More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_84044 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001302  ANIA_03624  copper resistance P-type ATPase (Eurofung)  36.6 
 
 
1182 aa  649    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.102947 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84044  copper-transporting ATPase (Cu(2+)-ATPase)  100 
 
 
1196 aa  2441    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00231928  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01400  copper-exporting ATPase, putative  35.01 
 
 
1055 aa  507  9.999999999999999e-143  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5366  heavy metal translocating P-type ATPase  29.38 
 
 
1021 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5494  heavy metal translocating P-type ATPase  29.38 
 
 
1021 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0117323  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  30.7 
 
 
1182 aa  444  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  31.14 
 
 
954 aa  439  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  30.96 
 
 
942 aa  439  1e-121  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  34.78 
 
 
803 aa  438  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  30.16 
 
 
976 aa  434  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  31.7 
 
 
849 aa  436  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4777  heavy metal translocating P-type ATPase  29.11 
 
 
1013 aa  436  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0162  copper-translocating P-type ATPase  29.22 
 
 
1040 aa  435  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  33.2 
 
 
837 aa  432  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_203  P-ATPase family transporter: copper ion; heavy metal translocating P-type ATPase-like protein  36.2 
 
 
761 aa  427  1e-118  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.512423 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2460  heavy metal translocating P-type ATPase  31.3 
 
 
836 aa  425  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00836136  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  31.92 
 
 
836 aa  426  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  31.71 
 
 
805 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  38.27 
 
 
797 aa  416  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  30.75 
 
 
857 aa  415  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  31.79 
 
 
894 aa  416  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  33.46 
 
 
752 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  31.42 
 
 
794 aa  409  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  35.68 
 
 
759 aa  409  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  31.77 
 
 
798 aa  409  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  35.68 
 
 
759 aa  409  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  31.91 
 
 
821 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  31.87 
 
 
802 aa  410  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  31.87 
 
 
802 aa  410  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  31.15 
 
 
826 aa  407  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  31.58 
 
 
827 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  31.61 
 
 
805 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  32.35 
 
 
797 aa  406  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  31.9 
 
 
818 aa  406  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2080  heavy metal translocating P-type ATPase  30.38 
 
 
814 aa  405  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0351429  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  31.05 
 
 
889 aa  403  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1754  heavy metal translocating P-type ATPase  31.26 
 
 
851 aa  406  1e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  30.5 
 
 
837 aa  406  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  36.49 
 
 
796 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  31.5 
 
 
805 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  31.79 
 
 
836 aa  402  9.999999999999999e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  35.2 
 
 
885 aa  401  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  31.05 
 
 
889 aa  402  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4827  heavy metal translocating P-type ATPase  29.17 
 
 
946 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  31.71 
 
 
806 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  31.89 
 
 
806 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  32.03 
 
 
840 aa  402  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  31.79 
 
 
826 aa  397  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  31.5 
 
 
805 aa  399  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  31.4 
 
 
805 aa  399  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0631  heavy metal translocating P-type ATPase  32.12 
 
 
800 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000735513 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  34.35 
 
 
753 aa  398  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1755  copper-translocating P-type ATPase  28.17 
 
 
1061 aa  399  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55306  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  32.1 
 
 
827 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  31.97 
 
 
838 aa  397  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5373  heavy metal translocating P-type ATPase  29.43 
 
 
937 aa  399  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  31.5 
 
 
806 aa  399  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  32.41 
 
 
817 aa  399  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1871  heavy metal translocating P-type ATPase  30.4 
 
 
866 aa  399  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000734074  normal  0.315442 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  32.91 
 
 
798 aa  396  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  31.18 
 
 
805 aa  395  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1851  copper-translocating P-type ATPase  28.13 
 
 
1061 aa  395  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.845444  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0854  copper-translocating P-type ATPase  28.13 
 
 
1061 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  32.91 
 
 
798 aa  396  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  31.18 
 
 
805 aa  395  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  30.82 
 
 
826 aa  395  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  35.43 
 
 
750 aa  396  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  31.66 
 
 
841 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2692  heavy metal translocating P-type ATPase  30.91 
 
 
887 aa  395  1e-108  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0975857 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  31.68 
 
 
852 aa  395  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  35.58 
 
 
758 aa  395  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1144  copper-translocating P-type ATPase  28.13 
 
 
1063 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0316  cation-transporting ATPase membrane protein  28.04 
 
 
1063 aa  393  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.707407  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0405  cation-transporting ATPase membrane protein  28.22 
 
 
1061 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  31.46 
 
 
815 aa  391  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  35.48 
 
 
831 aa  392  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1259  heavy metal translocating P-type ATPase  31.19 
 
 
834 aa  393  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.499676  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  31.84 
 
 
814 aa  392  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2900  heavy metal translocating P-type ATPase  30.37 
 
 
795 aa  393  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0179481  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3877  copper-translocating P-type ATPase  32.76 
 
 
760 aa  390  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00336349  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  34.77 
 
 
828 aa  389  1e-106  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  36.47 
 
 
804 aa  388  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  31.52 
 
 
828 aa  389  1e-106  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3052  heavy metal translocating P-type ATPase  31.94 
 
 
866 aa  388  1e-106  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  31.93 
 
 
833 aa  389  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4090  heavy metal translocating P-type ATPase  34.66 
 
 
813 aa  389  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.670864 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  32.42 
 
 
799 aa  389  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_824  cation transport ATPase  34.94 
 
 
828 aa  389  1e-106  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  30.91 
 
 
835 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0661  copper-translocating P-type ATPase  32.1 
 
 
797 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  31.26 
 
 
836 aa  385  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1570  heavy metal translocating P-type ATPase  33.42 
 
 
747 aa  386  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.706467  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  31.37 
 
 
861 aa  383  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  31.26 
 
 
836 aa  385  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  31.83 
 
 
841 aa  386  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0297  heavy metal translocating P-type ATPase  33.21 
 
 
744 aa  384  1e-105  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03117  copper resistance P-type ATPase (Eurofung)  28.56 
 
 
1211 aa  380  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.208489  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  35.1 
 
 
837 aa  382  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  31.02 
 
 
837 aa  382  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  30.77 
 
 
835 aa  381  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>