More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0643 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4955  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  68.34 
 
 		 452 aa  642    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201124  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3544  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  75.55 
 
 		 455 aa  705    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0643  NADPH-glutathione reductase  100 
 
 		 459 aa  936    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1608  glutathione reductase  56.02 
 
 		 452 aa  518  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128494  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1875  NADPH-glutathione reductase  57.24 
 
 		 454 aa  499  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105853  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2351  glutathione reductase  55.36 
 
 		 452 aa  501  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150308  normal  0.0125633 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4254  glutathione reductase  53.63 
 
 		 466 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3263  glutathione reductase  55.36 
 
 		 451 aa  485  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1851  glutathione reductase  53.29 
 
 		 449 aa  484  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.893411 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3000  glutathione-disulfide reductase  55.16 
 
 		 451 aa  483  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.637847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38330  glutathione reductase  55.14 
 
 		 451 aa  482  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0328915 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2124  NADPH-glutathione reductase  52.85 
 
 		 459 aa  476  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.575049  normal  0.929555 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2928  glutathione reductase  55.02 
 
 		 452 aa  478  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00793619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1359  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  53.04 
 
 		 453 aa  477  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.485419  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25010  glutathione reductase  55.04 
 
 		 452 aa  474  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6352  NADPH-glutathione reductase  54.17 
 
 		 452 aa  471  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3006  glutathione-disulfide reductase  54.29 
 
 		 451 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2392  glutathione reductase  54.29 
 
 		 451 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2915  glutathione-disulfide reductase  53.63 
 
 		 451 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3819  glutathione reductase  53.98 
 
 		 451 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218299  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3025  glutathione-disulfide reductase  53.85 
 
 		 451 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0272  glutathione-disulfide reductase  53.86 
 
 		 453 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2363  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  49.56 
 
 		 457 aa  465  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.651152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1950  glutathione reductase  54.2 
 
 		 451 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.447652  normal  0.37845 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3050  glutathione-disulfide reductase  53.41 
 
 		 451 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2063  glutathione-disulfide reductase  52.76 
 
 		 453 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3362  glutathione-disulfide reductase  52.76 
 
 		 453 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3535  glutathione reductase  53.1 
 
 		 451 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669246 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0498  glutathione-disulfide reductase  52.76 
 
 		 453 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2222  glutathione-disulfide reductase  52.76 
 
 		 453 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.363669  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3188  glutathione reductase  52.88 
 
 		 451 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3030  glutathione-disulfide reductase  52.76 
 
 		 453 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.944241  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0303  glutathione-disulfide reductase  52.76 
 
 		 453 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0317  glutathione-disulfide reductase  52.76 
 
 		 453 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2979  glutathione reductase  53.83 
 
 		 452 aa  458  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0361278  normal  0.327486 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3112  glutathione reductase  53.17 
 
 		 452 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.091737  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1485  NADPH-glutathione reductase  50.33 
 
 		 449 aa  449  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1095  glutathione-disulfide reductase  47.29 
 
 		 460 aa  445  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.223789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0682  NADPH-glutathione reductase  50.11 
 
 		 459 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0286379  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5726  glutathione-disulfide reductase  49.35 
 
 		 451 aa  447  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4332  glutathione reductase  47.69 
 
 		 451 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0404  glutathione reductase  48.57 
 
 		 450 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0414  glutathione reductase  48.57 
 
 		 450 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.263005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2696  glutathione-disulfide reductase  50.76 
 
 		 460 aa  437  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719185  normal  0.0349203 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1216  glutathione reductase  48.36 
 
 		 448 aa  431  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.286586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4780  glutathione-disulfide reductase  50 
 
 		 466 aa  426  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325962  normal  0.417103 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0881  glutathione-disulfide reductase  50.33 
 
 		 470 aa  424  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.449296  normal  0.121667 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3039  glutathione-disulfide reductase  46.04 
 
 		 450 aa  423  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3384  glutathione reductase  48.8 
 
 		 461 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0477625 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2244  glutathione reductase  46.67 
 
 		 458 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2057  glutathione reductase  48.58 
 
 		 461 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2002  glutathione-disulfide reductase  47.7 
 
 		 452 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2196  glutathione-disulfide reductase  48.8 
 
 		 461 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4666  glutathione-disulfide reductase  47.92 
 
 		 466 aa  414  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0358  NADPH-glutathione reductase  47.48 
 
 		 452 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0122  glutathione-disulfide reductase  47.59 
 
 		 474 aa  409  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3544  glutathione-disulfide reductase  46.44 
 
 		 464 aa  408  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.562382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1223  glutathione reductase  47.92 
 
 		 460 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2094  glutathione reductase  45.53 
 
 		 464 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1482  glutathione reductase  47.49 
 
 		 461 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.327802  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4747  glutathione reductase  45.35 
 
 		 447 aa  408  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0884  glutathione-disulfide reductase  47.05 
 
 		 452 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.508454 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0434  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  47.51 
 
 		 466 aa  403  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.531083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0978  glutathione reductase  46.2 
 
 		 464 aa  403  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200707  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2301  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  47.38 
 
 		 466 aa  403  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0108496  hitchhiker  0.00487639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3485  NADPH-glutathione reductase  47.38 
 
 		 461 aa  402  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.749861  normal  0.666668 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24082  glutathione reductase  45.53 
 
 		 519 aa  402  1e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2257  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  47.16 
 
 		 466 aa  402  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0633588  normal  0.450823 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2576  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  47.38 
 
 		 461 aa  403  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.213625 
 
 
-
 
NC_004310  BR1012  glutathione reductase  45.99 
 
 		 464 aa  401  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.853309  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1957  NADPH-glutathione reductase  47.92 
 
 		 451 aa  400  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.168279 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0973  NADPH-glutathione reductase  45.1 
 
 		 462 aa  397  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3669  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  46.62 
 
 		 466 aa  394  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0842  glutathione reductase  44.59 
 
 		 446 aa  390  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.118007 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0604  glutathione reductase  44.52 
 
 		 461 aa  389  1e-107  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.633864  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2009  glutathione reductase  46.96 
 
 		 461 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3224  glutathione-disulfide reductase  45.02 
 
 		 455 aa  386  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.354787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1981  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  47.56 
 
 		 461 aa  387  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2078  glutathione reductase  47.06 
 
 		 461 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.16044 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1461  glutathione reductase  45.63 
 
 		 460 aa  382  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2085  glutathione reductase  44.9 
 
 		 462 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2737  glutathione reductase  44.65 
 
 		 483 aa  379  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.482914  normal  0.0373517 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2228  glutathione reductase  45.75 
 
 		 461 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.941122  normal  0.773983 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1810  NADPH-glutathione reductase  43.67 
 
 		 453 aa  380  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.251452  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3174  NADPH-glutathione reductase  44.99 
 
 		 484 aa  380  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2516  glutathione-disulfide reductase  44.91 
 
 		 446 aa  381  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3289  glutathione reductase  42.58 
 
 		 459 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1571  glutathione reductase  46.09 
 
 		 463 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.483199  normal  0.747799 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2722  NADPH-glutathione reductase  44.3 
 
 		 448 aa  365  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.256149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2534  NADPH-glutathione reductase  44.35 
 
 		 451 aa  359  5e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23107 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0127  glutathione-disulfide reductase  42.22 
 
 		 448 aa  346  6e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35819  glutathione reductase  42.27 
 
 		 496 aa  345  1e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  40.22 
 
 		 457 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01560  glutathione-disulfide reductase, putative  41.74 
 
 		 479 aa  342  5.999999999999999e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0140  glutathione reductase  38.9 
 
 		 456 aa  338  9.999999999999999e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0121  glutathione reductase  40.22 
 
 		 451 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0507  glutathione-disulfide reductase  41.5 
 
 		 452 aa  337  1.9999999999999998e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.243892  normal  0.086285 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0142  glutathione reductase  39.78 
 
 		 451 aa  336  7e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3660  glutathione reductase  39.78 
 
 		 451 aa  333  5e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.150077  normal  0.767021 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4068  glutathione reductase  40.22 
 
 		 451 aa  330  3e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>