More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1389 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1389  Mercuric transport protein MerT  100 
 
 
209 aa  413  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000264548  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3089  heavy metal transport/detoxification protein  29.73 
 
 
199 aa  104  9e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11673  probable copper-transporting ATPase  29.44 
 
 
195 aa  104  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6742  Heavy metal transport/detoxification protein  32.78 
 
 
196 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.685267 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0239  putative mercuric transport protein  43.12 
 
 
116 aa  79.7  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0114  mercuric transport protein  44.63 
 
 
116 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5991  mercury transporter MerT  43.81 
 
 
115 aa  76.3  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.681838 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1212  Mercuric transport protein MerT  41.9 
 
 
116 aa  72.8  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.158107  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2130  putative mercuric transport protein  41.9 
 
 
116 aa  72.8  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.981887  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0082  putative mercuric transport protein  41.9 
 
 
116 aa  72.8  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.680635 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1784  putative mercuric transport protein  50 
 
 
116 aa  72  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.598892  normal  0.981722 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1216  putative mercuric transport protein  41.28 
 
 
116 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1394  putative mercuric transport protein  53.73 
 
 
116 aa  72  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4013  putative mercuric transport protein  41.67 
 
 
118 aa  72  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2231  putative mercuric transport protein  38.39 
 
 
116 aa  72  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.751686  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4342  putative mercuric transport protein  38.02 
 
 
131 aa  72  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2270  putative mercuric transport protein  46.43 
 
 
123 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.516173  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0093  putative mercuric transport protein  40.37 
 
 
116 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6497  putative mercuric transport protein  38.53 
 
 
116 aa  68.9  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165506  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0102  putative mercuric transport protein  38.53 
 
 
116 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626392  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2340  putative mercuric transport protein  38.53 
 
 
116 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0167  putative mercuric transport protein  46.05 
 
 
116 aa  68.2  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02959  MerT mercuric transport protein  36.19 
 
 
117 aa  67.4  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000916809  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1475  putative mercuric transport protein  47.62 
 
 
123 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.464723  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6172  putative mercuric transport protein  37.61 
 
 
116 aa  67.8  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000473397  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6345  mercuric ion transport protein MerT  37.61 
 
 
116 aa  67.8  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000789879  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15475  putative mercuric transport protein  37.61 
 
 
116 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000305934  unclonable  3.76194e-22 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1300  putative mercuric transport protein  50.75 
 
 
116 aa  65.5  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.703768 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1662  Hg2+ uptake ATPase  50 
 
 
116 aa  65.5  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.253887  normal  0.775197 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2313  putative mercuric transport protein  50.75 
 
 
116 aa  65.1  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000214741  hitchhiker  0.0000267123 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  53.33 
 
 
67 aa  64.3  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1785  mercuric transport protein periplasmic component  43.66 
 
 
90 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37235  normal  0.942363 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1339  putative mercuric transport protein  50.88 
 
 
117 aa  63.5  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.162725  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4361  heavy metal transport/detoxification protein  33.68 
 
 
196 aa  61.6  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1219  heavy metal transport/detoxification protein  33.68 
 
 
196 aa  61.6  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0799  mercuric transporter MerT  35.14 
 
 
152 aa  61.6  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.895967 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4383  heavy metal transport/detoxification protein  33.68 
 
 
196 aa  61.6  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2980  heavy metal transport/detoxification protein  33.68 
 
 
196 aa  61.6  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0485  putative mercuric transport protein  39.36 
 
 
116 aa  61.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01411  putative mercuric transport protein  35.16 
 
 
106 aa  61.2  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.658716  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0170  mercuric transporter MerT  33.05 
 
 
115 aa  60.8  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2327  mercuric transporter MerT  36.28 
 
 
128 aa  60.8  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4314  mercuric transporter MerT  36.36 
 
 
115 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02957  MerT mercuric transport protein  37.65 
 
 
115 aa  60.5  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00162085  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0166  mercuric transport protein periplasmic component MerP  44.29 
 
 
91 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.695125  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02043  Mercury scavenger protein:Heavy-metal-associated domain  41.43 
 
 
85 aa  60.1  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525841  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1215  periplasmic mecuric binding protein, MerP  40.58 
 
 
91 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2685  mercuric transporter MerT  39.45 
 
 
132 aa  59.3  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4343  mercuric transport protein periplasmic component  40.58 
 
 
91 aa  58.9  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0081  mercuric transport protein periplasmic component  45.71 
 
 
91 aa  58.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.675229 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2131  mercuric transport protein periplasmic component  45.71 
 
 
91 aa  58.5  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6496  mercuric transport protein periplasmic protein  42.86 
 
 
91 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43034  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0103  mercuric transport protein periplasmic component  42.86 
 
 
91 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6173  Hg(II) resistance protein MerP  42.86 
 
 
91 aa  58.5  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000203357  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6346  Hg(II) resistance protein MerP  42.86 
 
 
91 aa  58.5  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000621364  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15470  periplasmic mercuric ion binding protein, MerP  42.86 
 
 
91 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000149366  unclonable  3.5058299999999997e-22 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2339  mercuric transport protein periplasmic component  42.86 
 
 
91 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832464  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  48.39 
 
 
67 aa  58.2  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  48.39 
 
 
68 aa  58.2  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4797  putative mercuric transport protein  52.08 
 
 
129 aa  58.2  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3157  mercuric transporter MerT  36.47 
 
 
141 aa  57.8  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.847087  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2901  mercuric transporter MerT  40.96 
 
 
141 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  40.98 
 
 
68 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  43.55 
 
 
67 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1110  heavy metal translocating P-type ATPase  43.28 
 
 
938 aa  57  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0214095  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  40.98 
 
 
68 aa  57  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  40.98 
 
 
68 aa  57  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  43.28 
 
 
885 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
68 aa  57  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0092  mercuric transport protein periplasmic component  44.29 
 
 
91 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1211  mercuric transport protein periplasmic component  44.29 
 
 
91 aa  57  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154152  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  43.55 
 
 
67 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1393  mercuric transport protein periplasmic component  39.44 
 
 
98 aa  56.2  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  32.46 
 
 
954 aa  56.2  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  38.24 
 
 
942 aa  56.2  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0240  mercuric transport protein periplasmic component  44.29 
 
 
98 aa  55.8  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2271  mercuric transport protein periplasmic component  42.65 
 
 
94 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.618304  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01410  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  41.43 
 
 
94 aa  55.1  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  32.88 
 
 
817 aa  55.1  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2230  mercuric transport protein periplasmic protein  39.13 
 
 
91 aa  54.7  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2195  heavy metal translocating P-type ATPase  37.93 
 
 
756 aa  53.9  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  37.31 
 
 
71 aa  54.7  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3491  mercuric transporter MerT  35.16 
 
 
115 aa  54.3  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  33.78 
 
 
77 aa  53.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1659  copper ion binding protein  39.13 
 
 
75 aa  53.9  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.842806 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1163  copper ion binding protein  37.5 
 
 
74 aa  53.9  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2837  Heavy metal transport/detoxification protein  31.03 
 
 
372 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4313  mercuric transport protein periplasmic component  44.93 
 
 
91 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  41.94 
 
 
67 aa  53.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  43.08 
 
 
849 aa  53.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  33.77 
 
 
794 aa  52.4  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  38.82 
 
 
826 aa  52.8  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2510  mercuric transporter MerT  36.08 
 
 
123 aa  52.8  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.565949 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  34.18 
 
 
794 aa  52.8  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  42.19 
 
 
837 aa  52.4  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1232  Heavy metal transport/detoxification protein  27.78 
 
 
115 aa  52.4  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0066446  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1299  mercuric transport protein periplasmic component  42.03 
 
 
95 aa  52.4  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2314  mercuric transport protein periplasmic protein  42.03 
 
 
95 aa  52.4  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118185  hitchhiker  0.0000281671 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0143  heavy metal translocating P-type ATPase  35.71 
 
 
871 aa  52  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1476  mercuric transport protein periplasmic component  41.18 
 
 
94 aa  52  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.241266  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>