More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4448 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4448  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
67 aa  134  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866926  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2601  Heavy metal transport/detoxification protein  56.72 
 
 
68 aa  72.8  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854669  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  55.22 
 
 
68 aa  69.7  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  52.24 
 
 
69 aa  69.3  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  52.24 
 
 
69 aa  68.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  49.23 
 
 
68 aa  68.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  53.23 
 
 
68 aa  66.6  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  50.75 
 
 
70 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
71 aa  66.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  52.38 
 
 
69 aa  65.5  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  46.15 
 
 
69 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2500  Heavy metal transport/detoxification protein  49.25 
 
 
117 aa  63.5  0.0000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.711261 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  51.56 
 
 
77 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36750  copper chaperone  52.31 
 
 
68 aa  62.8  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36140  copper chaperone  50 
 
 
100 aa  61.6  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.237573  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0674  Heavy metal transport/detoxification protein  51.56 
 
 
68 aa  61.2  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  44.62 
 
 
78 aa  60.8  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3258  Heavy metal transport/detoxification protein  44.12 
 
 
160 aa  61.2  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4588  heavy metal transport/detoxification protein  44.29 
 
 
73 aa  60.8  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5745  heavy metal transport/detoxification protein  55.36 
 
 
68 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0489  heavy metal transport/detoxification protein  50.82 
 
 
74 aa  60.5  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158876  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0014  copper ion binding protein  52.31 
 
 
75 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  47.69 
 
 
76 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  42.86 
 
 
65 aa  58.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4098  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
76 aa  57.8  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  41.27 
 
 
792 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  47.69 
 
 
69 aa  57.8  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  42.86 
 
 
792 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4552  heavy metal transport/detoxification protein  47.69 
 
 
70 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939957  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19780  copper chaperone  44.44 
 
 
71 aa  57.4  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208404  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 
68 aa  57  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4497  heavy metal transport/detoxification protein  48.28 
 
 
69 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.499051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0015  hypothetical protein  50 
 
 
93 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1468  heavy metal transport/detoxification protein  46.15 
 
 
70 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0141  Heavy metal transport/detoxification protein  49.21 
 
 
65 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  43.75 
 
 
67 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2847  heavy metal transport/detoxification protein  47.69 
 
 
115 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.179669 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4548  Heavy metal transport/detoxification protein  49.12 
 
 
70 aa  55.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1450  heavy metal transport/detoxification protein  46.15 
 
 
113 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6797  Heavy metal transport/detoxification protein  46.88 
 
 
70 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  45.16 
 
 
67 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3872  Heavy metal transport/detoxification protein  46.15 
 
 
79 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330902 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  43.55 
 
 
839 aa  54.7  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  39.06 
 
 
67 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  39.06 
 
 
67 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3354  heavy metal transport/detoxification protein  46.03 
 
 
66 aa  53.9  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.702383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2471  Heavy metal transport/detoxification protein  48.33 
 
 
108 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0910  heavy metal transport/detoxification protein  46.15 
 
 
70 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0783  Heavy metal transport/detoxification protein  44.83 
 
 
69 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.591809  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0131  Heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 
67 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  38.71 
 
 
855 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1715  copper ion binding protein  41.94 
 
 
77 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0879446  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 
65 aa  52  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2514  heavy metal translocating P-type ATPase  47.69 
 
 
845 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.229137  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2344  heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 
100 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177246  normal  0.640868 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21360  copper chaperone  55.07 
 
 
72 aa  52.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.883325  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1695  Heavy metal transport/detoxification protein  52.94 
 
 
69 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.583772  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  41.54 
 
 
752 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  41.27 
 
 
67 aa  52.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  41.79 
 
 
814 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0115  Heavy metal transport/detoxification protein  44.44 
 
 
73 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6742  Heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
196 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.685267 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  40.32 
 
 
817 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  38.71 
 
 
833 aa  52  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3668  Heavy metal transport/detoxification protein  43.48 
 
 
74 aa  51.6  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0659  heavy metal-binding domain-containing protein  38.46 
 
 
65 aa  51.6  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4535  heavy metal translocating P-type ATPase  41.94 
 
 
734 aa  51.2  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1666  copper ion binding protein  36.51 
 
 
73 aa  51.6  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121778  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  41.67 
 
 
833 aa  51.6  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 
65 aa  50.8  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2464  heavy metal translocating P-type ATPase  42.62 
 
 
689 aa  51.2  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.301674  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2917  heavy metal translocating P-type ATPase  41.67 
 
 
832 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  39.34 
 
 
70 aa  51.2  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  42.62 
 
 
66 aa  50.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2168  copper-translocating P-type ATPase  41.67 
 
 
971 aa  50.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1741  Heavy metal transport/detoxification protein  40.91 
 
 
73 aa  50.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246039  decreased coverage  0.0020488 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0133  ATPase, P type cation/copper-transporter  39.06 
 
 
751 aa  50.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10093  cation transporter ATPase A ctpA  42.37 
 
 
761 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.73846 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  38.33 
 
 
68 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  38.33 
 
 
68 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 
835 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1291  Heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 
69 aa  50.1  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2690  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
832 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3704  hypothetical protein  45.9 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660005  normal  0.139636 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  36.51 
 
 
839 aa  49.7  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  36.36 
 
 
67 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4777  heavy metal translocating P-type ATPase  35.48 
 
 
1013 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  39.34 
 
 
68 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 
790 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  37.5 
 
 
68 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9003  hypothetical protein  50.77 
 
 
67 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.961553  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5366  heavy metal translocating P-type ATPase  35.59 
 
 
1021 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5494  heavy metal translocating P-type ATPase  35.59 
 
 
1021 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0117323  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  35.38 
 
 
852 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5304  heavy metal transport/detoxification protein  43.28 
 
 
80 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562582  normal  0.337627 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0654  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  36.67 
 
 
732 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  37.31 
 
 
79 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 
67 aa  49.3  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  41.27 
 
 
67 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  41.27 
 
 
67 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0422606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>