More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2139 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2139  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 66 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3726  copper ion binding protein  55.93 
 
 		 64 aa  70.5  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.663439  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0131  Heavy metal transport/detoxification protein  47.46 
 
 		 67 aa  64.3  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  50 
 
 		 71 aa  63.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1697  copper ion-binding  44.12 
 
 		 69 aa  61.6  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000580158  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  46.97 
 
 		 68 aa  60.5  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  47.76 
 
 		 68 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  48.53 
 
 		 68 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  48.53 
 
 		 68 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1882  mercury ion binding protein  44.12 
 
 		 68 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.174635  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  45.76 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  45.76 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  45.76 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1862  heavy metal-binding protein, putative  47.62 
 
 		 74 aa  57.4  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1538  Heavy metal transport/detoxification protein  47.62 
 
 		 74 aa  57.4  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0133712 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0143  Heavy metal transport/detoxification protein  40.68 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  45.59 
 
 		 839 aa  57  0.00000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.94 
 
 		 473 aa  57  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1149  copper ion binding protein  48.44 
 
 		 74 aa  57  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1163  copper ion binding protein  46.88 
 
 		 74 aa  56.2  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0890  mercuric reductase  45.16 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000328424  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  46.27 
 
 		 77 aa  56.6  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1233  hypothetical protein  46.03 
 
 		 810 aa  56.2  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3759  copper-ion-binding protein  46.27 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206021  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0162  Heavy metal transport/detoxification protein  43.55 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.988191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  45.45 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  44.78 
 
 		 68 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2448  heavy metal-binding protein, putative  46.03 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2074  Heavy metal transport/detoxification protein  46.03 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  42.11 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  44.78 
 
 		 68 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  44.78 
 
 		 68 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1752  Heavy metal transport/detoxification protein  40.68 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3169  Heavy metal transport/detoxification protein  49.18 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145614 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  45 
 
 		 762 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3576  copper-ion-binding protein  44.78 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000264411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3476  copper-ion-binding protein  44.78 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3488  copper-ion-binding protein  44.78 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000382962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3860  copper-ion-binding protein  44.78 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00109748  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0420  Heavy metal transport/detoxification protein  41.67 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3742  copper-ion-binding protein  44.78 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000142681 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0962  copper exporting ATPase  43.86 
 
 		 832 aa  54.3  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.220688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0933  heavy metal transport/detoxification protein  48.39 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  40.91 
 
 		 817 aa  54.3  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00355  Cation transport ATPase  39.34 
 
 		 782 aa  54.3  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3691  heavy metal translocating P-type ATPase  44.62 
 
 		 793 aa  53.5  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  44.44 
 
 		 827 aa  53.5  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2449  Heavy metal transport/detoxification protein  40.68 
 
 		 64 aa  53.5  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228051  normal  0.0680079 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  43.55 
 
 		 852 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0030  Heavy metal transport/detoxification protein  44.07 
 
 		 64 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  43.33 
 
 		 762 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  45 
 
 		 867 aa  53.1  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  43.33 
 
 		 762 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  43.33 
 
 		 762 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  43.33 
 
 		 767 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0460  heavy metal translocating P-type ATPase  42.62 
 
 		 748 aa  52.4  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.792118  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  43.28 
 
 		 849 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  44.62 
 
 		 67 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  43.08 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0090  heavy metal transport/detoxification protein  36.67 
 
 		 72 aa  52  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  44.62 
 
 		 67 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  44.78 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1809  copper ion binding protein  48.48 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.865359  normal  0.918649 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0926  Heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  45 
 
 		 826 aa  52  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  40.68 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  43.28 
 
 		 71 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  44.26 
 
 		 835 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  38.6 
 
 		 67 aa  51.6  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4145  copper-translocating P-type ATPase  42.11 
 
 		 778 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.418825  normal  0.147287 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  37.31 
 
 		 69 aa  51.2  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 		 77 aa  51.2  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  41.79 
 
 		 68 aa  50.8  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  46.77 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2847  heavy metal transport/detoxification protein  34.33 
 
 		 115 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.179669 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  46.55 
 
 		 826 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  45.9 
 
 		 855 aa  51.2  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2900  heavy metal translocating P-type ATPase  41.79 
 
 		 795 aa  51.2  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0179481  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  44.44 
 
 		 70 aa  51.2  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0141  Heavy metal transport/detoxification protein  37.29 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3258  Heavy metal transport/detoxification protein  42.42 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0698  copper ion binding protein  40.98 
 
 		 71 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.031698  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2388  heavy-metal transporting P-type ATPase  44.26 
 
 		 819 aa  50.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168329  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0294  copper ion binding protein  41.67 
 
 		 71 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0212  copper-translocating P-type ATPase  45 
 
 		 759 aa  50.4  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1450  heavy metal transport/detoxification protein  35.82 
 
 		 113 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1916  copper-translocating P-type ATPase  40.68 
 
 		 791 aa  50.4  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3027  copper-translocating P-type ATPase  37.29 
 
 		 939 aa  50.4  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1031  copper-translocating P-type ATPase  35.59 
 
 		 913 aa  50.4  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  37.88 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  41.94 
 
 		 833 aa  50.4  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1468  heavy metal transport/detoxification protein  35.82 
 
 		 70 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3126  copper-translocating P-type ATPase  40.35 
 
 		 834 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0563  copper exporting ATPase  40.35 
 
 		 834 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  40.91 
 
 		 840 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0527  copper exporting ATPase  40.35 
 
 		 834 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0577  copper exporting ATPase  40.35 
 
 		 834 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0523  copper exporting ATPase  40.35 
 
 		 834 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0910  heavy metal transport/detoxification protein  35.82 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2279  copper ion binding protein  44.07 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>