More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_28495 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_28495  copper-transporting P-type ATPase  100 
 
 
804 aa  1645    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.105447  normal  0.5687 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  28.52 
 
 
753 aa  334  3e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  29.6 
 
 
827 aa  334  4e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  28.94 
 
 
838 aa  334  5e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  29.72 
 
 
826 aa  333  6e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  28.45 
 
 
798 aa  331  3e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  29.04 
 
 
836 aa  331  3e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  27.73 
 
 
759 aa  330  8e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  27.73 
 
 
759 aa  330  8e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0212  copper-translocating P-type ATPase  29.95 
 
 
759 aa  327  7e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  29.08 
 
 
839 aa  325  2e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  29.57 
 
 
743 aa  325  3e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  27.2 
 
 
752 aa  323  7e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  28.04 
 
 
818 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  28.21 
 
 
797 aa  321  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  29.17 
 
 
827 aa  320  9e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  27.71 
 
 
750 aa  318  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  29.04 
 
 
836 aa  318  4e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  28.54 
 
 
815 aa  317  6e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  28.26 
 
 
798 aa  317  7e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  28.26 
 
 
798 aa  317  7e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  29.43 
 
 
833 aa  316  9.999999999999999e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  27.78 
 
 
837 aa  313  9e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3106  copper-translocating P-type ATPase  28.26 
 
 
742 aa  313  9e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138352  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  28.66 
 
 
828 aa  311  2.9999999999999997e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  28.42 
 
 
802 aa  311  2.9999999999999997e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  28.42 
 
 
802 aa  311  2.9999999999999997e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  28.68 
 
 
762 aa  310  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  29.22 
 
 
833 aa  310  5.9999999999999995e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  28.72 
 
 
797 aa  310  6.999999999999999e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  28.59 
 
 
828 aa  310  6.999999999999999e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  28.89 
 
 
841 aa  310  9e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  28.19 
 
 
794 aa  309  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  28.02 
 
 
796 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  27.85 
 
 
826 aa  309  1.0000000000000001e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  27.63 
 
 
852 aa  307  4.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  28.68 
 
 
767 aa  307  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  29.04 
 
 
839 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  28.55 
 
 
762 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  27.88 
 
 
1087 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  28.55 
 
 
762 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  28.55 
 
 
762 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  27.55 
 
 
849 aa  304  4.0000000000000003e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  27.76 
 
 
835 aa  304  5.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  27.49 
 
 
805 aa  303  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  27.16 
 
 
799 aa  303  8.000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0477  copper-exporting ATPase  27.33 
 
 
742 aa  303  8.000000000000001e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  29.18 
 
 
841 aa  302  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  27.32 
 
 
817 aa  301  2e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1690  copper-translocating P-type ATPase  27.36 
 
 
740 aa  300  5e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  27.46 
 
 
833 aa  300  6e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  26.03 
 
 
867 aa  300  6e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  28.4 
 
 
803 aa  299  1e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_203  P-ATPase family transporter: copper ion; heavy metal translocating P-type ATPase-like protein  28.23 
 
 
761 aa  299  1e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.512423 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2080  heavy metal translocating P-type ATPase  28.01 
 
 
814 aa  298  3e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0351429  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_824  cation transport ATPase  28.22 
 
 
828 aa  297  4e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  28.8 
 
 
976 aa  295  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  26.29 
 
 
758 aa  295  2e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  27.52 
 
 
814 aa  295  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1570  heavy metal translocating P-type ATPase  26.99 
 
 
747 aa  295  3e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.706467  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5724  heavy metal translocating P-type ATPase  27.38 
 
 
839 aa  295  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.788276 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  26.1 
 
 
837 aa  294  4e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0521  heavy metal translocating P-type ATPase  28.02 
 
 
807 aa  294  6e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2772  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  27.81 
 
 
798 aa  293  9e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  26.69 
 
 
836 aa  293  9e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  27.18 
 
 
894 aa  293  9e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  26.69 
 
 
836 aa  293  9e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0385  copper-transporter ATPase CopA  28.7 
 
 
744 aa  292  1e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  27.88 
 
 
805 aa  292  1e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  29.2 
 
 
794 aa  293  1e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  27.57 
 
 
861 aa  292  2e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0924  heavy metal translocating P-type ATPase  27.53 
 
 
835 aa  292  2e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01260  copper/silver-translocating P-type ATPase  27.16 
 
 
905 aa  291  3e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  27.88 
 
 
805 aa  291  3e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0297  heavy metal translocating P-type ATPase  25.86 
 
 
744 aa  291  3e-77  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  27.88 
 
 
805 aa  291  4e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0802  copper-transporting P-type ATPase  27.59 
 
 
902 aa  291  4e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  27.67 
 
 
793 aa  291  4e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  28.22 
 
 
831 aa  291  5.0000000000000004e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  27.43 
 
 
840 aa  290  7e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1596  copper-translocating P-type ATPase  27.15 
 
 
834 aa  290  7e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  27.73 
 
 
805 aa  290  7e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  26.75 
 
 
759 aa  290  7e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0905  heavy metal translocating P-type ATPase  27.13 
 
 
802 aa  290  8e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.631984  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  26.98 
 
 
857 aa  290  9e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3243  heavy metal translocating P-type ATPase  27.58 
 
 
841 aa  290  9e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  28.17 
 
 
1182 aa  289  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0657  copper-translocating P-type ATPase  30.16 
 
 
724 aa  289  1e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.737443  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  27.75 
 
 
806 aa  289  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  28.37 
 
 
837 aa  289  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  27.23 
 
 
837 aa  289  1e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  28.14 
 
 
806 aa  290  1e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  27.39 
 
 
786 aa  289  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  28.72 
 
 
1071 aa  288  2e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  27.75 
 
 
805 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3877  copper-translocating P-type ATPase  27.12 
 
 
760 aa  288  2.9999999999999996e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00336349  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  27.75 
 
 
805 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3067  heavy metal translocating P-type ATPase  26.83 
 
 
824 aa  288  2.9999999999999996e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  25.76 
 
 
885 aa  288  4e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3006  copper-translocating P-type ATPase  27.54 
 
 
850 aa  287  4e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>