More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3726 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3726  copper ion binding protein  100 
 
 
64 aa  128  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.663439  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2139  heavy metal transport/detoxification protein  55.93 
 
 
66 aa  70.5  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0131  Heavy metal transport/detoxification protein  50.79 
 
 
67 aa  66.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  50.85 
 
 
65 aa  63.9  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1752  Heavy metal transport/detoxification protein  49.21 
 
 
65 aa  63.2  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0090  heavy metal transport/detoxification protein  48.53 
 
 
72 aa  62.4  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1538  Heavy metal transport/detoxification protein  53.33 
 
 
74 aa  62  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0133712 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1862  heavy metal-binding protein, putative  53.33 
 
 
74 aa  62  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  51.61 
 
 
67 aa  61.6  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0141  Heavy metal transport/detoxification protein  47.62 
 
 
65 aa  61.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0962  copper exporting ATPase  49.21 
 
 
832 aa  60.5  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.220688  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
67 aa  60.5  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  52.31 
 
 
67 aa  60.1  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1211  mercuric transport protein periplasmic component  51.56 
 
 
91 aa  58.9  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154152  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2230  mercuric transport protein periplasmic protein  45.31 
 
 
91 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0143  Heavy metal transport/detoxification protein  44.44 
 
 
65 aa  58.2  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2131  mercuric transport protein periplasmic component  51.56 
 
 
91 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0926  Heavy metal transport/detoxification protein  52.54 
 
 
68 aa  57.8  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0081  mercuric transport protein periplasmic component  51.56 
 
 
91 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.675229 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0577  copper exporting ATPase  47.62 
 
 
834 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0419  copper exporting ATPase  47.62 
 
 
834 aa  57.4  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0527  copper exporting ATPase  47.62 
 
 
834 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00435  copper transporter  47.62 
 
 
834 aa  57  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3126  copper-translocating P-type ATPase  47.62 
 
 
834 aa  57  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00440  hypothetical protein  47.62 
 
 
834 aa  57  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0563  copper exporting ATPase  47.62 
 
 
834 aa  57  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3132  copper exporting ATPase  47.62 
 
 
834 aa  57  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.142794  hitchhiker  0.000000556714 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0523  copper exporting ATPase  47.62 
 
 
834 aa  57  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0166  mercuric transport protein periplasmic component MerP  46.88 
 
 
91 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.695125  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1916  copper-translocating P-type ATPase  52.38 
 
 
791 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0545  copper exporting ATPase  47.62 
 
 
833 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0547  copper exporting ATPase  47.62 
 
 
833 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  53.33 
 
 
849 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0674  Heavy metal transport/detoxification protein  43.75 
 
 
68 aa  56.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0552  copper exporting ATPase  47.62 
 
 
833 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0606  copper exporting ATPase  47.62 
 
 
833 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1785  mercuric transport protein periplasmic component  47.62 
 
 
90 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37235  normal  0.942363 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0562  copper exporting ATPase  47.62 
 
 
833 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.304776  normal  0.828863 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6496  mercuric transport protein periplasmic protein  45.31 
 
 
91 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43034  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0103  mercuric transport protein periplasmic component  45.31 
 
 
91 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2339  mercuric transport protein periplasmic component  45.31 
 
 
91 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832464  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6173  Hg(II) resistance protein MerP  45.31 
 
 
91 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000203357  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6346  Hg(II) resistance protein MerP  45.31 
 
 
91 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000621364  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0092  mercuric transport protein periplasmic component  47.62 
 
 
91 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15470  periplasmic mercuric ion binding protein, MerP  45.31 
 
 
91 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000149366  unclonable  3.5058299999999997e-22 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1212  Heavy metal transport/detoxification protein  48.33 
 
 
78 aa  55.8  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  46.77 
 
 
839 aa  55.1  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2133  putative mercuric reductase  49.21 
 
 
564 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3027  copper exporting ATPase  48.33 
 
 
955 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3165  copper exporting ATPase  48.33 
 
 
961 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.517155  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1213  putative mercuric reductase  51.61 
 
 
561 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1215  periplasmic mecuric binding protein, MerP  45.31 
 
 
91 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3027  copper-translocating P-type ATPase  46.67 
 
 
939 aa  55.5  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4343  mercuric transport protein periplasmic component  45.31 
 
 
91 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4345  putative mercuric reductase  51.61 
 
 
561 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0420  Heavy metal transport/detoxification protein  46.88 
 
 
65 aa  55.1  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0045  putative mercuric reductase  49.21 
 
 
564 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00619698  normal  0.422186 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3169  Heavy metal transport/detoxification protein  46.88 
 
 
65 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145614 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0802  copper-transporting P-type ATPase  48.33 
 
 
902 aa  55.1  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3691  heavy metal translocating P-type ATPase  47.62 
 
 
793 aa  54.7  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0890  mercuric reductase  46.03 
 
 
66 aa  54.7  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000328424  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1265  copper exporting ATPase  48.33 
 
 
955 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.057349 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1031  copper-translocating P-type ATPase  48.33 
 
 
913 aa  54.7  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1097  copper exporting ATPase  50 
 
 
907 aa  54.3  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2271  mercuric transport protein periplasmic component  44.44 
 
 
94 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.618304  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  47.46 
 
 
839 aa  54.3  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  46.27 
 
 
67 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  49.18 
 
 
1182 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  50.85 
 
 
835 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 
827 aa  53.5  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0030  Heavy metal transport/detoxification protein  37.5 
 
 
64 aa  53.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  44.44 
 
 
77 aa  53.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0008  copper-translocating P-type ATPase  43.08 
 
 
891 aa  53.5  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4578  heavy metal translocating P-type ATPase  48.28 
 
 
799 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530867  decreased coverage  0.00687508 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3543  heavy metal translocating P-type ATPase  49.15 
 
 
740 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1209  mercuric reductase  48.39 
 
 
565 aa  53.5  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.375903  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3243  heavy metal translocating P-type ATPase  52.46 
 
 
841 aa  53.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 
67 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2074  Heavy metal transport/detoxification protein  55.17 
 
 
68 aa  52.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2448  heavy metal-binding protein, putative  55.17 
 
 
68 aa  52.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 
67 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 
67 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1807  cation transporter E1-E2 family ATPase  48.39 
 
 
915 aa  52.8  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0933  heavy metal transport/detoxification protein  49.12 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  46.67 
 
 
762 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11220  copper/silver-translocating P-type ATPase  48.48 
 
 
925 aa  52.4  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.363514 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2317  heavy metal translocating P-type ATPase  48.39 
 
 
829 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4090  heavy metal translocating P-type ATPase  50.79 
 
 
813 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.670864 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  42.62 
 
 
793 aa  52.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  51.67 
 
 
833 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1476  mercuric transport protein periplasmic component  46.03 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.241266  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  42.42 
 
 
67 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1341  putative mercuric reductase  45.31 
 
 
541 aa  52  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.183471  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0165  putative mercuric reductase  49.18 
 
 
561 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2338  putative mercuric reductase  48.39 
 
 
561 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243851  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6174  putative mercuric reductase  48.39 
 
 
561 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00111286  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6183  putative mercuric reductase  48.39 
 
 
561 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00236829  unclonable  0.0000000913433 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0104  putative mercuric reductase  48.39 
 
 
561 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.57639  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1393  mercuric transport protein periplasmic component  44.44 
 
 
98 aa  51.6  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  46.77 
 
 
792 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>