More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1697 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  100 
 
 
67 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  98.51 
 
 
68 aa  133  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  76.12 
 
 
67 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  75.76 
 
 
67 aa  104  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  75.76 
 
 
67 aa  104  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  69.7 
 
 
67 aa  100  9e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  54.84 
 
 
68 aa  81.3  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  54.84 
 
 
68 aa  81.3  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  57.14 
 
 
68 aa  78.2  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1163  copper ion binding protein  52.31 
 
 
74 aa  70.1  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  49.23 
 
 
71 aa  69.7  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  48.44 
 
 
70 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1149  copper ion binding protein  49.23 
 
 
74 aa  67.8  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  46.15 
 
 
68 aa  67  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  46.15 
 
 
68 aa  67  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  46.15 
 
 
68 aa  67  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  48.48 
 
 
77 aa  67.4  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3576  copper-ion-binding protein  46.15 
 
 
68 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000264411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3476  copper-ion-binding protein  46.15 
 
 
68 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3488  copper-ion-binding protein  46.15 
 
 
68 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000382962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3860  copper-ion-binding protein  46.15 
 
 
68 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00109748  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3742  copper-ion-binding protein  46.15 
 
 
68 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000142681 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3759  copper-ion-binding protein  46.15 
 
 
68 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206021  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0131  Heavy metal transport/detoxification protein  46.88 
 
 
67 aa  64.3  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  45.9 
 
 
68 aa  63.5  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2476  Heavy metal transport/detoxification protein  48.39 
 
 
69 aa  62.8  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.270205  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84044  copper-transporting ATPase (Cu(2+)-ATPase)  40.3 
 
 
1196 aa  62  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00231928  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1809  copper ion binding protein  46.15 
 
 
75 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.865359  normal  0.918649 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  42.19 
 
 
954 aa  61.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  41.54 
 
 
68 aa  61.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0021  copper ion binding protein  45.45 
 
 
70 aa  60.8  0.000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00208737  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1785  mercuric transport protein periplasmic component  46.03 
 
 
90 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37235  normal  0.942363 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  50 
 
 
79 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  41.67 
 
 
67 aa  60.1  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0081  mercuric transport protein periplasmic component  43.75 
 
 
91 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.675229 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1697  copper ion-binding  40.62 
 
 
69 aa  60.1  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000580158  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2131  mercuric transport protein periplasmic component  43.75 
 
 
91 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0611  mercuric ion binding protein, putative  44.62 
 
 
68 aa  58.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.259599  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0018  heavy metal transport/detoxification protein  48.48 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1211  mercuric transport protein periplasmic component  44.44 
 
 
91 aa  59.3  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154152  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  46.27 
 
 
67 aa  59.3  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0036  Heavy metal transport/detoxification protein  48.48 
 
 
65 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.749635  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  48.39 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1715  copper ion binding protein  45 
 
 
77 aa  58.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0879446  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2086  heavy metal transport/detoxification protein  46.97 
 
 
68 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000331725  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  45.31 
 
 
66 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2455  Heavy metal transport/detoxification protein  47.62 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000343237  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1291  Heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 
69 aa  58.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1849  heavy metal transport/detoxification protein  41.27 
 
 
499 aa  58.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0166  mercuric transport protein periplasmic component MerP  42.86 
 
 
91 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.695125  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1021  heavy metal transport/detoxification protein  44.62 
 
 
65 aa  57.8  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1215  periplasmic mecuric binding protein, MerP  41.27 
 
 
91 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1389  Mercuric transport protein MerT  48.39 
 
 
209 aa  58.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000264548  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4343  mercuric transport protein periplasmic component  41.27 
 
 
91 aa  57.8  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0033  heavy metal transport/detoxification protein  46.97 
 
 
65 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1659  copper ion binding protein  43.75 
 
 
75 aa  57.8  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.842806 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04940  copper chaperone  45.31 
 
 
109 aa  57.8  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1386  Heavy metal transport/detoxification protein  48.48 
 
 
79 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  hitchhiker  0.000957123 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  47.76 
 
 
67 aa  57.8  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0113  mercuric transport protein periplasmic component  44.44 
 
 
91 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.827734  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1882  mercury ion binding protein  41.67 
 
 
68 aa  57.4  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.174635  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  45.31 
 
 
68 aa  57  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6496  mercuric transport protein periplasmic protein  41.27 
 
 
91 aa  57  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43034  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0103  mercuric transport protein periplasmic component  41.27 
 
 
91 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6173  Hg(II) resistance protein MerP  41.27 
 
 
91 aa  57  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000203357  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6346  Hg(II) resistance protein MerP  41.27 
 
 
91 aa  57  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000621364  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15470  periplasmic mercuric ion binding protein, MerP  41.27 
 
 
91 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000149366  unclonable  3.5058299999999997e-22 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2339  mercuric transport protein periplasmic component  41.27 
 
 
91 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832464  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4487  heavy metal transport/detoxification protein  39.39 
 
 
78 aa  57  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206644  normal  0.0472192 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1638  putative MerP, periplasmic heavy metal binding/chaperone protein  36.07 
 
 
74 aa  57  0.00000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.240185  hitchhiker  0.000119681 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  45.45 
 
 
942 aa  57  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1393  mercuric transport protein periplasmic component  41.27 
 
 
98 aa  57  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3258  Heavy metal transport/detoxification protein  48.48 
 
 
160 aa  56.6  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  47.69 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3377  heavy metal transport/detoxification protein  43.08 
 
 
66 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  39.39 
 
 
818 aa  56.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2230  mercuric transport protein periplasmic protein  39.06 
 
 
91 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0933  heavy metal transport/detoxification protein  45.31 
 
 
96 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18380  copper chaperone  43.75 
 
 
109 aa  55.8  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0143  heavy metal translocating P-type ATPase  39.68 
 
 
871 aa  55.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  40.91 
 
 
69 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1802  heavy metal transport/detoxification protein  37.31 
 
 
71 aa  55.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.125467  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1467  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
97 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  45.45 
 
 
69 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0745  Heavy metal transport/detoxification protein  40.3 
 
 
471 aa  55.1  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000126874  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1872  heavy metal transport/detoxification protein  34.43 
 
 
74 aa  55.1  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.230412  unclonable  0.0000667879 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0131  heavy metal transport/detoxification protein  44.62 
 
 
70 aa  54.3  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0240  mercuric transport protein periplasmic component  41.27 
 
 
98 aa  54.3  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  40.3 
 
 
67 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  40.3 
 
 
67 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  40.3 
 
 
67 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2844  Heavy metal transport/detoxification protein  49.21 
 
 
68 aa  53.9  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1856  copper-translocating P-type ATPase  37.5 
 
 
890 aa  53.9  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0092  mercuric transport protein periplasmic component  39.68 
 
 
91 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2225  heavy metal transport/detoxification protein  44.62 
 
 
66 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.708694  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  38.71 
 
 
894 aa  53.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2271  mercuric transport protein periplasmic component  36.51 
 
 
94 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.618304  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  38.1 
 
 
797 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3052  heavy metal translocating P-type ATPase  41.27 
 
 
866 aa  53.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4520  heavy metal transport/detoxification protein  46.97 
 
 
97 aa  52.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>