147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4588 on replicon NC_009806
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009806  Krad_4588  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
73 aa  143  8.000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3668  Heavy metal transport/detoxification protein  57.97 
 
 
74 aa  78.6  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  53.52 
 
 
76 aa  75.5  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1741  Heavy metal transport/detoxification protein  59.7 
 
 
73 aa  73.9  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246039  decreased coverage  0.0020488 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  57.58 
 
 
132 aa  73.2  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  53.52 
 
 
69 aa  71.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  56.72 
 
 
69 aa  70.9  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  53.73 
 
 
69 aa  69.3  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0674  Heavy metal transport/detoxification protein  52.17 
 
 
68 aa  69.3  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4098  heavy metal transport/detoxification protein  56.67 
 
 
76 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3669  heavy metal transport/detoxification protein  54.29 
 
 
80 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.792064  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5705  heavy metal transport/detoxification protein  51.43 
 
 
80 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5304  heavy metal transport/detoxification protein  51.43 
 
 
80 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562582  normal  0.337627 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3872  Heavy metal transport/detoxification protein  55.74 
 
 
79 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330902 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  51.52 
 
 
68 aa  65.5  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  50.77 
 
 
69 aa  63.5  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0115  Heavy metal transport/detoxification protein  52.24 
 
 
73 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  53.85 
 
 
69 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3258  Heavy metal transport/detoxification protein  47.06 
 
 
160 aa  62  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  49.25 
 
 
68 aa  62  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1695  Heavy metal transport/detoxification protein  52.94 
 
 
69 aa  62  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.583772  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  51.52 
 
 
71 aa  61.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6797  Heavy metal transport/detoxification protein  52.94 
 
 
70 aa  61.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4448  heavy metal transport/detoxification protein  44.29 
 
 
67 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866926  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  48.48 
 
 
78 aa  60.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21360  copper chaperone  53.23 
 
 
72 aa  60.5  0.000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.883325  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4548  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
70 aa  60.5  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2500  Heavy metal transport/detoxification protein  50.79 
 
 
117 aa  59.7  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.711261 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  48.48 
 
 
77 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  47.69 
 
 
70 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4020  Heavy metal transport/detoxification protein  48.44 
 
 
76 aa  58.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.343869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1795  Heavy metal transport/detoxification protein  50.77 
 
 
75 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2601  Heavy metal transport/detoxification protein  46.27 
 
 
68 aa  57.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854669  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  45.45 
 
 
68 aa  57  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3787  heavy metal transport/detoxification protein  57.14 
 
 
72 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3354  heavy metal transport/detoxification protein  42.42 
 
 
66 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.702383 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36140  copper chaperone  43.08 
 
 
100 aa  56.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.237573  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2471  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
108 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0014  copper ion binding protein  44.12 
 
 
75 aa  55.1  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04940  copper chaperone  48.48 
 
 
109 aa  54.7  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0015  hypothetical protein  43.94 
 
 
93 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36750  copper chaperone  42.65 
 
 
68 aa  55.1  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4552  heavy metal transport/detoxification protein  46.88 
 
 
70 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939957  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9003  hypothetical protein  52.94 
 
 
67 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.961553  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18380  copper chaperone  48.48 
 
 
109 aa  54.7  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19780  copper chaperone  43.75 
 
 
71 aa  54.3  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208404  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0489  heavy metal transport/detoxification protein  47.69 
 
 
74 aa  52.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158876  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2847  heavy metal transport/detoxification protein  46.03 
 
 
115 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.179669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3704  hypothetical protein  44.62 
 
 
99 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660005  normal  0.139636 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  43.75 
 
 
69 aa  52.4  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  46.03 
 
 
817 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  39.39 
 
 
76 aa  52  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1450  heavy metal transport/detoxification protein  43.75 
 
 
113 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1468  heavy metal transport/detoxification protein  43.75 
 
 
70 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4497  heavy metal transport/detoxification protein  43.75 
 
 
69 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.499051 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0910  heavy metal transport/detoxification protein  46.03 
 
 
70 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5745  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
68 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1651  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
67 aa  49.3  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2279  copper ion binding protein  40.58 
 
 
69 aa  49.7  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  37.88 
 
 
70 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0294  copper ion binding protein  37.5 
 
 
71 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  41.79 
 
 
804 aa  47.4  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6127  heavy metal transport/detoxification protein  46.38 
 
 
74 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0154405  normal  0.535186 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3243  heavy metal translocating P-type ATPase  38.46 
 
 
841 aa  45.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1163  Heavy metal transport/detoxification protein  50.79 
 
 
70 aa  44.7  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2344  heavy metal transport/detoxification protein  42.62 
 
 
100 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177246  normal  0.640868 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3412  copper ion binding protein  40 
 
 
74 aa  44.3  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0277616 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0030  Heavy metal transport/detoxification protein  41.18 
 
 
64 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  39.44 
 
 
852 aa  44.3  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  40.91 
 
 
67 aa  43.9  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1555  heavy metal transport/detoxification protein  37.29 
 
 
139 aa  43.5  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  36.92 
 
 
68 aa  43.9  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03624  copper resistance P-type ATPase (Eurofung)  43.4 
 
 
1182 aa  43.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.102947 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0008  copper-translocating P-type ATPase  40.91 
 
 
891 aa  43.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5366  heavy metal translocating P-type ATPase  44.44 
 
 
1021 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475647  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  37.93 
 
 
855 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5494  heavy metal translocating P-type ATPase  44.44 
 
 
1021 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0117323  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1492  heavy metal transport/detoxification protein  39.39 
 
 
102 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  37.1 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  37.1 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0783  Heavy metal transport/detoxification protein  38.1 
 
 
69 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.591809  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  38.46 
 
 
68 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10677  P1B, P type ATPase  37.88 
 
 
883 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.704376  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  38.46 
 
 
68 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  38.46 
 
 
68 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  34.92 
 
 
835 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0036  Heavy metal transport/detoxification protein  41.1 
 
 
65 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.749635  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1659  copper ion binding protein  42.86 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.842806 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1697  copper ion-binding  39.68 
 
 
69 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000580158  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0890  mercuric reductase  36.76 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000328424  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  36.36 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0933  heavy metal transport/detoxification protein  36.51 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0033  heavy metal transport/detoxification protein  41.43 
 
 
65 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0018  heavy metal transport/detoxification protein  41.1 
 
 
65 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0698  copper ion binding protein  34.92 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.031698  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4777  heavy metal translocating P-type ATPase  43.75 
 
 
1013 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  39.73 
 
 
69 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1553  heavy metal translocating P-type ATPase  39.71 
 
 
859 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.534956  normal  0.0124284 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1538  Heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 
74 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0133712 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1862  heavy metal-binding protein, putative  40.98 
 
 
74 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>