265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3891 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 77 aa  152  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4497  heavy metal transport/detoxification protein  52.94 
 
 		 69 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.499051 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1468  heavy metal transport/detoxification protein  54.41 
 
 		 70 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4552  heavy metal transport/detoxification protein  56.72 
 
 		 70 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1450  heavy metal transport/detoxification protein  54.41 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  57.75 
 
 		 76 aa  76.3  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0674  Heavy metal transport/detoxification protein  58.73 
 
 		 68 aa  72.8  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  59.68 
 
 		 69 aa  73.2  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4098  heavy metal transport/detoxification protein  52.94 
 
 		 76 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  53.85 
 
 		 69 aa  72  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2847  heavy metal transport/detoxification protein  52.17 
 
 		 115 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.179669 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  59.68 
 
 		 69 aa  71.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19780  copper chaperone  53.85 
 
 		 71 aa  69.7  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208404  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  57.38 
 
 		 71 aa  69.7  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6797  Heavy metal transport/detoxification protein  55.56 
 
 		 70 aa  70.1  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0910  heavy metal transport/detoxification protein  57.14 
 
 		 70 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  56.25 
 
 		 68 aa  68.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  52.31 
 
 		 78 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2471  Heavy metal transport/detoxification protein  54.84 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  55.93 
 
 		 70 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  53.97 
 
 		 69 aa  65.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  51.56 
 
 		 69 aa  65.5  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  53.73 
 
 		 68 aa  65.5  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36750  copper chaperone  51.61 
 
 		 68 aa  64.7  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  47.76 
 
 		 69 aa  63.9  0.0000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2601  Heavy metal transport/detoxification protein  48.48 
 
 		 68 aa  63.9  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854669  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4548  Heavy metal transport/detoxification protein  57.89 
 
 		 70 aa  63.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  46.97 
 
 		 68 aa  62.8  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3258  Heavy metal transport/detoxification protein  49.25 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4448  heavy metal transport/detoxification protein  51.56 
 
 		 67 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  53.12 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2500  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.711261 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1741  Heavy metal transport/detoxification protein  50.77 
 
 		 73 aa  60.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246039  decreased coverage  0.0020488 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3872  Heavy metal transport/detoxification protein  45.57 
 
 		 79 aa  60.8  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330902 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  41.18 
 
 		 76 aa  60.5  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3704  hypothetical protein  54.1 
 
 		 99 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660005  normal  0.139636 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4588  heavy metal transport/detoxification protein  48.48 
 
 		 73 aa  60.1  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  50.82 
 
 		 954 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1695  Heavy metal transport/detoxification protein  59.68 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.583772  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36140  copper chaperone  46.88 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.237573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0783  Heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 		 69 aa  57.8  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.591809  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1021  heavy metal transport/detoxification protein  42.42 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0015  hypothetical protein  50.82 
 
 		 93 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3668  Heavy metal transport/detoxification protein  47.14 
 
 		 74 aa  57.4  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5705  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 80 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5304  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 80 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562582  normal  0.337627 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  42.19 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3354  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 66 aa  57  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.702383 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3759  copper-ion-binding protein  44.26 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206021  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5745  heavy metal transport/detoxification protein  53.57 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0823  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 83 aa  57  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3669  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 80 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.792064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0033  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 65 aa  57  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0036  Heavy metal transport/detoxification protein  46.77 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.749635  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  41.27 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0143  Heavy metal transport/detoxification protein  46.77 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  44.26 
 
 		 68 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3576  copper-ion-binding protein  44.26 
 
 		 68 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000264411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3476  copper-ion-binding protein  44.26 
 
 		 68 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3488  copper-ion-binding protein  44.26 
 
 		 68 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000382962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3860  copper-ion-binding protein  44.26 
 
 		 68 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00109748  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  44.26 
 
 		 68 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0030  Heavy metal transport/detoxification protein  46.77 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3742  copper-ion-binding protein  44.26 
 
 		 68 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000142681 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  44.26 
 
 		 68 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  46.77 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0014  copper ion binding protein  52.38 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0614  heavy metal translocating P-type ATPase  39.06 
 
 		 726 aa  53.9  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000274586  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4020  Heavy metal transport/detoxification protein  43.08 
 
 		 76 aa  53.9  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.343869 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3894  heavy metal transport/detoxification protein  42.86 
 
 		 73 aa  53.9  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.739174  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0018  heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0600  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 720 aa  53.1  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000362838  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9003  hypothetical protein  55.56 
 
 		 67 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.961553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  36.76 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6127  heavy metal transport/detoxification protein  57.14 
 
 		 74 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0154405  normal  0.535186 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  44.26 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0035  heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 		 64 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  44.26 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  38.46 
 
 		 65 aa  51.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0489  heavy metal transport/detoxification protein  48.33 
 
 		 74 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0141  Heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3787  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 72 aa  51.6  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2279  copper ion binding protein  35.94 
 
 		 69 aa  51.6  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0115  Heavy metal transport/detoxification protein  43.75 
 
 		 73 aa  51.6  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  42.86 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  36.36 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0131  Heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2139  heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18380  copper chaperone  44.78 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1851  copper-translocating P-type ATPase  43.33 
 
 		 1061 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.845444  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0854  copper-translocating P-type ATPase  43.33 
 
 		 1061 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1144  copper-translocating P-type ATPase  43.33 
 
 		 1063 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0405  cation-transporting ATPase membrane protein  43.33 
 
 		 1061 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  40.91 
 
 		 889 aa  50.8  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  35.94 
 
 		 835 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21360  copper chaperone  50 
 
 		 72 aa  50.4  0.000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.883325  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0467  Heavy metal transport/detoxification protein  42.86 
 
 		 70 aa  50.4  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  37.1 
 
 		 730 aa  50.4  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3412  copper ion binding protein  44.07 
 
 		 74 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0277616 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1755  copper-translocating P-type ATPase  43.33 
 
 		 1061 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>