More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1467 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1467  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
97 aa  193  8.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4520  heavy metal transport/detoxification protein  77.32 
 
 
97 aa  143  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2344  heavy metal transport/detoxification protein  68.66 
 
 
100 aa  95.1  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177246  normal  0.640868 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1492  heavy metal transport/detoxification protein  55.22 
 
 
102 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5319  Heavy metal transport/detoxification protein  41.24 
 
 
97 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1705  Heavy metal transport/detoxification protein  41.24 
 
 
97 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0720999  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0633  heavy metal transport/detoxification protein  48.44 
 
 
65 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000319984 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  47.76 
 
 
65 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0588  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
65 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  47.69 
 
 
67 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  47.69 
 
 
67 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  47.69 
 
 
67 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0627  heavy metal transport/detoxification protein  48.44 
 
 
65 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00214961  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  35.63 
 
 
1182 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18070  putative periplasmic metal-binding protein  45.31 
 
 
65 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1555  heavy metal transport/detoxification protein  31.52 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  50 
 
 
68 aa  57.4  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  50 
 
 
67 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3543  heavy metal translocating P-type ATPase  34.57 
 
 
740 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13340  Heavy metal transport/detoxification protein  42.42 
 
 
69 aa  53.9  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000868167  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  41.67 
 
 
827 aa  53.9  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2317  heavy metal translocating P-type ATPase  39.13 
 
 
829 aa  53.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0131  Heavy metal transport/detoxification protein  43.28 
 
 
67 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  48.39 
 
 
79 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21010  copper-translocating P-type ATPase  44.62 
 
 
829 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  41.79 
 
 
792 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1570  hypothetical protein  42.19 
 
 
65 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  43.28 
 
 
792 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0926  Heavy metal transport/detoxification protein  42.65 
 
 
68 aa  52.4  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  41.18 
 
 
836 aa  52  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  43.55 
 
 
67 aa  52.8  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  45.45 
 
 
855 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  42.31 
 
 
817 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0823  heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 
83 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  41.18 
 
 
836 aa  52  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  42.42 
 
 
826 aa  51.6  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  40.62 
 
 
69 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1298  putative mercuric reductase  36.36 
 
 
562 aa  51.6  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.881891 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2464  heavy metal translocating P-type ATPase  40.48 
 
 
689 aa  51.6  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.301674  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0024  heavy metal translocating P-type ATPase  40.24 
 
 
757 aa  51.6  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  37.33 
 
 
852 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1659  copper ion binding protein  44.62 
 
 
75 aa  51.2  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.842806 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2511  mercuric transport protein periplasmic protein  37.68 
 
 
99 aa  51.2  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1386  Heavy metal transport/detoxification protein  48.39 
 
 
79 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  hitchhiker  0.000957123 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 
69 aa  50.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2228  putative mercuric reductase  37.63 
 
 
561 aa  50.4  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  44.07 
 
 
65 aa  50.4  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  41.79 
 
 
68 aa  50.4  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  37.68 
 
 
839 aa  50.1  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  45.16 
 
 
66 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  37.5 
 
 
68 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3027  copper-translocating P-type ATPase  39.13 
 
 
939 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1209  mercuric reductase  40.58 
 
 
565 aa  49.7  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.375903  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1862  heavy metal-binding protein, putative  41.79 
 
 
74 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  43.94 
 
 
67 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2466  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
745 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.392778  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  45.45 
 
 
867 aa  50.1  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4578  heavy metal translocating P-type ATPase  43.48 
 
 
799 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530867  decreased coverage  0.00687508 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1538  Heavy metal transport/detoxification protein  41.79 
 
 
74 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0133712 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0924  heavy metal translocating P-type ATPase  43.28 
 
 
835 aa  48.9  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0162  copper-translocating P-type ATPase  40.32 
 
 
1040 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1556  heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0631  heavy metal translocating P-type ATPase  41.79 
 
 
800 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000735513 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  40.3 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 
894 aa  49.7  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1785  mercuric transport protein periplasmic component  40.3 
 
 
90 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37235  normal  0.942363 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0821  heavy metal translocating P-type ATPase  41.79 
 
 
790 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0483  putative mercuric reductase  34.12 
 
 
562 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9003  hypothetical protein  51.06 
 
 
67 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.961553  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3726  copper ion binding protein  41.94 
 
 
64 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.663439  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  38.71 
 
 
835 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1952  putative cation-transporting ATPase membrane protein  34.57 
 
 
724 aa  48.5  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.51624  normal  0.45395 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2091  copper-translocating P-type ATPase  37.88 
 
 
750 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  31.88 
 
 
827 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4050  heavy metal transport/detoxification protein  41.27 
 
 
64 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  38.24 
 
 
77 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4777  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
1013 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2381  heavy metal translocating P-type ATPase  39.29 
 
 
772 aa  48.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1031  copper-translocating P-type ATPase  40.28 
 
 
913 aa  48.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1291  Heavy metal transport/detoxification protein  43.08 
 
 
69 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1666  copper ion binding protein  37.14 
 
 
73 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121778  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19780  copper chaperone  40.3 
 
 
71 aa  47.8  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208404  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3259  heavy metal translocating P-type ATPase  39.13 
 
 
884 aa  47.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.48196  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3354  heavy metal transport/detoxification protein  42.19 
 
 
66 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.702383 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  37.1 
 
 
839 aa  47.8  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3217  heavy metal translocating P-type ATPase  40.62 
 
 
741 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11220  copper/silver-translocating P-type ATPase  46.15 
 
 
925 aa  47.8  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.363514 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
71 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  37.31 
 
 
67 aa  47.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0750  copper-translocating P-type ATPase  39.44 
 
 
732 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  47.69 
 
 
827 aa  47.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2690  heavy metal translocating P-type ATPase  47.62 
 
 
832 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  36 
 
 
841 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4535  heavy metal translocating P-type ATPase  40.98 
 
 
734 aa  47.8  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4548  Heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
70 aa  47.4  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  39.39 
 
 
67 aa  47.4  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0663  heavy metal transport/detoxification protein  43.75 
 
 
65 aa  47  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1779  heavy metal transport/detoxification protein  46.15 
 
 
81 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616941  decreased coverage  0.00478886 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  58.33 
 
 
65 aa  47.4  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>