More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2230 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2230  mercuric transport protein periplasmic protein  100 
 
 
91 aa  176  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1215  periplasmic mecuric binding protein, MerP  86.81 
 
 
91 aa  147  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0166  mercuric transport protein periplasmic component MerP  85.71 
 
 
91 aa  138  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.695125  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0092  mercuric transport protein periplasmic component  75.82 
 
 
91 aa  131  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4343  mercuric transport protein periplasmic component  86.81 
 
 
91 aa  131  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1211  mercuric transport protein periplasmic component  85.71 
 
 
91 aa  129  9e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154152  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6496  mercuric transport protein periplasmic protein  85.71 
 
 
91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43034  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6173  Hg(II) resistance protein MerP  85.71 
 
 
91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000203357  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6346  Hg(II) resistance protein MerP  85.71 
 
 
91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000621364  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15470  periplasmic mercuric ion binding protein, MerP  85.71 
 
 
91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000149366  unclonable  3.5058299999999997e-22 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0103  mercuric transport protein periplasmic component  85.71 
 
 
91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2339  mercuric transport protein periplasmic component  85.71 
 
 
91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832464  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2131  mercuric transport protein periplasmic component  83.52 
 
 
91 aa  128  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0081  mercuric transport protein periplasmic component  83.52 
 
 
91 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.675229 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1785  mercuric transport protein periplasmic component  84.29 
 
 
90 aa  121  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37235  normal  0.942363 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2271  mercuric transport protein periplasmic component  67.42 
 
 
94 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.618304  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0484  mercuric transport protein periplasmic component  65.22 
 
 
92 aa  117  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1299  mercuric transport protein periplasmic component  77.46 
 
 
95 aa  113  6.9999999999999995e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2314  mercuric transport protein periplasmic protein  77.46 
 
 
95 aa  113  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118185  hitchhiker  0.0000281671 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1393  mercuric transport protein periplasmic component  60.44 
 
 
98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1476  mercuric transport protein periplasmic component  61.8 
 
 
94 aa  110  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.241266  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0240  mercuric transport protein periplasmic component  56.67 
 
 
98 aa  109  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4796  mercuric transport protein periplasmic protein  55.06 
 
 
94 aa  107  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4012  mercuric transport protein periplasmic component  59.55 
 
 
100 aa  102  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0169  mercuric transport protein periplasmic component  53.85 
 
 
91 aa  97.1  7e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1340  mercuric transport protein periplasmic protein  55.06 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.023175  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3490  mercuric transport protein periplasmic component  51.61 
 
 
95 aa  92  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4313  mercuric transport protein periplasmic component  49.45 
 
 
91 aa  90.1  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0113  mercuric transport protein periplasmic component  51.14 
 
 
91 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.827734  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4417  mercuric transport protein periplasmic protein  47.87 
 
 
94 aa  83.6  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192588  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02043  Mercury scavenger protein:Heavy-metal-associated domain  50.68 
 
 
85 aa  82  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525841  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01410  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  50.68 
 
 
94 aa  80.1  0.000000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0239  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  48.91 
 
 
94 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1663  PBP/HMA domain-containing protein  54.29 
 
 
94 aa  78.2  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140862  normal  0.759256 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2902  mercuric transport protein periplasmic component  44.44 
 
 
98 aa  75.5  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3158  heavy metal transport/detoxification protein  44.44 
 
 
97 aa  76.3  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.299489  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0798  heavy metal transport/detoxification protein  45.56 
 
 
98 aa  75.5  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.885696 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2511  mercuric transport protein periplasmic protein  48.05 
 
 
99 aa  73.9  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2328  heavy metal transport/detoxification protein  43.66 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02958  putative mercuric transport protein periplasmic binding protein  47.54 
 
 
61 aa  67.8  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000221082  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1666  copper ion binding protein  37.5 
 
 
73 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121778  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2684  heavy metal transport/detoxification protein  41.1 
 
 
109 aa  62.4  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1945  mercuric transport protein periplasmic component  43.33 
 
 
112 aa  61.6  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.230476  normal  0.0101145 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  42.42 
 
 
68 aa  59.7  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  37.5 
 
 
67 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  37.5 
 
 
67 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3089  heavy metal transport/detoxification protein  31.94 
 
 
199 aa  58.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3726  copper ion binding protein  45.31 
 
 
64 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.663439  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1638  putative MerP, periplasmic heavy metal binding/chaperone protein  33.33 
 
 
74 aa  57.8  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.240185  hitchhiker  0.000119681 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  39.34 
 
 
818 aa  57.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  50.79 
 
 
67 aa  57.8  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  41.54 
 
 
821 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  41.79 
 
 
1087 aa  57  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  37.5 
 
 
67 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  43.08 
 
 
833 aa  56.6  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  39.06 
 
 
67 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1163  copper ion binding protein  40.62 
 
 
74 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  35.48 
 
 
68 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  36.76 
 
 
954 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1872  heavy metal transport/detoxification protein  31.94 
 
 
74 aa  55.5  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.230412  unclonable  0.0000667879 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  44.62 
 
 
837 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  39.06 
 
 
68 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  41.79 
 
 
837 aa  55.5  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4421  copper-translocating P-type ATPase  44.12 
 
 
762 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.900391  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0143  heavy metal translocating P-type ATPase  37.88 
 
 
871 aa  55.1  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  34.43 
 
 
68 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2066  mercuric transport protein periplasmic component  36.67 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.131974  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1149  copper ion binding protein  42.19 
 
 
74 aa  55.1  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  34.43 
 
 
68 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  38.46 
 
 
759 aa  55.5  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  36.51 
 
 
71 aa  54.3  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1110  heavy metal translocating P-type ATPase  36.84 
 
 
938 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0214095  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6742  Heavy metal transport/detoxification protein  35.82 
 
 
196 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.685267 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  33.33 
 
 
70 aa  53.9  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1389  Mercuric transport protein MerT  39.13 
 
 
209 aa  53.5  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000264548  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  44.26 
 
 
942 aa  53.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  38.1 
 
 
839 aa  53.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1541  heavy metal transport/detoxification protein  38.89 
 
 
125 aa  53.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.45566  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0119  heavy metal translocating P-type ATPase  33.82 
 
 
816 aa  53.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  40.62 
 
 
885 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  31.94 
 
 
797 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3052  heavy metal translocating P-type ATPase  37.88 
 
 
866 aa  52.4  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  29.58 
 
 
798 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  29.58 
 
 
798 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  41.54 
 
 
838 aa  52.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  31.82 
 
 
68 aa  51.6  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1882  mercury ion binding protein  31.82 
 
 
68 aa  52  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.174635  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0205  heavy metal translocating P-type ATPase  32.86 
 
 
823 aa  52  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  36.07 
 
 
806 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2276  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 
801 aa  51.6  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  36.51 
 
 
67 aa  51.6  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  41.1 
 
 
855 aa  52  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  36.07 
 
 
806 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3281  heavy metal translocating P-type ATPase  34.85 
 
 
699 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  34.43 
 
 
815 aa  51.2  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0485  heavy metal translocating P-type ATPase  38.33 
 
 
724 aa  51.6  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.265664  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  32.35 
 
 
805 aa  50.8  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  36.07 
 
 
805 aa  51.2  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  41.27 
 
 
836 aa  51.2  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>