More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1492 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1492  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 102 aa  201  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1467  heavy metal transport/detoxification protein  45.63 
 
 		 97 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2344  heavy metal transport/detoxification protein  45.54 
 
 		 100 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177246  normal  0.640868 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1705  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0720999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5319  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4520  heavy metal transport/detoxification protein  43.69 
 
 		 97 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0090  heavy metal transport/detoxification protein  50.82 
 
 		 72 aa  63.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1102  heavy metal translocating P-type ATPase  42.42 
 
 		 847 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.165186  normal  0.905045 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  45.45 
 
 		 68 aa  60.5  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  48.48 
 
 		 792 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  48.48 
 
 		 792 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1195  heavy metal translocating P-type ATPase  40.91 
 
 		 847 aa  60.5  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21010  copper-translocating P-type ATPase  46.58 
 
 		 829 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4090  heavy metal translocating P-type ATPase  45.59 
 
 		 813 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.670864 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1274  cation-transporting ATPase lipoprotein transmembrane  42.42 
 
 		 851 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  47.06 
 
 		 67 aa  59.3  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  47.69 
 
 		 833 aa  59.3  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5366  heavy metal translocating P-type ATPase  43.02 
 
 		 1021 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5494  heavy metal translocating P-type ATPase  43.02 
 
 		 1021 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0117323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5724  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 		 839 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.788276 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0024  heavy metal translocating P-type ATPase  41.56 
 
 		 757 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0031  heavy metal translocating P-type ATPase  57.78 
 
 		 747 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1259  heavy metal translocating P-type ATPase  49.21 
 
 		 834 aa  57.8  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.499676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0926  Heavy metal transport/detoxification protein  44.78 
 
 		 68 aa  57  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1110  heavy metal translocating P-type ATPase  43.75 
 
 		 938 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0214095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2938  copper-translocating P-type ATPase  46.97 
 
 		 795 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0325  heavy metal translocating P-type ATPase  48.39 
 
 		 821 aa  56.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  45.16 
 
 		 836 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  45.95 
 
 		 852 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  45.16 
 
 		 836 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  45.31 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  47.62 
 
 		 69 aa  55.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  45.31 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  45.31 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4777  heavy metal translocating P-type ATPase  40.96 
 
 		 1013 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0661  copper-translocating P-type ATPase  47.76 
 
 		 797 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  39.39 
 
 		 68 aa  55.1  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  44.12 
 
 		 69 aa  55.5  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1695  Heavy metal transport/detoxification protein  55.32 
 
 		 69 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.583772  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  45.45 
 
 		 841 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  37.31 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3376  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  56.82 
 
 		 819 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4872  heavy metal translocating P-type ATPase  39.68 
 
 		 816 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  37.31 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  37.31 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  45.21 
 
 		 833 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3759  copper-ion-binding protein  35.29 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206021  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3543  heavy metal translocating P-type ATPase  39.33 
 
 		 740 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3217  heavy metal translocating P-type ATPase  44.44 
 
 		 741 aa  53.9  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  45.07 
 
 		 835 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3535  copper-translocating P-type ATPase  44.16 
 
 		 739 aa  53.9  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.253095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1555  heavy metal transport/detoxification protein  29.17 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2317  heavy metal translocating P-type ATPase  40.3 
 
 		 829 aa  53.9  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2466  heavy metal translocating P-type ATPase  47.62 
 
 		 745 aa  53.9  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.392778  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0625  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 799 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0643992  normal  0.943938 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3027  copper-translocating P-type ATPase  40.62 
 
 		 939 aa  53.5  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  42.42 
 
 		 767 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0586  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 799 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  43.55 
 
 		 826 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3576  copper-ion-binding protein  35.29 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000264411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3476  copper-ion-binding protein  35.29 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3488  copper-ion-binding protein  35.29 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000382962  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1638  putative MerP, periplasmic heavy metal binding/chaperone protein  32.39 
 
 		 74 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.240185  hitchhiker  0.000119681 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  43.66 
 
 		 68 aa  53.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  41.86 
 
 		 1182 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  42.42 
 
 		 762 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1291  Heavy metal transport/detoxification protein  39.13 
 
 		 69 aa  52.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3860  copper-ion-binding protein  35.29 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00109748  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0633  heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 		 65 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319984 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3742  copper-ion-binding protein  35.29 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000142681 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  42.42 
 
 		 762 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  42.42 
 
 		 762 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  43.75 
 
 		 836 aa  53.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0821  heavy metal translocating P-type ATPase  43.08 
 
 		 790 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0521  heavy metal translocating P-type ATPase  46.27 
 
 		 807 aa  52.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  36.78 
 
 		 827 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0460  heavy metal translocating P-type ATPase  34.85 
 
 		 748 aa  52.4  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.792118  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0631  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 800 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735513 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0924  heavy metal translocating P-type ATPase  43.75 
 
 		 835 aa  52.4  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1340  mercuric transport protein periplasmic protein  36.99 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.023175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  41.27 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  44.26 
 
 		 71 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0131  Heavy metal transport/detoxification protein  39.71 
 
 		 67 aa  52  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0037  heavy metal translocating P-type ATPase  45.45 
 
 		 782 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.374671  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4578  heavy metal translocating P-type ATPase  40.91 
 
 		 799 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530867  decreased coverage  0.00687508 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  35.82 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  42.86 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1872  heavy metal transport/detoxification protein  32.39 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.230412  unclonable  0.0000667879 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  40.91 
 
 		 762 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2080  heavy metal translocating P-type ATPase  34.38 
 
 		 814 aa  52.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0351429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  41.79 
 
 		 69 aa  52.8  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  40.62 
 
 		 855 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3165  copper exporting ATPase  40.26 
 
 		 961 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.517155  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  40.85 
 
 		 1071 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0019  heavy metal translocating P-type ATPase  45.45 
 
 		 782 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1666  copper ion binding protein  32.35 
 
 		 73 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1265  copper exporting ATPase  40.26 
 
 		 955 aa  52.4  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.057349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0588  heavy metal transport/detoxification protein  41.27 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1916  copper-translocating P-type ATPase  39.71 
 
 		 791 aa  51.6  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1659  copper ion binding protein  41.54 
 
 		 75 aa  51.6  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.842806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>