More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4196 on replicon NC_008539
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_25620  mercuric reductase  74 
 
 
474 aa  642    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4511  mercuric reductase  75 
 
 
482 aa  703    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955631 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4946  mercuric reductase  77.54 
 
 
476 aa  697    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104965  decreased coverage  0.00400898 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06150  mercuric reductase  74 
 
 
474 aa  642    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4465  mercuric reductase  100 
 
 
476 aa  948    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4296  mercuric reductase  100 
 
 
476 aa  948    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4196  mercuric reductase  100 
 
 
476 aa  948    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1778  mercuric reductase  72.88 
 
 
480 aa  676    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.3364  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3213  mercuric reductase  67.72 
 
 
467 aa  599  1e-170  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163863  normal  0.231896 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0690  mercuric reductase  57.93 
 
 
481 aa  489  1e-137  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192452  normal  0.6373 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2649  mercuric reductase  57.02 
 
 
478 aa  478  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5372  mercuric reductase  55.23 
 
 
477 aa  464  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  50.21 
 
 
548 aa  403  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  44.77 
 
 
546 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  42.47 
 
 
546 aa  390  1e-107  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  42.47 
 
 
546 aa  388  1e-107  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0242  putative mercuric reductase  45.91 
 
 
467 aa  379  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1158  mercuric reductase  47.05 
 
 
484 aa  377  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0843858  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  45.59 
 
 
546 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  46.93 
 
 
550 aa  374  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02949  putative mercuric reductase  45.7 
 
 
503 aa  370  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187984  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2758  putative mercuric reductase  46 
 
 
468 aa  355  7.999999999999999e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3663  mercuric reductase  45.96 
 
 
458 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4010  putative mercuric reductase  44.96 
 
 
468 aa  353  5e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  42.26 
 
 
475 aa  343  5e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  41.51 
 
 
767 aa  330  3e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1298  putative mercuric reductase  44.12 
 
 
562 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.881891 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  41.35 
 
 
767 aa  325  8.000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  41.18 
 
 
745 aa  325  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1213  putative mercuric reductase  42.98 
 
 
561 aa  323  4e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01408  putative mercuric reductase  42.32 
 
 
479 aa  323  4e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4311  putative mercuric reductase  41.6 
 
 
551 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1341  putative mercuric reductase  44.25 
 
 
541 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.183471  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2481  putative mercuric reductase  41.56 
 
 
547 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0761993  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0168  putative mercuric reductase  40.51 
 
 
550 aa  320  3e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2338  putative mercuric reductase  42.77 
 
 
561 aa  320  5e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243851  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2107  putative mercuric reductase  41.35 
 
 
547 aa  319  7e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6495  putative mercuric reductase  42.56 
 
 
561 aa  318  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0104  putative mercuric reductase  42.56 
 
 
561 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.57639  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6174  putative mercuric reductase  42.56 
 
 
561 aa  317  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00111286  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6183  putative mercuric reductase  42.56 
 
 
561 aa  318  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00236829  unclonable  0.0000000913433 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15460  putative mercuric reductase  42.56 
 
 
561 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000698922  unclonable  2.1869799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2329  mercuric reductase  41.29 
 
 
476 aa  317  4e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0165  putative mercuric reductase  42.56 
 
 
561 aa  316  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1148  mercuric reductase  42.74 
 
 
457 aa  315  8e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2228  putative mercuric reductase  42.49 
 
 
561 aa  315  8e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4345  putative mercuric reductase  42.56 
 
 
561 aa  315  9e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2512  mercuric reductase MerA  41.56 
 
 
479 aa  315  9e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1340  putative mercuric reductase  43.7 
 
 
562 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.657387  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0045  putative mercuric reductase  42.16 
 
 
564 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00619698  normal  0.422186 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2133  putative mercuric reductase  42.16 
 
 
564 aa  312  1e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1209  mercuric reductase  41.56 
 
 
565 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.375903  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0483  putative mercuric reductase  41.51 
 
 
562 aa  304  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1787  putative mercuric reductase  42.55 
 
 
561 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152452  normal  0.329261 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0090  putative mercuric reductase  42.19 
 
 
560 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02044  putative mercuric reductase  38.95 
 
 
479 aa  301  2e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.985853  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3424  mercuric reductase  38.25 
 
 
468 aa  297  3e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0640  mercuric reductase  38.78 
 
 
468 aa  297  3e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1388  mercuric reductase  43.63 
 
 
557 aa  296  6e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000433137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0654  mercuric reductase  38.78 
 
 
468 aa  294  3e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.87809e-24 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3488  putative mercuric reductase  40.68 
 
 
552 aa  294  3e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.852286  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0177  mercuric reductase MerA  37.16 
 
 
469 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0840  mercuric reductase  37.27 
 
 
469 aa  282  1e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2847  mercuric reductase  36.12 
 
 
484 aa  271  1e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2994  mercuric reductase  36.16 
 
 
485 aa  268  2e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2009  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  39.83 
 
 
471 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1241  mercuric reductase  36.89 
 
 
448 aa  257  3e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.446801  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1504  mercuric reductase  36.17 
 
 
453 aa  256  7e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.25653 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0504  mercuric reductase  35.31 
 
 
449 aa  256  8e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1504  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.92 
 
 
462 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.515089  normal  0.0466141 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4668  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.43 
 
 
482 aa  240  4e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0315  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.04 
 
 
471 aa  232  1e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.85 
 
 
456 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4961  mercuric reductase  31.29 
 
 
460 aa  229  6e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  33.02 
 
 
460 aa  229  7e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26432  dihydrolipoyl dehydrogenase  32.54 
 
 
500 aa  229  8e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1213  mercuric reductase  32.68 
 
 
464 aa  229  1e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2549  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.47 
 
 
471 aa  228  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1205  mercuric reductase  37.09 
 
 
464 aa  228  2e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.295648  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3749  mercuric reductase  33.33 
 
 
510 aa  227  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1956  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.19 
 
 
480 aa  227  4e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.97 
 
 
468 aa  226  6e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0898  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.02 
 
 
508 aa  226  7e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00115945 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3468  mercuric reductase  36.93 
 
 
457 aa  224  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211907  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  32.35 
 
 
468 aa  223  4e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1976  mercuric reductase  33.62 
 
 
515 aa  223  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121394  normal  0.267836 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4228  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.25 
 
 
482 aa  222  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1463  mercuric reductase, putative  33.2 
 
 
486 aa  220  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0144411  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3049  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.12 
 
 
472 aa  220  5e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0397378  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1459  mercuric reductase  37.5 
 
 
464 aa  220  5e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2088  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.18 
 
 
484 aa  219  6e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0352  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.54 
 
 
475 aa  219  7.999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1498  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34 
 
 
488 aa  218  1e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000511741  hitchhiker  0.0000458564 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2206  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.04 
 
 
459 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.041685  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1598  mercuric reductase  33.68 
 
 
510 aa  218  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4636  mercuric reductase  33.25 
 
 
458 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.295825 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.75 
 
 
712 aa  217  4e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  32.41 
 
 
714 aa  216  5.9999999999999996e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6744  mercuric reductase  32.88 
 
 
453 aa  216  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.520469  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.13 
 
 
713 aa  216  7e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>