 
 		 463 aa  223  4e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7193  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.08 
 
 		 619 aa  223  6e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6299  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.13 
 
 		 625 aa  222  9e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0179219 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2393  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.68 
 
 		 459 aa  222  9e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0110453  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1241  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.78 
 
 		 599 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0321  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.75 
 
 		 476 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0683294 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>