More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1663 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1663  PBP/HMA domain-containing protein  100 
 
 
94 aa  187  5e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140862  normal  0.759256 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0239  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  63.44 
 
 
94 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0113  mercuric transport protein periplasmic component  53.41 
 
 
91 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.827734  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0092  mercuric transport protein periplasmic component  58.9 
 
 
91 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2314  mercuric transport protein periplasmic protein  59.15 
 
 
95 aa  87.4  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118185  hitchhiker  0.0000281671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1299  mercuric transport protein periplasmic component  59.15 
 
 
95 aa  87.4  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01410  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  57.53 
 
 
94 aa  85.9  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3490  mercuric transport protein periplasmic component  51.09 
 
 
95 aa  85.9  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6496  mercuric transport protein periplasmic protein  56.34 
 
 
91 aa  84.3  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43034  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2339  mercuric transport protein periplasmic component  56.34 
 
 
91 aa  84.3  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832464  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0103  mercuric transport protein periplasmic component  56.34 
 
 
91 aa  84.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6173  Hg(II) resistance protein MerP  56.34 
 
 
91 aa  84.3  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000203357  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6346  Hg(II) resistance protein MerP  56.34 
 
 
91 aa  84.3  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000621364  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15470  periplasmic mercuric ion binding protein, MerP  56.34 
 
 
91 aa  84.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000149366  unclonable  3.5058299999999997e-22 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4796  mercuric transport protein periplasmic protein  55.41 
 
 
94 aa  84.3  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0484  mercuric transport protein periplasmic component  53.33 
 
 
92 aa  82.4  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1340  mercuric transport protein periplasmic protein  60.87 
 
 
108 aa  82.4  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.023175  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0166  mercuric transport protein periplasmic component MerP  53.52 
 
 
91 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.695125  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2230  mercuric transport protein periplasmic protein  49.4 
 
 
91 aa  80.9  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2131  mercuric transport protein periplasmic component  56.34 
 
 
91 aa  80.5  0.000000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0169  mercuric transport protein periplasmic component  50.67 
 
 
91 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0081  mercuric transport protein periplasmic component  56.34 
 
 
91 aa  80.5  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.675229 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1211  mercuric transport protein periplasmic component  57.75 
 
 
91 aa  80.1  0.000000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154152  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1785  mercuric transport protein periplasmic component  54.29 
 
 
90 aa  79.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37235  normal  0.942363 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2328  heavy metal transport/detoxification protein  44 
 
 
125 aa  77.8  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1215  periplasmic mecuric binding protein, MerP  52.11 
 
 
91 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4343  mercuric transport protein periplasmic component  52.11 
 
 
91 aa  77  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4012  mercuric transport protein periplasmic component  52.05 
 
 
100 aa  77  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2271  mercuric transport protein periplasmic component  54.93 
 
 
94 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.618304  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4313  mercuric transport protein periplasmic component  47.95 
 
 
91 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0240  mercuric transport protein periplasmic component  44.68 
 
 
98 aa  75.9  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4417  mercuric transport protein periplasmic protein  49.37 
 
 
94 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192588  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1393  mercuric transport protein periplasmic component  42.22 
 
 
98 aa  74.7  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02043  Mercury scavenger protein:Heavy-metal-associated domain  45.57 
 
 
85 aa  72.4  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525841  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2902  mercuric transport protein periplasmic component  42.05 
 
 
98 aa  70.9  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1476  mercuric transport protein periplasmic component  49.3 
 
 
94 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.241266  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0798  heavy metal transport/detoxification protein  44 
 
 
98 aa  70.9  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.885696 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2684  heavy metal transport/detoxification protein  43.02 
 
 
109 aa  70.1  0.000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3158  heavy metal transport/detoxification protein  43.02 
 
 
97 aa  68.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.299489  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2511  mercuric transport protein periplasmic protein  47.44 
 
 
99 aa  67.4  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  43.66 
 
 
833 aa  65.5  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  46.48 
 
 
838 aa  64.7  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  46.15 
 
 
849 aa  61.2  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0205  heavy metal translocating P-type ATPase  38.46 
 
 
823 aa  58.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02958  putative mercuric transport protein periplasmic binding protein  44.26 
 
 
61 aa  58.9  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000221082  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  40.85 
 
 
836 aa  58.9  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  46.15 
 
 
837 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  40 
 
 
837 aa  57.4  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  45.31 
 
 
885 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1110  heavy metal translocating P-type ATPase  39.47 
 
 
938 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0214095  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0119  heavy metal translocating P-type ATPase  41.67 
 
 
816 aa  55.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  40.98 
 
 
826 aa  55.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6893  heavy metal translocating P-type ATPase  46.15 
 
 
872 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.172746  normal  0.265411 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3052  heavy metal translocating P-type ATPase  42.67 
 
 
866 aa  55.5  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2185  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
754 aa  55.1  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3653  heavy metal translocating P-type ATPase  36.76 
 
 
805 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0143  heavy metal translocating P-type ATPase  38.81 
 
 
871 aa  54.7  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3496  copper-translocating P-type ATPase  36.76 
 
 
805 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1873  heavy metal translocating P-type ATPase  39.06 
 
 
821 aa  54.7  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3584  copper-translocating P-type ATPase  36.76 
 
 
805 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1686  heavy metal translocating P-type ATPase  38.71 
 
 
811 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  40.98 
 
 
750 aa  53.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0990  heavy metal translocating P-type ATPase  35.71 
 
 
803 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.502071 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2021  copper-translocating P-type ATPase  38.71 
 
 
811 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3058  heavy metal transport/detoxification protein  41.3 
 
 
94 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0019  heavy metal translocating P-type ATPase  45.68 
 
 
782 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 
68 aa  53.9  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  34.78 
 
 
861 aa  53.5  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0037  heavy metal translocating P-type ATPase  43.9 
 
 
782 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.374671  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  36.11 
 
 
753 aa  53.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3215  heavy metal transport/detoxification protein  38.04 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.501127  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2464  heavy metal translocating P-type ATPase  44.12 
 
 
689 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.301674  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  35.29 
 
 
802 aa  52  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2276  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 
801 aa  52.4  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  38.1 
 
 
71 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1661  heavy metal translocating P-type ATPase  43.08 
 
 
825 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119959  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  35.29 
 
 
802 aa  52  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3281  heavy metal translocating P-type ATPase  32.31 
 
 
699 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  40.91 
 
 
1071 aa  52  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  41.82 
 
 
831 aa  51.6  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
837 aa  52  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0133  ATPase, P type cation/copper-transporter  38.89 
 
 
751 aa  52  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2317  heavy metal translocating P-type ATPase  39.71 
 
 
829 aa  51.2  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3072  heavy metal transport/detoxification protein  36.96 
 
 
94 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1209  mercuric reductase  43.08 
 
 
565 aa  51.6  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.375903  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2938  copper-translocating P-type ATPase  39.13 
 
 
795 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  41.82 
 
 
837 aa  51.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  40.32 
 
 
857 aa  51.2  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1872  heavy metal transport/detoxification protein  32.86 
 
 
74 aa  51.2  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.230412  unclonable  0.0000667879 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0090  heavy metal transport/detoxification protein  36.36 
 
 
72 aa  51.2  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  41.94 
 
 
817 aa  51.2  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  38.1 
 
 
839 aa  50.8  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  30.77 
 
 
805 aa  50.4  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1251  heavy metal translocating P-type ATPase  37.88 
 
 
806 aa  50.4  0.000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000992397 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1305  Heavy metal transport/detoxification protein  36.96 
 
 
94 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.497858  normal  0.921756 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1082  heavy metal translocating P-type ATPase  36.23 
 
 
813 aa  50.4  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  30.77 
 
 
805 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  30.77 
 
 
805 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  30.77 
 
 
805 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2133  putative mercuric reductase  41.54 
 
 
564 aa  50.4  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>