119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1312 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1312  mercuric transport protein periplasmic component  100 
 
 
68 aa  140  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629911  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3169  Heavy metal transport/detoxification protein  58.82 
 
 
65 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145614 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0933  heavy metal transport/detoxification protein  59.09 
 
 
96 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  45.59 
 
 
65 aa  67  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  46.15 
 
 
65 aa  63.5  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  45.31 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  45.31 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  47.62 
 
 
67 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0968  Heavy metal transport/detoxification protein  39.71 
 
 
66 aa  57.4  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1877  Heavy metal transport/detoxification protein  41.18 
 
 
65 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  41.54 
 
 
70 aa  56.6  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1163  copper ion binding protein  50 
 
 
74 aa  55.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  41.27 
 
 
68 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0141  Heavy metal transport/detoxification protein  43.08 
 
 
65 aa  54.7  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  40 
 
 
67 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  46 
 
 
67 aa  53.5  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0420  Heavy metal transport/detoxification protein  47.69 
 
 
65 aa  53.5  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  44.62 
 
 
67 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  41.27 
 
 
68 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  42.86 
 
 
71 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1715  copper ion binding protein  43.28 
 
 
77 aa  52.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0879446  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  41.94 
 
 
67 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36140  copper chaperone  36.62 
 
 
100 aa  52.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.237573  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1149  copper ion binding protein  49.21 
 
 
74 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1795  Heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 
75 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  44.44 
 
 
942 aa  51.6  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3258  Heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 
160 aa  51.2  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  39.68 
 
 
68 aa  50.8  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  39.68 
 
 
68 aa  50.8  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  40.91 
 
 
67 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11723  heavy-metal transporting P-type ATPase  42.37 
 
 
835 aa  49.7  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0439709  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  34.43 
 
 
69 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  36.92 
 
 
68 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  38.81 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 
71 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6797  Heavy metal transport/detoxification protein  43.55 
 
 
70 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2500  Heavy metal transport/detoxification protein  34.92 
 
 
117 aa  48.5  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.711261 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  39.39 
 
 
894 aa  48.1  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0131  Heavy metal transport/detoxification protein  38.46 
 
 
67 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 
69 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2471  Heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  37.7 
 
 
69 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0143  Heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 
65 aa  47.8  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2449  Heavy metal transport/detoxification protein  33.82 
 
 
64 aa  47.4  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228051  normal  0.0680079 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 
839 aa  47  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  34.92 
 
 
68 aa  47  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  38.71 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1492  heavy metal transport/detoxification protein  40.3 
 
 
102 aa  46.2  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1871  heavy metal translocating P-type ATPase  34.33 
 
 
866 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000734074  normal  0.315442 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1291  Heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 
69 aa  46.2  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  35 
 
 
76 aa  46.2  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  40.3 
 
 
68 aa  46.2  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4448  heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 
67 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866926  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0014  copper ion binding protein  45.65 
 
 
75 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2279  copper ion binding protein  50 
 
 
69 aa  45.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2583  Heavy metal transport/detoxification protein  37.1 
 
 
82 aa  45.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.130658  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  38.1 
 
 
79 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0090  heavy metal transport/detoxification protein  32.84 
 
 
72 aa  45.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1809  copper ion binding protein  42.86 
 
 
75 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.865359  normal  0.918649 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  37.1 
 
 
69 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1386  Heavy metal transport/detoxification protein  38.1 
 
 
79 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  hitchhiker  0.000957123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1741  Heavy metal transport/detoxification protein  35 
 
 
73 aa  44.7  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246039  decreased coverage  0.0020488 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  32.26 
 
 
68 aa  45.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1697  copper ion-binding  34.92 
 
 
69 aa  44.7  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000580158  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3726  copper ion binding protein  36.92 
 
 
64 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.663439  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 
867 aa  44.3  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2601  Heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 
68 aa  44.3  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854669  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1882  mercury ion binding protein  35.38 
 
 
68 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.174635  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3668  Heavy metal transport/detoxification protein  34.43 
 
 
74 aa  44.3  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0691  Heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 
82 aa  43.9  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  32.79 
 
 
132 aa  43.9  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  33.33 
 
 
68 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0467  Heavy metal transport/detoxification protein  45.95 
 
 
70 aa  43.9  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1467  heavy metal transport/detoxification protein  38.24 
 
 
97 aa  43.9  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  29.51 
 
 
78 aa  43.9  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11368  heavy-metal transporting P-type ATPase  57.14 
 
 
824 aa  43.5  0.0009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4487  heavy metal transport/detoxification protein  41.27 
 
 
78 aa  42.7  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206644  normal  0.0472192 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2139  heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04940  copper chaperone  36.07 
 
 
109 aa  43.5  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2891  putative copper chaperone  30.88 
 
 
66 aa  42  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.480942  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0937  heavy metal transport/detoxification protein  39.71 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1081  heavy metal transport/detoxification protein  39.71 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3525  heavy metal transport/detoxification protein  36.92 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  47.37 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  47.37 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1537  heavy metal transport/detoxification protein  30.88 
 
 
66 aa  42  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.330529  normal  0.80617 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  47.37 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  35.48 
 
 
976 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  34.85 
 
 
65 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01270  putative metal-binding protein  37.5 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84044  copper-transporting ATPase (Cu(2+)-ATPase)  34.33 
 
 
1196 aa  41.6  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00231928  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4588  heavy metal transport/detoxification protein  34.43 
 
 
73 aa  41.6  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1690  copper-translocating P-type ATPase  35.38 
 
 
740 aa  41.6  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  36.92 
 
 
954 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0521  heavy metal translocating P-type ATPase  33.85 
 
 
807 aa  41.2  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18380  copper chaperone  34.43 
 
 
109 aa  41.6  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1752  Heavy metal transport/detoxification protein  45 
 
 
65 aa  41.6  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
758 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0890  mercuric reductase  30.16 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000328424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>