More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNN01400 on replicon NC_006683
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001302  ANIA_03624  copper resistance P-type ATPase (Eurofung)  44.78 
 
 
1182 aa  649    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.102947 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01400  copper-exporting ATPase, putative  100 
 
 
1055 aa  2132    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  36.76 
 
 
815 aa  514  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84044  copper-transporting ATPase (Cu(2+)-ATPase)  35.18 
 
 
1196 aa  513  1e-144  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00231928  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  36.17 
 
 
836 aa  508  9.999999999999999e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  34.36 
 
 
889 aa  501  1e-140  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  36.38 
 
 
797 aa  500  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  35.89 
 
 
798 aa  497  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  34.78 
 
 
889 aa  496  1e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  36.91 
 
 
814 aa  493  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  35.27 
 
 
794 aa  492  1e-137  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  36.36 
 
 
753 aa  491  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  35.67 
 
 
857 aa  488  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  35.4 
 
 
836 aa  487  1e-136  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  35.7 
 
 
805 aa  486  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  35.38 
 
 
894 aa  485  1e-135  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  36.09 
 
 
942 aa  485  1e-135  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0657  copper-translocating P-type ATPase  41.42 
 
 
724 aa  484  1e-135  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.737443  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  34.75 
 
 
797 aa  480  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  35.55 
 
 
821 aa  483  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  36.16 
 
 
818 aa  480  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  35.81 
 
 
838 aa  483  1e-134  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  33.58 
 
 
885 aa  476  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  35.82 
 
 
803 aa  475  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  34.31 
 
 
802 aa  473  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  34.64 
 
 
826 aa  475  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  34.31 
 
 
802 aa  473  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  34.92 
 
 
752 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  36.41 
 
 
743 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  34.69 
 
 
826 aa  470  1.0000000000000001e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  36.21 
 
 
806 aa  473  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1110  heavy metal translocating P-type ATPase  32.93 
 
 
938 aa  468  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0214095  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  35.59 
 
 
806 aa  469  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  34.21 
 
 
796 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01260  copper/silver-translocating P-type ATPase  39.53 
 
 
905 aa  469  9.999999999999999e-131  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  35.37 
 
 
806 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  35.48 
 
 
805 aa  463  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  35.48 
 
 
805 aa  463  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  34.5 
 
 
827 aa  463  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  35.65 
 
 
750 aa  466  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  35.48 
 
 
805 aa  463  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  35.09 
 
 
759 aa  466  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  35.09 
 
 
759 aa  466  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2460  heavy metal translocating P-type ATPase  33.77 
 
 
836 aa  461  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00836136  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  35.37 
 
 
805 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  35.37 
 
 
805 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  36.09 
 
 
839 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  35.16 
 
 
799 aa  460  9.999999999999999e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0905  heavy metal translocating P-type ATPase  34.76 
 
 
802 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.631984  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  35.4 
 
 
805 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  36.61 
 
 
797 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3106  copper-translocating P-type ATPase  37.4 
 
 
742 aa  461  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138352  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  35.45 
 
 
833 aa  459  1e-127  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  35.58 
 
 
849 aa  458  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  34.48 
 
 
837 aa  456  1e-127  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  34.62 
 
 
798 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  34.62 
 
 
798 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1259  heavy metal translocating P-type ATPase  35.04 
 
 
834 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.499676  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  34.59 
 
 
826 aa  449  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0924  heavy metal translocating P-type ATPase  34.24 
 
 
835 aa  452  1e-125  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  33.87 
 
 
954 aa  450  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2925  heavy metal translocating P-type ATPase  37.99 
 
 
767 aa  451  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3067  heavy metal translocating P-type ATPase  34.16 
 
 
824 aa  452  1e-125  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3877  copper-translocating P-type ATPase  38.81 
 
 
760 aa  448  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00336349  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1313  heavy metal translocating P-type ATPase  35.49 
 
 
868 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000605467  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00260  putative copper transport-related membrane protein  36.72 
 
 
741 aa  446  1.0000000000000001e-124  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.348825  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2452  copper-translocating P-type ATPase  36.11 
 
 
797 aa  445  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.7313  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  35.82 
 
 
867 aa  446  1e-123  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  37.16 
 
 
759 aa  445  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  33.08 
 
 
976 aa  444  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  34.32 
 
 
827 aa  446  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  33.12 
 
 
833 aa  444  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6890  copper-translocating P-type ATPase  36.19 
 
 
754 aa  443  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0119  heavy metal translocating P-type ATPase  34.24 
 
 
816 aa  446  1e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  34.46 
 
 
837 aa  443  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0385  copper-transporter ATPase CopA  35.99 
 
 
744 aa  442  9.999999999999999e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  33.66 
 
 
817 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  33.7 
 
 
861 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2454  heavy metal translocating P-type ATPase  36.05 
 
 
824 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000374704  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4950  copper-translocating P-type ATPase  38.54 
 
 
748 aa  442  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.113213 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1546  cation transport ATPase  35.87 
 
 
742 aa  442  9.999999999999999e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  36.09 
 
 
758 aa  437  1e-121  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_824  cation transport ATPase  33.19 
 
 
828 aa  437  1e-121  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2772  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  36.71 
 
 
798 aa  439  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1570  heavy metal translocating P-type ATPase  37.32 
 
 
747 aa  439  1e-121  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.706467  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11220  copper/silver-translocating P-type ATPase  35.44 
 
 
925 aa  436  1e-121  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.363514 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2080  heavy metal translocating P-type ATPase  34.75 
 
 
814 aa  436  1e-121  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0351429  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1873  heavy metal translocating P-type ATPase  34.13 
 
 
821 aa  439  1e-121  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3058  copper-translocating P-type ATPase  37.43 
 
 
740 aa  436  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1754  heavy metal translocating P-type ATPase  34.9 
 
 
851 aa  435  1e-120  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2923  heavy metal translocating P-type ATPase  35.27 
 
 
795 aa  435  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000167439  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  35.77 
 
 
837 aa  435  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1499  cation-transporting ATPase; copper-exporting ATPase  34.35 
 
 
804 aa  435  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.037718  normal  0.0386539 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6644  copper-translocating P-type ATPase  37.01 
 
 
753 aa  434  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.935468  normal  0.257295 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1871  heavy metal translocating P-type ATPase  31.93 
 
 
866 aa  434  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000734074  normal  0.315442 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  33.51 
 
 
833 aa  435  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3653  heavy metal translocating P-type ATPase  40.2 
 
 
805 aa  435  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_203  P-ATPase family transporter: copper ion; heavy metal translocating P-type ATPase-like protein  36.76 
 
 
761 aa  432  1e-119  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.512423 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  33.55 
 
 
836 aa  431  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  33.55 
 
 
836 aa  431  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>