More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_10610 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  100 
 
 		 69 aa  138  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19780  copper chaperone  75 
 
 		 71 aa  103  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208404  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1450  heavy metal transport/detoxification protein  68.66 
 
 		 113 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1468  heavy metal transport/detoxification protein  68.66 
 
 		 70 aa  92  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0783  Heavy metal transport/detoxification protein  67.65 
 
 		 69 aa  90.9  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.591809  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4552  heavy metal transport/detoxification protein  66.18 
 
 		 70 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2847  heavy metal transport/detoxification protein  64.71 
 
 		 115 aa  84  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.179669 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0910  heavy metal transport/detoxification protein  64.71 
 
 		 70 aa  84.3  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4497  heavy metal transport/detoxification protein  59.7 
 
 		 69 aa  80.5  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.499051 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4020  Heavy metal transport/detoxification protein  60.87 
 
 		 76 aa  77.4  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.343869 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  53.73 
 
 		 68 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  62.5 
 
 		 69 aa  73.9  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0674  Heavy metal transport/detoxification protein  61.29 
 
 		 68 aa  73.6  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3354  heavy metal transport/detoxification protein  60.94 
 
 		 66 aa  71.2  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.702383 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  53.12 
 
 		 68 aa  70.1  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0467  Heavy metal transport/detoxification protein  57.97 
 
 		 70 aa  68.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2601  Heavy metal transport/detoxification protein  53.12 
 
 		 68 aa  68.2  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854669  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  57.81 
 
 		 70 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  53.12 
 
 		 68 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36750  copper chaperone  56.67 
 
 		 68 aa  65.1  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  53.23 
 
 		 69 aa  64.7  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  54.69 
 
 		 67 aa  64.3  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6797  Heavy metal transport/detoxification protein  52.24 
 
 		 70 aa  64.3  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  53.62 
 
 		 78 aa  63.9  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  47.76 
 
 		 77 aa  63.9  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  52.94 
 
 		 69 aa  63.5  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  49.28 
 
 		 69 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3668  Heavy metal transport/detoxification protein  54.29 
 
 		 74 aa  62  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1695  Heavy metal transport/detoxification protein  60.87 
 
 		 69 aa  61.6  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.583772  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2471  Heavy metal transport/detoxification protein  50.75 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0131  Heavy metal transport/detoxification protein  45.31 
 
 		 67 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  52.38 
 
 		 71 aa  60.5  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 76 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4548  Heavy metal transport/detoxification protein  50.91 
 
 		 70 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9003  hypothetical protein  63.04 
 
 		 67 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.961553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 69 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4448  heavy metal transport/detoxification protein  47.69 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0015  hypothetical protein  51.56 
 
 		 93 aa  57  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1741  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 73 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246039  decreased coverage  0.0020488 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0014  copper ion binding protein  53.85 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3169  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145614 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0420  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3704  hypothetical protein  51.67 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660005  normal  0.139636 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0090  heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2449  Heavy metal transport/detoxification protein  47.62 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228051  normal  0.0680079 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0141  Heavy metal transport/detoxification protein  48.48 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  43.55 
 
 		 67 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  43.55 
 
 		 67 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  44.44 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1492  heavy metal transport/detoxification protein  41.79 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  43.55 
 
 		 67 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4588  heavy metal transport/detoxification protein  43.75 
 
 		 73 aa  52.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  37.5 
 
 		 76 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2344  heavy metal transport/detoxification protein  37.88 
 
 		 100 aa  51.6  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177246  normal  0.640868 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4777  heavy metal translocating P-type ATPase  39.68 
 
 		 1013 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  36.92 
 
 		 835 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1752  Heavy metal transport/detoxification protein  46.67 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  44.62 
 
 		 835 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1572  heavy metal translocating P-type ATPase  45.16 
 
 		 856 aa  51.2  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1877  heavy metal transport/detoxification protein  36.36 
 
 		 67 aa  50.8  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.186242  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3726  copper ion binding protein  45.9 
 
 		 64 aa  50.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.663439  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5366  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 1021 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5494  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 1021 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0117323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  40.62 
 
 		 1182 aa  50.8  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0090  putative mercuric reductase  38.1 
 
 		 560 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0143  Heavy metal transport/detoxification protein  45.45 
 
 		 65 aa  50.4  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2045  Heavy metal transport/detoxification protein  42.19 
 
 		 68 aa  50.1  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0135722  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  43.08 
 
 		 833 aa  50.4  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2168  copper-translocating P-type ATPase  38.46 
 
 		 971 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5373  heavy metal translocating P-type ATPase  38.71 
 
 		 937 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  42.19 
 
 		 762 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0926  Heavy metal transport/detoxification protein  41.79 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  43.08 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  42.37 
 
 		 790 aa  48.9  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6127  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 74 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0154405  normal  0.535186 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3412  copper ion binding protein  40.3 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0277616 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  42.19 
 
 		 762 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0483  putative mercuric reductase  38.98 
 
 		 562 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  46.88 
 
 		 67 aa  49.7  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  42.19 
 
 		 762 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  37.5 
 
 		 817 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  42.19 
 
 		 767 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0162  copper-translocating P-type ATPase  39.06 
 
 		 1040 aa  48.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0489  heavy metal transport/detoxification protein  48.33 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1862  heavy metal-binding protein, putative  39.39 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  39.06 
 
 		 792 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0323  heavy metal transport/detoxification protein  41.27 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.228429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1538  Heavy metal transport/detoxification protein  39.39 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0133712 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21360  copper chaperone  48.61 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.883325  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0933  heavy metal transport/detoxification protein  37.29 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2902  mercuric transport protein periplasmic component  41.54 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2338  putative mercuric reductase  39.39 
 
 		 561 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6174  putative mercuric reductase  39.39 
 
 		 561 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00111286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6183  putative mercuric reductase  39.39 
 
 		 561 aa  47.8  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00236829  unclonable  0.0000000913433 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0104  putative mercuric reductase  39.39 
 
 		 561 aa  47.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.57639  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4827  heavy metal translocating P-type ATPase  38.33 
 
 		 946 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2139  heavy metal transport/detoxification protein  35.82 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2086  heavy metal transport/detoxification protein  37.5 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000331725  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  46.38 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1795  Heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>