More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1697 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1697  copper ion-binding  100 
 
 
69 aa  137  4.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000580158  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  49.23 
 
 
71 aa  76.6  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1809  copper ion binding protein  52.24 
 
 
75 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.865359  normal  0.918649 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1149  copper ion binding protein  46.97 
 
 
74 aa  74.7  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1163  copper ion binding protein  43.94 
 
 
74 aa  72  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  50 
 
 
68 aa  71.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  44.62 
 
 
67 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  44.78 
 
 
77 aa  69.3  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  44.12 
 
 
68 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  44.12 
 
 
68 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1882  mercury ion binding protein  42.65 
 
 
68 aa  66.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.174635  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  43.28 
 
 
68 aa  64.7  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  44.78 
 
 
837 aa  63.9  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  45.16 
 
 
67 aa  63.5  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  38.46 
 
 
67 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  38.46 
 
 
67 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  44.44 
 
 
70 aa  61.6  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2139  heavy metal transport/detoxification protein  44.12 
 
 
66 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  40.3 
 
 
68 aa  61.2  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  41.79 
 
 
68 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  41.79 
 
 
68 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  41.79 
 
 
68 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3576  copper-ion-binding protein  41.79 
 
 
68 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000264411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3476  copper-ion-binding protein  41.79 
 
 
68 aa  60.5  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3488  copper-ion-binding protein  41.79 
 
 
68 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000382962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3860  copper-ion-binding protein  41.79 
 
 
68 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00109748  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3742  copper-ion-binding protein  41.79 
 
 
68 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000142681 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  40.62 
 
 
67 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  38.46 
 
 
818 aa  58.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  40.3 
 
 
68 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1715  copper ion binding protein  41.67 
 
 
77 aa  58.2  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0879446  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3759  copper-ion-binding protein  40.3 
 
 
68 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206021  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1873  heavy metal translocating P-type ATPase  42.19 
 
 
821 aa  57.8  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0119  heavy metal translocating P-type ATPase  39.06 
 
 
816 aa  57  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  35.82 
 
 
817 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  39.39 
 
 
67 aa  57  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  46.03 
 
 
839 aa  56.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  37.88 
 
 
861 aa  55.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  40 
 
 
799 aa  55.5  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  38.24 
 
 
797 aa  55.1  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  38.81 
 
 
826 aa  55.1  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  39.39 
 
 
867 aa  54.7  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3872  Heavy metal transport/detoxification protein  45.45 
 
 
79 aa  54.3  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330902 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0933  heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 
96 aa  54.7  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1856  copper-translocating P-type ATPase  39.06 
 
 
890 aa  54.3  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  38.33 
 
 
1087 aa  53.9  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0143  heavy metal translocating P-type ATPase  36.51 
 
 
871 aa  53.5  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  34.85 
 
 
894 aa  52.8  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  39.06 
 
 
836 aa  53.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1233  hypothetical protein  38.46 
 
 
810 aa  52.8  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0113  mercuric transport protein periplasmic component  38.46 
 
 
91 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.827734  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28495  copper-transporting P-type ATPase  35.82 
 
 
804 aa  53.1  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.105447  normal  0.5687 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  43.75 
 
 
827 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1659  copper ion binding protein  35.82 
 
 
75 aa  52.4  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.842806 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  41.67 
 
 
889 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  37.88 
 
 
849 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0205  heavy metal translocating P-type ATPase  31.82 
 
 
823 aa  52  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3535  copper-translocating P-type ATPase  44.44 
 
 
739 aa  51.6  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.253095  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1686  heavy metal translocating P-type ATPase  35.29 
 
 
811 aa  51.2  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2021  copper-translocating P-type ATPase  35.29 
 
 
811 aa  51.2  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1666  copper ion binding protein  34.85 
 
 
73 aa  51.2  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121778  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1871  heavy metal translocating P-type ATPase  39.39 
 
 
866 aa  51.2  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000734074  normal  0.315442 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  32.81 
 
 
889 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  35.94 
 
 
942 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  38.46 
 
 
793 aa  50.8  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2690  heavy metal translocating P-type ATPase  40.98 
 
 
832 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2917  heavy metal translocating P-type ATPase  40.98 
 
 
832 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1274  cation-transporting ATPase lipoprotein transmembrane  35.38 
 
 
851 aa  50.4  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  34.92 
 
 
954 aa  50.4  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2460  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
836 aa  50.4  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00836136  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0789  heavy metal translocating P-type ATPase  35.48 
 
 
820 aa  50.4  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.222821 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2405  heavy metal transport/detoxification protein  27.94 
 
 
68 aa  50.4  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4872  heavy metal translocating P-type ATPase  40.98 
 
 
816 aa  50.4  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1389  Mercuric transport protein MerT  35.38 
 
 
209 aa  50.4  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000264548  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0021  copper ion binding protein  37.5 
 
 
70 aa  50.4  0.000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00208737  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2271  mercuric transport protein periplasmic component  35.38 
 
 
94 aa  50.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.618304  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1663  PBP/HMA domain-containing protein  36.92 
 
 
94 aa  50.1  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140862  normal  0.759256 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4098  heavy metal transport/detoxification protein  42.42 
 
 
76 aa  50.1  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09570  copper chaperone  36.51 
 
 
75 aa  50.1  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.344611  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  34.33 
 
 
806 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  34.33 
 
 
805 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  34.33 
 
 
806 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  34.33 
 
 
805 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  34.33 
 
 
805 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  34.33 
 
 
805 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  34.33 
 
 
805 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  34.33 
 
 
805 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  37.31 
 
 
817 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2454  heavy metal translocating P-type ATPase  38.33 
 
 
824 aa  50.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000374704  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2381  heavy metal translocating P-type ATPase  35.38 
 
 
772 aa  49.7  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  34.33 
 
 
805 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  33.85 
 
 
752 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2770  protein of unknown function DUF182  40 
 
 
345 aa  50.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  34.33 
 
 
806 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0905  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
802 aa  50.1  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.631984  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  35.82 
 
 
837 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  38.81 
 
 
837 aa  49.7  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  35.38 
 
 
798 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1548  copper-translocating P-type ATPase  40 
 
 
813 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0486383 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0239  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  33.85 
 
 
94 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>