276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0933 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0933  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
96 aa  199  9e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3169  Heavy metal transport/detoxification protein  68.75 
 
 
65 aa  99.4  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145614 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1312  mercuric transport protein periplasmic component  59.09 
 
 
68 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629911  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  50.79 
 
 
67 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  50.79 
 
 
67 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0968  Heavy metal transport/detoxification protein  44.44 
 
 
66 aa  68.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  46.88 
 
 
65 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  49.23 
 
 
67 aa  63.5  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  45.16 
 
 
68 aa  62  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  48.39 
 
 
68 aa  60.1  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  48.39 
 
 
68 aa  60.1  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  45.31 
 
 
67 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  45.16 
 
 
67 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  46.88 
 
 
71 aa  58.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  46.88 
 
 
68 aa  58.2  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 
65 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1795  Heavy metal transport/detoxification protein  41.67 
 
 
75 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  47.54 
 
 
67 aa  57  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  45.31 
 
 
67 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  42.42 
 
 
70 aa  56.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0131  Heavy metal transport/detoxification protein  44.07 
 
 
67 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1877  Heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 
65 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  41.27 
 
 
976 aa  55.1  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  49.18 
 
 
67 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1697  copper ion-binding  39.68 
 
 
69 aa  54.7  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000580158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  49.18 
 
 
67 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  49.18 
 
 
67 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2139  heavy metal transport/detoxification protein  48.39 
 
 
66 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  47.46 
 
 
827 aa  54.3  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  38.71 
 
 
68 aa  53.9  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  38.71 
 
 
835 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  37.1 
 
 
69 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  41.27 
 
 
69 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1291  Heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 
69 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3726  copper ion binding protein  49.12 
 
 
64 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.663439  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  45.76 
 
 
826 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  37.84 
 
 
839 aa  52.8  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6797  Heavy metal transport/detoxification protein  37.5 
 
 
70 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 
69 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  41.27 
 
 
942 aa  52  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11723  heavy-metal transporting P-type ATPase  42.37 
 
 
835 aa  52.4  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0439709  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1882  mercury ion binding protein  39.34 
 
 
68 aa  51.6  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.174635  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  31.25 
 
 
65 aa  51.6  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1340  mercuric transport protein periplasmic protein  43.55 
 
 
108 aa  51.2  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.023175  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1163  copper ion binding protein  43.55 
 
 
74 aa  50.8  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0926  Heavy metal transport/detoxification protein  56.76 
 
 
68 aa  51.2  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1450  heavy metal transport/detoxification protein  34.18 
 
 
113 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84044  copper-transporting ATPase (Cu(2+)-ATPase)  37.1 
 
 
1196 aa  50.4  0.000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00231928  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19780  copper chaperone  38.98 
 
 
71 aa  50.4  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208404  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1149  copper ion binding protein  39.24 
 
 
74 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6893  heavy metal translocating P-type ATPase  38.33 
 
 
872 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.172746  normal  0.265411 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  37.29 
 
 
69 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1468  heavy metal transport/detoxification protein  36.67 
 
 
70 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2471  Heavy metal transport/detoxification protein  38.98 
 
 
108 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  35.48 
 
 
817 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0650256 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0460  heavy metal translocating P-type ATPase  35.48 
 
 
748 aa  48.5  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.792118  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 
71 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0890  mercuric reductase  37.1 
 
 
66 aa  48.5  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000328424  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  37.29 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  35.62 
 
 
852 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0090  heavy metal transport/detoxification protein  44.19 
 
 
72 aa  48.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1538  Heavy metal transport/detoxification protein  54.05 
 
 
74 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0133712 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1862  heavy metal-binding protein, putative  54.05 
 
 
74 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5366  heavy metal translocating P-type ATPase  38.71 
 
 
1021 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5494  heavy metal translocating P-type ATPase  38.71 
 
 
1021 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0117323  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2449  Heavy metal transport/detoxification protein  35.48 
 
 
64 aa  47.8  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228051  normal  0.0680079 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  31.75 
 
 
68 aa  47.4  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1809  copper ion binding protein  40 
 
 
75 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.865359  normal  0.918649 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  33.87 
 
 
78 aa  47.8  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4448  heavy metal transport/detoxification protein  34.92 
 
 
67 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866926  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3668  Heavy metal transport/detoxification protein  38.46 
 
 
74 aa  47.4  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3220  copper exporting ATPase  40 
 
 
907 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1492  heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 
102 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1695  Heavy metal transport/detoxification protein  42.86 
 
 
69 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.583772  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  36.07 
 
 
954 aa  47  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1031  copper-translocating P-type ATPase  39.68 
 
 
913 aa  47  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2690  heavy metal translocating P-type ATPase  40.32 
 
 
832 aa  47  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2271  mercuric transport protein periplasmic component  39.34 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.618304  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  38.71 
 
 
835 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04940  copper chaperone  42.86 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  38.71 
 
 
790 aa  46.2  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1389  Mercuric transport protein MerT  38.1 
 
 
209 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000264548  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2168  copper-translocating P-type ATPase  38.98 
 
 
971 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1209  mercuric reductase  33.87 
 
 
565 aa  46.2  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.375903  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  37.1 
 
 
839 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0674  Heavy metal transport/detoxification protein  35.94 
 
 
68 aa  47  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  34.92 
 
 
799 aa  46.2  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  29.03 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4090  heavy metal translocating P-type ATPase  37.29 
 
 
813 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.670864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4552  heavy metal transport/detoxification protein  35 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939957  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2917  heavy metal translocating P-type ATPase  40.32 
 
 
832 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  37.1 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2339  mercuric transport protein periplasmic component  39.34 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832464  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1572  heavy metal translocating P-type ATPase  36.67 
 
 
856 aa  45.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6496  mercuric transport protein periplasmic protein  39.34 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43034  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6346  Hg(II) resistance protein MerP  39.34 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000621364  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3258  Heavy metal transport/detoxification protein  35.82 
 
 
160 aa  45.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15470  periplasmic mercuric ion binding protein, MerP  39.34 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000149366  unclonable  3.5058299999999997e-22 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  31.75 
 
 
894 aa  45.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>