More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0926 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0926  Heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
68 aa  138  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1538  Heavy metal transport/detoxification protein  60.94 
 
 
74 aa  82.4  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0133712 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0090  heavy metal transport/detoxification protein  59.38 
 
 
72 aa  82  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1862  heavy metal-binding protein, putative  60.94 
 
 
74 aa  82.4  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2448  heavy metal-binding protein, putative  59.7 
 
 
68 aa  74.3  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2074  Heavy metal transport/detoxification protein  59.7 
 
 
68 aa  74.3  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  53.97 
 
 
67 aa  72.4  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0131  Heavy metal transport/detoxification protein  53.12 
 
 
67 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  54.84 
 
 
65 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1212  Heavy metal transport/detoxification protein  49.18 
 
 
78 aa  59.3  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2344  heavy metal transport/detoxification protein  47.06 
 
 
100 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177246  normal  0.640868 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  44.62 
 
 
835 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  45.9 
 
 
852 aa  57.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3726  copper ion binding protein  52.54 
 
 
64 aa  57.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.663439  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  42.37 
 
 
67 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  42.37 
 
 
67 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  42.37 
 
 
67 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1492  heavy metal transport/detoxification protein  44.78 
 
 
102 aa  57  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00435  copper transporter  46.67 
 
 
834 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3126  copper-translocating P-type ATPase  46.67 
 
 
834 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1916  copper-translocating P-type ATPase  50 
 
 
791 aa  56.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0563  copper exporting ATPase  46.67 
 
 
834 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0577  copper exporting ATPase  46.67 
 
 
834 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  46.88 
 
 
67 aa  56.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0523  copper exporting ATPase  46.67 
 
 
834 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0527  copper exporting ATPase  46.67 
 
 
834 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00440  hypothetical protein  46.67 
 
 
834 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3132  copper exporting ATPase  46.67 
 
 
834 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.142794  hitchhiker  0.000000556714 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0419  copper exporting ATPase  46.67 
 
 
834 aa  56.6  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  54.1 
 
 
841 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4520  heavy metal transport/detoxification protein  42.65 
 
 
97 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  47.62 
 
 
855 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4777  heavy metal translocating P-type ATPase  46.88 
 
 
1013 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3027  copper-translocating P-type ATPase  42.62 
 
 
939 aa  54.3  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  49.23 
 
 
1182 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1110  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 
938 aa  53.9  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0214095  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3220  copper exporting ATPase  44.44 
 
 
907 aa  53.9  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  48.44 
 
 
867 aa  53.5  0.0000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0162  copper-translocating P-type ATPase  46.03 
 
 
1040 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5366  heavy metal translocating P-type ATPase  46.77 
 
 
1021 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5494  heavy metal translocating P-type ATPase  46.77 
 
 
1021 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0117323  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0545  copper exporting ATPase  45 
 
 
833 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0633  heavy metal transport/detoxification protein  37.29 
 
 
65 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000319984 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1150  heavy metal transport/detoxification protein  49.25 
 
 
66 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0455128  hitchhiker  0.000000264701 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1097  copper exporting ATPase  46.03 
 
 
907 aa  53.5  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  47.54 
 
 
762 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3789  copper-translocating P-type ATPase  42.19 
 
 
860 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0962  copper exporting ATPase  45 
 
 
832 aa  53.5  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.220688  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  56.1 
 
 
976 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0588  heavy metal transport/detoxification protein  38.98 
 
 
65 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0606  copper exporting ATPase  45 
 
 
833 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0656  heavy metal transport/detoxification protein  42.37 
 
 
65 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00657939  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0547  copper exporting ATPase  45 
 
 
833 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0141  Heavy metal transport/detoxification protein  42.37 
 
 
65 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0420  Heavy metal transport/detoxification protein  42.62 
 
 
65 aa  52.8  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  41.79 
 
 
76 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0627  heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 
65 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00214961  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1031  copper-translocating P-type ATPase  47.62 
 
 
913 aa  52  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0323  heavy metal transport/detoxification protein  38.46 
 
 
66 aa  52.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.228429  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3543  heavy metal translocating P-type ATPase  42.65 
 
 
740 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0562  copper exporting ATPase  45 
 
 
833 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.304776  normal  0.828863 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2139  heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 
66 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0521  heavy metal translocating P-type ATPase  42.65 
 
 
807 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0143  Heavy metal transport/detoxification protein  42.37 
 
 
65 aa  52.4  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1467  heavy metal transport/detoxification protein  42.65 
 
 
97 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0552  copper exporting ATPase  45 
 
 
833 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1570  hypothetical protein  38.98 
 
 
65 aa  52  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0460  heavy metal translocating P-type ATPase  46.03 
 
 
748 aa  52  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.792118  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1659  copper ion binding protein  43.08 
 
 
75 aa  52  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.842806 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  47.54 
 
 
762 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  47.54 
 
 
767 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1807  cation transporter E1-E2 family ATPase  46.88 
 
 
915 aa  51.6  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  47.54 
 
 
762 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  47.54 
 
 
762 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  46.03 
 
 
833 aa  51.6  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2072  copper-translocating P-type ATPase  51.92 
 
 
725 aa  51.6  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00355  Cation transport ATPase  42.19 
 
 
782 aa  51.2  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18070  putative periplasmic metal-binding protein  38.98 
 
 
65 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  42.19 
 
 
839 aa  50.8  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2449  Heavy metal transport/detoxification protein  42.37 
 
 
64 aa  51.2  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228051  normal  0.0680079 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0933  heavy metal transport/detoxification protein  56.76 
 
 
96 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0661  copper-translocating P-type ATPase  47.62 
 
 
797 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21010  copper-translocating P-type ATPase  46.03 
 
 
829 aa  50.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  47.62 
 
 
849 aa  50.4  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  46.88 
 
 
817 aa  50.4  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3217  heavy metal translocating P-type ATPase  45.9 
 
 
741 aa  50.1  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2279  copper ion binding protein  43.33 
 
 
69 aa  50.1  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1265  copper exporting ATPase  41.54 
 
 
955 aa  49.7  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.057349 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3165  copper exporting ATPase  41.54 
 
 
961 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.517155  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0924  heavy metal translocating P-type ATPase  44.78 
 
 
835 aa  49.7  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2481  putative mercuric reductase  45 
 
 
547 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0761993  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0031  heavy metal translocating P-type ATPase  56.82 
 
 
747 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2107  putative mercuric reductase  45 
 
 
547 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0823  heavy metal transport/detoxification protein  33.9 
 
 
83 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
65 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0750  copper-translocating P-type ATPase  42.65 
 
 
732 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  52.08 
 
 
67 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  52.08 
 
 
67 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3006  copper-translocating P-type ATPase  39.68 
 
 
850 aa  49.3  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40662  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3818  copper-translocating P-type ATPase  41.27 
 
 
747 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.585028  normal  0.0148083 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>