More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0090 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0090  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 72 aa  147  5e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0926  Heavy metal transport/detoxification protein  59.38 
 
 		 68 aa  82  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  59.68 
 
 		 67 aa  77.8  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0131  Heavy metal transport/detoxification protein  55.38 
 
 		 67 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  50.77 
 
 		 835 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1538  Heavy metal transport/detoxification protein  53.23 
 
 		 74 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0133712 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  53.97 
 
 		 65 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1862  heavy metal-binding protein, putative  53.23 
 
 		 74 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3543  heavy metal translocating P-type ATPase  51.43 
 
 		 740 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1031  copper-translocating P-type ATPase  49.23 
 
 		 913 aa  64.3  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3027  copper-translocating P-type ATPase  46.97 
 
 		 939 aa  64.3  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1492  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00435  copper transporter  46.88 
 
 		 834 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3126  copper-translocating P-type ATPase  46.88 
 
 		 834 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0523  copper exporting ATPase  46.88 
 
 		 834 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3132  copper exporting ATPase  46.88 
 
 		 834 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.142794  hitchhiker  0.000000556714 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1110  heavy metal translocating P-type ATPase  50.79 
 
 		 938 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0214095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0527  copper exporting ATPase  46.88 
 
 		 834 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0577  copper exporting ATPase  46.88 
 
 		 834 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0419  copper exporting ATPase  46.88 
 
 		 834 aa  63.2  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0563  copper exporting ATPase  46.88 
 
 		 834 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00440  hypothetical protein  46.88 
 
 		 834 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1097  copper exporting ATPase  46.15 
 
 		 907 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  48.44 
 
 		 762 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4777  heavy metal translocating P-type ATPase  52.31 
 
 		 1013 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3726  copper ion binding protein  48.53 
 
 		 64 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.663439  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  48.44 
 
 		 762 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  48.44 
 
 		 767 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  48.44 
 
 		 762 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  48.44 
 
 		 762 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5366  heavy metal translocating P-type ATPase  52.31 
 
 		 1021 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5494  heavy metal translocating P-type ATPase  52.31 
 
 		 1021 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0117323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0924  heavy metal translocating P-type ATPase  52.24 
 
 		 835 aa  61.2  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3217  heavy metal translocating P-type ATPase  51.61 
 
 		 741 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3584  copper-translocating P-type ATPase  44.12 
 
 		 805 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3653  heavy metal translocating P-type ATPase  44.12 
 
 		 805 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3496  copper-translocating P-type ATPase  44.12 
 
 		 805 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  54.84 
 
 		 841 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  46.88 
 
 		 852 aa  60.1  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2107  putative mercuric reductase  48.65 
 
 		 547 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3220  copper exporting ATPase  44.62 
 
 		 907 aa  60.1  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  48.44 
 
 		 885 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0162  copper-translocating P-type ATPase  50.79 
 
 		 1040 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  46.97 
 
 		 855 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2481  putative mercuric reductase  48.65 
 
 		 547 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0761993  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  45.07 
 
 		 849 aa  59.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21010  copper-translocating P-type ATPase  45.45 
 
 		 829 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3006  copper-translocating P-type ATPase  43.75 
 
 		 850 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40662  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2449  Heavy metal transport/detoxification protein  46.67 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228051  normal  0.0680079 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  46.88 
 
 		 1182 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1752  Heavy metal transport/detoxification protein  46.27 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2317  heavy metal translocating P-type ATPase  47.06 
 
 		 829 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0962  copper exporting ATPase  42.19 
 
 		 832 aa  57.8  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.220688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3789  copper-translocating P-type ATPase  43.75 
 
 		 860 aa  57.4  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0405  cation-transporting ATPase membrane protein  48.53 
 
 		 1061 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1212  Heavy metal transport/detoxification protein  48.39 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0854  copper-translocating P-type ATPase  48.53 
 
 		 1061 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1851  copper-translocating P-type ATPase  48.53 
 
 		 1061 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.845444  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1755  copper-translocating P-type ATPase  48.53 
 
 		 1061 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55306  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1144  copper-translocating P-type ATPase  48.53 
 
 		 1063 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0316  cation-transporting ATPase membrane protein  48.53 
 
 		 1063 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.707407  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  46.77 
 
 		 833 aa  57  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 		 827 aa  57  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3165  copper exporting ATPase  46.15 
 
 		 961 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.517155  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0606  copper exporting ATPase  44.26 
 
 		 833 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2074  Heavy metal transport/detoxification protein  55.56 
 
 		 68 aa  57  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0654  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  42.25 
 
 		 732 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0141  Heavy metal transport/detoxification protein  43.28 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2448  heavy metal-binding protein, putative  55.56 
 
 		 68 aa  57  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0545  copper exporting ATPase  44.26 
 
 		 833 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0325  heavy metal translocating P-type ATPase  48.44 
 
 		 821 aa  56.6  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1265  copper exporting ATPase  46.15 
 
 		 955 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.057349 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0552  copper exporting ATPase  44.26 
 
 		 833 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0562  copper exporting ATPase  44.26 
 
 		 833 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.304776  normal  0.828863 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  47.69 
 
 		 790 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0547  copper exporting ATPase  44.26 
 
 		 833 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0661  copper-translocating P-type ATPase  44.62 
 
 		 797 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2168  copper-translocating P-type ATPase  46.27 
 
 		 971 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1570  hypothetical protein  40.32 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18070  putative periplasmic metal-binding protein  40.32 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.65 
 
 		 473 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0460  heavy metal translocating P-type ATPase  43.33 
 
 		 748 aa  54.7  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.792118  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  47.06 
 
 		 835 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 68 aa  55.1  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  42.37 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0162  Heavy metal transport/detoxification protein  44.12 
 
 		 228 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.988191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6893  heavy metal translocating P-type ATPase  44.62 
 
 		 872 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.172746  normal  0.265411 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3818  copper-translocating P-type ATPase  42.19 
 
 		 747 aa  55.1  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.585028  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5373  heavy metal translocating P-type ATPase  49.23 
 
 		 937 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 840 aa  54.7  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  51.47 
 
 		 833 aa  55.1  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00355  Cation transport ATPase  38.46 
 
 		 782 aa  54.7  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  45.16 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3524  heavy metal translocating P-type ATPase  51.56 
 
 		 813 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4827  heavy metal translocating P-type ATPase  48.44 
 
 		 946 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  42.42 
 
 		 792 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2938  copper-translocating P-type ATPase  50 
 
 		 795 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0783  Heavy metal transport/detoxification protein  43.55 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.591809  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1661  heavy metal translocating P-type ATPase  44.12 
 
 		 825 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119959  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0143  Heavy metal transport/detoxification protein  39.71 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>