253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1809 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1809  copper ion binding protein  100 
 
 
75 aa  149  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.865359  normal  0.918649 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1149  copper ion binding protein  52.7 
 
 
74 aa  77  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1163  copper ion binding protein  52.7 
 
 
74 aa  77  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1697  copper ion-binding  52.24 
 
 
69 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000580158  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  51.56 
 
 
71 aa  69.3  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  44.44 
 
 
77 aa  68.2  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  46.97 
 
 
67 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  46.97 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  46.97 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  46.15 
 
 
68 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  46.15 
 
 
67 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  49.23 
 
 
70 aa  61.6  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  43.08 
 
 
67 aa  61.6  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  38.03 
 
 
837 aa  60.1  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0905  heavy metal translocating P-type ATPase  37.68 
 
 
802 aa  58.9  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.631984  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  49.21 
 
 
68 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  49.21 
 
 
68 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  43.55 
 
 
68 aa  57.4  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  45.16 
 
 
68 aa  57  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  43.94 
 
 
68 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  43.94 
 
 
68 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  38.03 
 
 
826 aa  56.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  39.06 
 
 
821 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  43.94 
 
 
68 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3576  copper-ion-binding protein  43.94 
 
 
68 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000264411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3476  copper-ion-binding protein  43.94 
 
 
68 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3488  copper-ion-binding protein  43.94 
 
 
68 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000382962  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  41.94 
 
 
954 aa  55.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3860  copper-ion-binding protein  43.94 
 
 
68 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00109748  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3742  copper-ion-binding protein  43.94 
 
 
68 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000142681 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  40.62 
 
 
818 aa  55.1  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1715  copper ion binding protein  46.77 
 
 
77 aa  54.7  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0879446  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  42.42 
 
 
68 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3759  copper-ion-binding protein  42.42 
 
 
68 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206021  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1546  cation transport ATPase  45.16 
 
 
742 aa  52.4  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1666  copper ion binding protein  36.92 
 
 
73 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121778  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2139  heavy metal transport/detoxification protein  48.48 
 
 
66 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  36.23 
 
 
857 aa  51.6  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 
67 aa  51.6  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  42.03 
 
 
803 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 
65 aa  50.8  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0131  heavy metal transport/detoxification protein  36.36 
 
 
70 aa  50.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1876  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
748 aa  50.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.972303  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1882  mercury ion binding protein  38.1 
 
 
68 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.174635  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  41.79 
 
 
79 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  38.98 
 
 
839 aa  49.3  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  41.27 
 
 
66 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  38.46 
 
 
814 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  45.45 
 
 
69 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1386  Heavy metal transport/detoxification protein  43.28 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  hitchhiker  0.000957123 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2339  mercuric transport protein periplasmic component  31.82 
 
 
91 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832464  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6797  Heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 
70 aa  48.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6496  mercuric transport protein periplasmic protein  31.82 
 
 
91 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43034  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0103  mercuric transport protein periplasmic component  31.82 
 
 
91 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  37.88 
 
 
758 aa  48.5  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6173  Hg(II) resistance protein MerP  31.82 
 
 
91 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000203357  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6346  Hg(II) resistance protein MerP  31.82 
 
 
91 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000621364  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  37.31 
 
 
833 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15470  periplasmic mercuric ion binding protein, MerP  31.82 
 
 
91 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000149366  unclonable  3.5058299999999997e-22 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1553  heavy metal translocating P-type ATPase  38.89 
 
 
859 aa  48.5  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.534956  normal  0.0124284 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1795  Heavy metal transport/detoxification protein  35.71 
 
 
75 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  38.81 
 
 
817 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  37.5 
 
 
799 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1110  heavy metal translocating P-type ATPase  32.84 
 
 
938 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0214095  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3872  Heavy metal transport/detoxification protein  37.84 
 
 
79 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330902 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4098  heavy metal transport/detoxification protein  42.42 
 
 
76 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2279  copper ion binding protein  43.08 
 
 
69 aa  47.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  35.14 
 
 
743 aa  47.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0715  heavy metal translocating P-type ATPase  38.81 
 
 
739 aa  47.4  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.073863  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1741  Heavy metal transport/detoxification protein  39.44 
 
 
73 aa  47.4  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246039  decreased coverage  0.0020488 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3668  Heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
74 aa  47.8  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0933  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
96 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1785  mercuric transport protein periplasmic component  33.85 
 
 
90 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37235  normal  0.942363 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  39.06 
 
 
68 aa  47.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  37.5 
 
 
942 aa  47.4  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0141  Heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 
65 aa  47.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0008  copper-translocating P-type ATPase  39.34 
 
 
891 aa  47.4  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13340  Heavy metal transport/detoxification protein  38.24 
 
 
69 aa  47  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000868167  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2131  mercuric transport protein periplasmic component  33.33 
 
 
91 aa  47  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0081  mercuric transport protein periplasmic component  33.33 
 
 
91 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.675229 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3258  Heavy metal transport/detoxification protein  40.3 
 
 
160 aa  47  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1638  putative MerP, periplasmic heavy metal binding/chaperone protein  33.33 
 
 
74 aa  47  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.240185  hitchhiker  0.000119681 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0119  heavy metal translocating P-type ATPase  34.92 
 
 
816 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  40.3 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  32.86 
 
 
838 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1211  mercuric transport protein periplasmic component  33.33 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154152  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3726  copper ion binding protein  40.98 
 
 
64 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.663439  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2381  heavy metal translocating P-type ATPase  32.81 
 
 
772 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
68 aa  46.2  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0024  heavy metal translocating P-type ATPase  34.38 
 
 
757 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2230  mercuric transport protein periplasmic protein  31.34 
 
 
91 aa  45.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1872  heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 
74 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.230412  unclonable  0.0000667879 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
889 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3058  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
740 aa  45.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3170  heavy metal translocating P-type ATPase  34.43 
 
 
936 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158229 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0633  heavy metal transport/detoxification protein  42.62 
 
 
65 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000319984 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0240  mercuric transport protein periplasmic component  30.77 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2405  heavy metal transport/detoxification protein  29.69 
 
 
68 aa  45.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0166  mercuric transport protein periplasmic component MerP  31.82 
 
 
91 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.695125  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>