More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1538 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1862  heavy metal-binding protein, putative  100 
 
 		 74 aa  148  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1538  Heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 74 aa  148  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0133712 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2074  Heavy metal transport/detoxification protein  82.54 
 
 		 68 aa  98.2  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2448  heavy metal-binding protein, putative  82.54 
 
 		 68 aa  98.2  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0926  Heavy metal transport/detoxification protein  60.94 
 
 		 68 aa  82.4  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0131  Heavy metal transport/detoxification protein  53.23 
 
 		 67 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0090  heavy metal transport/detoxification protein  53.23 
 
 		 72 aa  66.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3165  copper exporting ATPase  50 
 
 		 961 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.517155  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1265  copper exporting ATPase  50 
 
 		 955 aa  64.7  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.057349 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1212  Heavy metal transport/detoxification protein  50.79 
 
 		 78 aa  64.3  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  51.67 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3726  copper ion binding protein  53.33 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.663439  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 67 aa  61.2  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3220  copper exporting ATPase  48.39 
 
 		 907 aa  60.8  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3027  copper exporting ATPase  46.88 
 
 		 955 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  46.27 
 
 		 817 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1097  copper exporting ATPase  46.77 
 
 		 907 aa  58.2  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2139  heavy metal transport/detoxification protein  47.62 
 
 		 66 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  46.27 
 
 		 67 aa  57.4  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0823  heavy metal transport/detoxification protein  43.33 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  42.03 
 
 		 835 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1570  hypothetical protein  45 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0143  Heavy metal transport/detoxification protein  42.37 
 
 		 65 aa  57  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3027  copper-translocating P-type ATPase  40 
 
 		 939 aa  56.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18070  putative periplasmic metal-binding protein  46.67 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4777  heavy metal translocating P-type ATPase  47.69 
 
 		 1013 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0323  heavy metal transport/detoxification protein  43.55 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.228429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  48.44 
 
 		 855 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  42.03 
 
 		 833 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1031  copper-translocating P-type ATPase  38.24 
 
 		 913 aa  53.9  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0419  copper exporting ATPase  45.9 
 
 		 834 aa  52.8  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  49.18 
 
 		 841 aa  53.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0162  copper-translocating P-type ATPase  46.88 
 
 		 1040 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0523  copper exporting ATPase  45.9 
 
 		 834 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  43.75 
 
 		 852 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3006  copper-translocating P-type ATPase  42.19 
 
 		 850 aa  53.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40662  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5366  heavy metal translocating P-type ATPase  47.62 
 
 		 1021 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5494  heavy metal translocating P-type ATPase  47.62 
 
 		 1021 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0117323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0577  copper exporting ATPase  45.9 
 
 		 834 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00435  copper transporter  45.9 
 
 		 834 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3126  copper-translocating P-type ATPase  45.9 
 
 		 834 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  45.07 
 
 		 976 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0420  Heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2344  heavy metal transport/detoxification protein  41.79 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177246  normal  0.640868 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00440  hypothetical protein  45.9 
 
 		 834 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3132  copper exporting ATPase  45.9 
 
 		 834 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.142794  hitchhiker  0.000000556714 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1659  copper ion binding protein  40.58 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.842806 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0527  copper exporting ATPase  45.9 
 
 		 834 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0563  copper exporting ATPase  45.9 
 
 		 834 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0890  mercuric reductase  48.33 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000328424  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0962  copper exporting ATPase  46.77 
 
 		 832 aa  52.4  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.220688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  40.68 
 
 		 65 aa  52  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  41.43 
 
 		 762 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  41.43 
 
 		 762 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  41.43 
 
 		 767 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  41.43 
 
 		 762 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0910  heavy metal transport/detoxification protein  40.91 
 
 		 70 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  42.25 
 
 		 827 aa  51.2  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2186  heavy metal transport/detoxification protein  41.27 
 
 		 70 aa  51.6  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603355  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  41.43 
 
 		 762 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4497  heavy metal transport/detoxification protein  42.42 
 
 		 69 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.499051 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  37.31 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  40.3 
 
 		 835 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0141  Heavy metal transport/detoxification protein  40.68 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3169  Heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145614 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0545  copper exporting ATPase  47.54 
 
 		 833 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  43.55 
 
 		 867 aa  50.4  0.000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01260  copper/silver-translocating P-type ATPase  45.16 
 
 		 905 aa  50.4  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0606  copper exporting ATPase  47.54 
 
 		 833 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3543  heavy metal translocating P-type ATPase  40.58 
 
 		 740 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0552  copper exporting ATPase  47.54 
 
 		 833 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0562  copper exporting ATPase  47.54 
 
 		 833 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.304776  normal  0.828863 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01268  cation transport ATPase  39.39 
 
 		 898 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.75 
 
 		 473 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0162  Heavy metal transport/detoxification protein  43.75 
 
 		 228 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.988191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0633  heavy metal transport/detoxification protein  36.67 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319984 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1705  Heavy metal transport/detoxification protein  46.27 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0720999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5319  Heavy metal transport/detoxification protein  46.27 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  39.39 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1467  heavy metal transport/detoxification protein  41.79 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1492  heavy metal transport/detoxification protein  40.3 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2476  Heavy metal transport/detoxification protein  43.94 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.270205  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1851  copper-translocating P-type ATPase  45.45 
 
 		 1061 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.845444  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1882  mercury ion binding protein  39.34 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.174635  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1755  copper-translocating P-type ATPase  44.12 
 
 		 1061 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55306  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4576  heavy metal transport/detoxification protein  41.67 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.016584  normal  0.0171789 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4872  heavy metal translocating P-type ATPase  42.65 
 
 		 816 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  40.3 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  40.3 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3237  Heavy metal transport/detoxification protein  44.78 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.28951  normal  0.700425 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0547  copper exporting ATPase  40.98 
 
 		 833 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0405  cation-transporting ATPase membrane protein  45.45 
 
 		 1061 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0316  cation-transporting ATPase membrane protein  45.45 
 
 		 1063 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.707407  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2388  heavy-metal transporting P-type ATPase  40.85 
 
 		 819 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168329  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0854  copper-translocating P-type ATPase  45.45 
 
 		 1061 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1144  copper-translocating P-type ATPase  45.45 
 
 		 1063 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  37.88 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.399491 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>